评估JQ1对细胞生长、形态和侵袭的影响
确定JQ1是否抑制细胞增殖并改变细胞形态和侵袭能力。
使用LNCaP、22Rv1、C4-2等细胞,通过细胞增殖实验、显微镜观察细胞形态和Transwell侵袭实验评估JQ1处理后的变化。
Small molecule JQ1 promotes prostate cancer invasion via BET-independent inactivation of FOXA1
研究包含体外细胞模型(LNCaP、22Rv1、C4-2等)、体内动物模型(尾静脉注射及转基因小鼠模型)、转录组及GSEA分析、机制验证(CETSA、pull-down、IP、ChIP)等多个独立证据层级。
前列腺癌细胞系(LNCaP、22Rv1、C4-2、LNCaP-abl) SCID小鼠尾静脉注射转移模型 Pb-Cre Ptenfl/fl转基因前列腺癌小鼠模型
JQ1处理浓度:200 nM用于体外功能实验,体内给药剂量为10 mg/kg(每日腹腔注射) 细胞系类型与来源:LNCaP、22Rv1、C4-2、PC3、293T及LNCaP-abl细胞系 关键试剂:JQ1、I-BET762、OTX015、I-BET151、LDN-212854等 siRNA介导的基因敲低:针对BET蛋白、AR及FOXA1等的siRNA转染 统计方法:两组比较采用Student's t检验,多组比较采用单因素或双因素方差分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定JQ1是否抑制细胞增殖并改变细胞形态和侵袭能力。
使用LNCaP、22Rv1、C4-2等细胞,通过细胞增殖实验、显微镜观察细胞形态和Transwell侵袭实验评估JQ1处理后的变化。
在体内环境中确认JQ1是否促进前列腺癌细胞的转移。
使用尾静脉注射22Rv1-Luc细胞和Luc标记的C4-2细胞的SCID小鼠模型以及Pb-Cre Ptenfl/fl转基因小鼠模型,通过生物发光成像、AR免疫组化检测转移情况。
识别JQ1处理后激活的与侵袭相关的信号通路。
对JQ1处理的LNCaP细胞进行RNA-Seq,并通过GSEA分析富集的通路,如TGF-β家族信号、EMT、趋化因子信号、黏着斑等。
证实JQ1激活的BMP信号有助于其促进侵袭的作用。
通过使用BMP信号抑制剂LDN-212854或siRNA敲低BMP受体(ALK1, ALK2, ALK3),检测JQ1诱导的SMAD1/5磷酸化、靶基因表达及细胞侵袭能力的变化。
确定FOXA1是否介导JQ1对侵袭基因的激活作用和促侵袭效应。
结合转录因子结合位点预测和GSEA分析,锁定FOXA1,并通过siRNA敲低FOXA1验证其对JQ1诱导的侵袭基因表达和细胞侵袭的调节作用。
揭示JQ1抑制FOXA1活性的分子机制。
通过CETSA、生物素化JQ1 pull-down实验验证JQ1与FOXA1的直接结合,并通过IP和ChIP-qPCR分析JQ1处理后FOXA1与其共抑制因子(TLE3, HDAC7, NFIC)的结合变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Thermo Fisher Scientific | 11875093 |
| 胎牛血清 | Sigma-Aldrich | F2442 | |
| 活性炭剥离胎牛血清 | Sigma-Aldrich | F6765 | |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | 11668019 |
| siRNA转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | 13778075 |
| 药物处理 | (-)-JQ1 | Cayman Chemical | 1268524-71-5 |
| JQ1 | Sigma-Aldrich | SML0974 | |
| I-BET762 | Sigma-Aldrich | SML1272 | |
| OTX015 | Cayman Chemical | 202590-98-5 | |
| I-BET151 | Sigma-Aldrich | SML0666 | |
| LDN-212854 | Sigma-Aldrich | SML0965 | |
| 细胞增殖检测 | CellTiter-Glo试剂盒 | Promega | G9241 |
| CellTiter 96 AQueous One Solution细胞增殖检测试剂盒 | Promega | G3582 | |
| Multiskan FC酶标仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Transwell侵袭实验 | Matrigel基质胶 | BD Biosciences | 354483 |
| 黏着斑检测 | 桩蛋白抗体 | Abcam | ab32084 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | 15596018 |
| cDNA合成 | Maxima第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | FERK1641 |
