临床样本分析
评估CDCP1在前列腺癌中的表达水平及其与PTEN缺失的相关性
利用两个包含990例样本的组织芯片进行IHC染色,分析CDCP1表达,并通过FISH或IHC检测PTEN状态,进行生存分析。
CDCP1 overexpression drives prostate cancer progression and can be targeted in vivo
包含人类肿瘤组织芯片、转基因小鼠、果蝇模型、细胞实验、异种移植模型等多层级验证,并进行了机制和功能验证。
CDCP1转基因小鼠(CDCP1+) CDCP1/Pten双突变小鼠(CDCP1Ptenpc–/–) 果蝇(Drosophila melanogaster) LNCaP细胞系 PC3细胞系
CDCP1在CRPC和转移性前列腺癌中的表达水平:通过IHC评估990例TMA样本 CDCP1与PTEN缺失的关联:通过IHC、FISH及生物信息学分析 CDCP1过表达对前列腺肿瘤发生的影响:通过转基因小鼠模型观察肿瘤发生率和病理分级 CDCP1与Pten缺失协同促进转移:通过双突变小鼠的转移灶分析 雄激素剥夺对CDCP1表达的影响:通过LNCaP细胞在FAD条件下的培养和DHT刺激实验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估CDCP1在前列腺癌中的表达水平及其与PTEN缺失的相关性
利用两个包含990例样本的组织芯片进行IHC染色,分析CDCP1表达,并通过FISH或IHC检测PTEN状态,进行生存分析。
验证CDCP1过表达能否启动前列腺肿瘤发生
构建前列腺特异性CDCP1过表达转基因小鼠(CDCP1+),观察肿瘤发生发展。
验证CDCP1过表达是否诱导肿瘤样表型及其SRC依赖性
在果蝇中过表达人CDCP1-WT或CDCP1-delta,观察额外刚毛形成,并通过降低src42A/src64B表达验证SRC依赖性。
验证CDCP1与PTEN缺失是否协同促进前列腺癌进展和转移
将CDCP1小鼠与Ptenpc–/–小鼠杂交,观察双突变小鼠的肿瘤进展、转移和生存。
阐明CDCP1过表达绕过衰老屏障的分子机制
利用MEFs,检测衰老、增殖、相关蛋白表达,并抑制SRC或c-Myc验证机制。
验证雄激素受体(AR)是否调控CDCP1表达
在LNCaP细胞中,通过FAD培养和DHT刺激,检测CDCP1表达变化,并利用ChIP-qPCR验证AR与CDCP1启动子的结合。
验证CDCP1靶向治疗联合ADT抑制前列腺癌生长的效果
在体外用抗CDCP1抗体或免疫脂质体处理细胞,在体内用LNCaP异种移植模型评价治疗效果。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| RPMI 1640培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 药物处理 | 二氢睾酮 | MilliporeSigma | 521-18-6 |
| 恩杂鲁胺 | APExBIO | A3003 | |
| 萨拉卡替尼 | -- | -- | |
| 阿霉素 | -- | -- | |
| 免疫印迹 | RIPA裂解液 | Cell Signaling Technology | 9806 |
| 蛋白定量 | Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23225 |
| RNA提取 | TRIzol Plus RNA纯化试剂盒 | Life Technologies | 12183555 |
| RT-qPCR | SuperScript III Platinum一步法qRT-PCR试剂盒 | Life Technologies | 11732-020 |
| ChIP | γ-bind Plus琼脂糖珠 | GE Healthcare | 17-0886-01 |
| QIAquick PCR纯化试剂盒 | Qiagen | 28104 | |
| KAPA SYBR FAST ABI qPCR预混液 | KAPA Biosystems | 07959389001 | |
| 衰老检测 | 衰老β-半乳糖苷酶染色试剂盒 | Cell Signaling Technology | 9860 |
| 细胞染色 | Hoechst 33342 | Invitrogen | -- |
| 脂质体制备 | 氢化大豆磷脂 | -- | -- |
| 胆固醇 | -- | -- | |
| PD-10脱盐柱 | -- | -- | |
| Sepharose CL-4B柱 | -- | -- | |
| 胃蛋白酶 | -- | -- | |
| 半胱胺 | -- | -- | |
| 果蝇实验 | Q5高保真聚合酶 | New England Biolabs | M0491S |
| Zero Blunt TOPO PCR克隆试剂盒 | Life Technologies | K2800-20 | |
| 抗体 | Tag-Myc抗体 | BD Pharmingen | 551101 |
| PTEN抗体 | Cell Signaling Technology | 9552S | |
| HSP90抗体 | Cell Signaling Technology | 4877S | |
| c-Myc抗体 | Santa Cruz Biotechnology | A713(G-4) | |
| p21抗体 | Abcam | ab107099 | |
| β-actin抗体 | MilliporeSigma | A5316 | |
| Cyclin D1抗体 | Cell Signaling Technology | 2978S | |
| COUP-TFII抗体 | Perseus Proteomics | PP-H7147-00 | |
| SMAD4抗体 | Santa Cruz Biotechnology | E0615 | |
| p-SRC-Tyr416抗体 | Cell Signaling Technology | 6943S | |
| SRC抗体 | Cell Signaling Technology | 2123S | |
| AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 9272S | |
| p-AKT-S473抗体 | Cell Signaling Technology | 9171S | |
| p53抗体 | Abcam | ab131442 | |
| CDCP1抗体 | Cell Signaling Technology | 4115 | |
| Erk1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4695S | |
| p-Erk1/2-T202/Y204抗体 | Cell Signaling Technology | 4370S | |
| S6抗体 | Cell Signaling Technology | 2317S | |
| p-S6-Ser235/236抗体 | Cell Signaling Technology | 4857 | |
| AR (N-20)抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-816 | |
| Ki-67抗体 | Thermo Fisher Scientific | RM-9106-R7 | |
| p-HP1γ-Ser83抗体 | Cell Signaling Technology | 2600 | |
| 广谱细胞角蛋白抗体 | DAKO | Z0622 | |
| E-cadherin抗体 | BD Biosciences | 610181 | |
| CK5抗体 | Abcam | ab52635 | |
| CK8抗体 | Abcam | ab59400 | |
| 转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | 13778-030 |
| siRNA | c-Myc siRNA | MilliporeSigma | 8024873724-000050 |
| 阴性对照siRNA | MilliporeSigma | 8024873724-000060 | |
| 免疫荧光 | Vectashield封片剂 | Vector Laboratories | -- |
| Alexa Fluor 568偶联抗兔抗体 | Molecular Probes | -- | |
| Alexa Fluor 488偶联抗大鼠抗体 | Molecular Probes | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| IHC分析 | 组织芯片来源和样本数量 阅读提示:Methods部分:CDCP1 protein expression in human prostate cancer |
| 小鼠模型 | 小鼠品系、基因型、年龄 阅读提示:Methods部分:Acquisition of MEFs, Study approval |
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养条件 阅读提示:Methods部分:Cell culture and reagents |
| 药物处理 | 药物浓度、处理时间 阅读提示:Methods部分:Cell culture and reagents |
| 脂质体制备 | 脂质成分比例、粒径 阅读提示:Methods部分:Liposomes formulation |