UNC45A缺陷通过损害肌球蛋白VB依赖性顶端运输导致微绒毛包涵体病样表型

UNC45A deficiency causes microvillus inclusion disease-like phenotype by impairing myosin VB-dependent apical trafficking

作者信息Rémi Duclaux-Loras, Corinne Lebreton, Jérémy Berthelet, Fabienne Charbit-Henrion, Ophelie Nicolle, Céline Revenu des Courtils, Stephanie Waich, Taras Valovka, Anis Khiat, Marion Rabant, Caroline Racine, Ida Chiara Guerrera, Júlia Baptista, Maxime M Mahe, Michael W Hess, Béatrice Durel, Nathalie Lefort, Céline Banal, Mélanie Parisot, Cecile Talbotec, Florence Lacaille, Emmanuelle Ecochard-Dugelay, Arzu Meltem Demir, Georg F Vogel, Laurence Faivre, Astor Rodrigues, Darren Fowler, Andreas R Janecke, Thomas Müller, Lukas A Huber, Fernando Rodrigues-Lima, Frank M Ruemmele, Holm H Uhlig, Filippo Del Bene, Grégoire Michaux, Nadine Cerf-Bensussan, Marianna Parlato
PMID35575086
发布时间2022-05-16
DOI10.1172/JCI154997

实验完整度

研究包含患者遗传分析、细胞实验(Caco-2敲除、类器官)、蛋白质组学、斑马鱼体内模型等多层级验证,并明确功能验证和机制研究。

主要模型

Caco-2细胞系 患者来源iPSC分化的肠道类器官 unc45a缺陷斑马鱼幼虫 患者十二指肠活检组织

重点核对

UNC45A基因型与蛋白表达水平 MYO5B蛋白折叠状态及聚集 Rab11和顶端转运蛋白(NHE3、DRA)的定位 微绒毛形态与密度 UNC45A突变体的功能互补效果

摘要

UNC45A共伴侣蛋白的变异最近与一种结合腹泻、胆汁淤积、耳聋和骨脆弱的综合征相关。然而,UNC45A缺陷导致肠功能衰竭的机制仍不清楚。在此,通过下一代测序在6名先天性腹泻患者中鉴定出UNC45A的双等位基因变异。与计算机预测一致,变异要么消除了UNC45A的表达,要么改变了蛋白质构象。通过质谱分析,肌球蛋白VB被鉴定为UNC45A伴侣蛋白的客户蛋白,并在UNC45AKO Caco-2细胞中发现其错误折叠。与肌球蛋白VB功能受损一致,UNC45AKO Caco-2细胞表现出异常的上皮形态发生,这种形态发生可被全长UNC45A恢复,但不能被突变等位基因恢复。患者和UNC45AKO 3D类器官显示腔发育改变和微绒毛包涵体,而2D培养揭示Rab11和顶端转运蛋白的错误定位以及稀疏和紊乱的微绒毛。所有这些特征类似于在微绒毛包涵体病患者十二指肠活检中观察到的亚细胞异常。最后,在unc45a缺陷斑马鱼的肠细胞中证实了微绒毛包涵体和缩短的微绒毛。综上所述,我们的结果提供了证据,表明UNC45A通过其肌球蛋白VB的共伴侣蛋白功能在上皮形态发生中发挥重要作用,并且UNC45A缺失导致微绒毛包涵体病的一种变异型。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
UNC45A缺陷导致先天性腹泻的肠道病变机制是什么?
核心机制
UNC45A作为HSP90的共伴侣蛋白,促进肌球蛋白VB的正确折叠;UNC45A缺陷导致肌球蛋白VB错误折叠和聚集,损害其依赖的顶端运输,进而影响肠上皮细胞极性、分化和 lumen 形成,最终导致微绒毛包涵体病样表型。
主要证据
质谱鉴定MYO5B为UNC45A客户蛋白;UNC45AKO Caco-2细胞显示异常上皮形态发生;患者和UNC45AKO类器官显示腔发育异常和微绒毛包涵体;unc45a缺陷斑马鱼显示微绒毛缩短和微绒毛包涵体;患者十二指肠活检显示微绒毛包涵体和顶端转运蛋白错误定位。
研究意义
研究揭示UNC45A在塑造肠上皮细胞结构和极性中的核心作用,并表明UNC45A缺陷应被视为一种非经典形式的微绒毛包涵体病,为理解人类肠道屏障分化的机制提供了见解。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