| qPCR | FastStart Universal SYBR Green预混液 | Roche | 4913850001 |
| StepOnePlus实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| Western blot | BCA蛋白浓度测定试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23228 |
| 硝酸纤维素膜 | Bio-Rad | 1620112 | |
| 辣根过氧化物酶标记的二抗 | Cell Signaling Technology | 7074 or 7076 | |
| SuperSignal West Dura底物 | Thermo Fisher Scientific | 34075 | |
| FOXA1抗体 | Abcam | ab23738 | |
| GAPDH抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-25778 HRP | |
| c-Myc抗体 | Cell Signaling Technology | 5605 | |
| SMAD1抗体 | Cell Signaling Technology | 6944 | |
| SMAD5抗体 | Cell Signaling Technology | 9517 | |
| p-SMAD1/5抗体 | Cell Signaling Technology | 9516 | |
| p-AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| TLE3抗体 | Proteintech | 11372-1-AP | |
| HDAC7抗体 | Bethyl | A301-384A-T | |
| NFIC抗体 | Bethyl | A303-123A-T | |
| 荧光素酶抗体 | Abcam | ab21176 | |
| AR抗体 | Cell Signaling Technology | 5153 | |
| Pull-down实验 | JQ1-PA | Tocris | 6589 |
| 生物素-叠氮化物 | Sigma-Aldrich | 762024 | |
| (+)-抗坏血酸钠 | Sigma-Aldrich | 11140 | |
| 链霉亲和素偶联磁珠 | Thermo Fisher Scientific | 65601 | |
| 纯化FOXA1蛋白 | Abcam | ab98301 | |
| 免疫共沉淀 | 蛋白G磁珠 | Thermo Fisher Scientific | 10003D |
| FOXA1抗体 | Bethyl | A305-249A | |
| 动物实验 | SCID小鼠 | The Jackson Laboratory | 001303 |
| pCDH-CMV-Luc2-T2A-tGFP-EF1-hygro慢病毒载体 | -- | -- | |
| 荧光素 | Gold Biotechnology | LUCK-1G | |
| 免疫组织化学 | AR抗体 | Abcam | ab133273 |
| 二抗 | Jackson ImmunoResearch | 711-066-152 | |
| ChIP-qPCR | Magna ChIP A/G试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- |
| HDAC7抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-29937 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 细胞系来源、培养基类型、JQ1处理浓度(200 nM)及处理时间(72小时) 阅读提示:Methods: Cell lines, culturing conditions, and transfection; Results: JQ1 promotes prostate cancer cell invasion |
| 细胞侵袭实验 | 细胞接种数量、基质胶预包被、血清浓度、JQ1浓度及侵袭时间 阅读提示:Methods: Transwell invasion assay; Figure 1 legend |
| 体内转移实验 | 小鼠品系(SCID或Pb-Cre Ptenfl/fl)、细胞注射数量与途径、JQ1给药剂量(10 mg/kg)与时间(7周) 阅读提示:Methods: Mouse metastasis assay; Figure 1, E–H legend |
| 转录组分析 | 细胞系(LNCaP)、JQ1浓度(200 nM)及处理时间(72小时) 阅读提示:Methods: RNA-Seq and GSEA analysis; Results: JQ1 activates invasion pathways |
| 机制验证实验 | CETSA中JQ1浓度(10 μM)及处理时间(1小时);IP中JQ1浓度(10 μM)及处理时间(8小时);pull-down实验中的生物素化JQ1制备 阅读提示:Methods: CETSA; Pull-down assay; IP |