患者遗传变异鉴定

鉴定先天性腹泻患者中UNC45A的致病性变异

对6名患者进行全外显子测序或靶向 panel 测序,发现UNC45A双等位基因变异,并通过Sanger测序确认家系共分离。

2

UNC45A变异的功能和结构影响分析

评估UNC45A变异对蛋白表达和结构的影响

在HEK293T细胞中过表达野生型和突变型UNC45A等位基因,通过Western blot检测蛋白表达;通过同源建模和计算机模拟预测变异对蛋白结构的影响。

3

UNC45A相互作用蛋白鉴定

鉴定UNC45A的客户蛋白,特别是肌球蛋白

通过免疫沉淀和质谱分析,鉴定与UNC45A相互作用的蛋白质,重点关注肌球蛋白家族。

4

UNC45A敲除细胞模型表型分析

评估UNC45A缺失对肠上皮细胞极性和分化的影响

通过CRISPR/Cas9敲除Caco-2细胞中的UNC45A,分析2D培养中的顶端刷状缘和3D培养中的 lumen 形成,并用野生型或突变型UNC45A进行回补实验。

5

类器官模型表型分析

在患者和基因敲除来源的肠道类器官中验证UNC45A缺陷的表型

从患者和对照的iPSC分化肠道类器官,或通过CRISPR/Cas9敲除UNC45A,分析3D类器官的形态、微绒毛包涵体,以及2D培养中 Rab11 和顶端转运蛋白的定位。

6

动物模型体内表型分析

在斑马鱼模型中验证UNC45A缺陷的体内表型

分析unc45a突变斑马鱼幼虫的肠道形态,包括肠上皮皱褶、微绒毛、Rab11定位和微绒毛包涵体。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
DMEM培养基Gibco--
胎牛血清Gibco--
基质胶BD Biosciences--
MG-132蛋白酶体抑制剂Sigma-Aldrich--
μMACS c-myc分离试剂盒Miltenyi Biotec--
鬼笔环肽-Alexa Fluor 488InvitrogenA12379
鬼笔环肽-Alexa Fluor 647InvitrogenA22287
NucBlue固定细胞染色试剂InvitrogenR37606
ProteoStat聚集体检测试剂盒Enzo Life SciencesENZ-51038
UNC45A抗体Santa Cruz Biotechnologysc-101493
Villin抗体Santa Cruz Biotechnologysc-58897
DRA抗体Abcamab83545
Rab11抗体Invitrogen71-5300
NHE3抗体Novus BiologicalsNBP-82574
MYO5B抗体Sigma-AldrichHPA069773
EpCAM抗体R&D SystemsAF960
CFTR抗体Abcamab59394
Na/K-ATPase抗体Thermo Fisher ScientificMA5-32184
整合素-α2抗体Abcamab181548
E-钙粘蛋白抗体Thermo Fisher Scientific13-700445
鬼笔环肽-ATTO 550Invitrogen--
Actin抗体Cell Signaling Technology5125
FLAG抗体Sigma-AldrichF3165
GAPDH抗体Cell Signaling Technology14C10
HSP90抗体Cell Signaling Technology4874
UNC45A抗体Abcam171328
MYO5B抗体Thermo Fisher ScientificPA5-49519
mTeSR1培养基Stem Cell Technologies--
hESC基质胶Corning356231
温和细胞解离试剂Stem Cell Technologies07174
STEMdiff definive内胚层基础培养基Stem Cell Technologies05111
STEMdiff definive内胚层补充剂CJStem Cell Technologies05113
STEMdiff胃肠补充剂PKStem Cell Technologies05141
STEMdiff胃肠补充剂UBStem Cell Technologies05142
STEMdiff肠道类器官基础培养基Stem Cell Technologies05111
STEMdiff肠道类器官补充剂Stem Cell Technologies05144
TrypLE Express酶Gibco12605010
IntestiCult类器官生长培养基Stem Cell Technologies--
Y-27632抑制剂Stem Cell Technologies--
Tissue-Tek OCT包埋剂Sakura--
Epon-Araldite包埋剂Electron Microscopy Sciences--
Gene Frame胶框Thermo Fisher Scientific11560294
Formvar包被的狭缝载网EMSFCF2010-CU

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
患者遗传分析
患者队列的临床特征和UNC45A变异类型
阅读提示:Methods - Patients 和 Figure 1
细胞实验
UNC45A敲除Caco-2细胞的构建方法,包括sgRNA序列、转导和筛选条件
阅读提示:Methods - Generation of UNC45A-deficient Caco-2 cells and complementation
类器官实验
iPSC分化肠道类器官的方案,包括培养基和培养时间
阅读提示:Methods - Intestinal organoid generation
斑马鱼实验
unc45a突变斑马鱼的饲养和突变等位基因
阅读提示:Methods - Immunofluorescence and labeling of zebrafish sections
蛋白互作分析
免疫沉淀和质谱分析的具体条件,包括裂解缓冲液和抗体
阅读提示:Methods - Western blot, immunoprecipitation, and proteomic studies