鉴定抗PD-1治疗诱导的PMN-MDSC募集
确认抗PD-1治疗后肿瘤内PMN-MDSC的积累及其与免疫治疗耐药的相关性。
使用自发性BRAFV600E PTEN–/–黑色素瘤模型,经抗PD-1抗体或IgG同型对照治疗后,通过RNA-Seq、qRT-PCR、Gr-1 IHC和多参数流式细胞术检测PMN-MDSC浸润及CXCR2配体表达。
A tumor-intrinsic PD-L1/NLRP3 inflammasome signaling pathway drives resistance to anti-PD-1 immunotherapy
包含体外细胞实验、自发性小鼠肿瘤模型、同系移植瘤模型、人黑色素瘤细胞系及临床标本等多个独立证据层级,并包含功能验证(基因沉默、药理学抑制)和机制验证(信号通路分析)。
BRAFV600E PTEN–/– 自发性黑色素瘤小鼠模型 BRAFV600E PTEN–/– 黑色素瘤细胞系 Lewis 肺癌(LLC)细胞系 WM266 人黑色素瘤细胞系
PMN-MDSC定义:live+CD45+CD11b+Ly6G+Ly6CintF4/80– 抗PD-1抗体(200 μg,i.p.,每3天一次)和IgG同型对照处理 NLRP3抑制剂MCC950剂量(10 mg/kg i.p.,每隔一天,体内;2.5-10 μM,体外) CXCR2抑制剂AZD5069剂量(100 mg/kg p.o.,每天两次)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认抗PD-1治疗后肿瘤内PMN-MDSC的积累及其与免疫治疗耐药的相关性。
使用自发性BRAFV600E PTEN–/–黑色素瘤模型,经抗PD-1抗体或IgG同型对照治疗后,通过RNA-Seq、qRT-PCR、Gr-1 IHC和多参数流式细胞术检测PMN-MDSC浸润及CXCR2配体表达。
确定Wnt5a是否通过上调CXCR2配体介导PMN-MDSC募集。
通过TCGA数据分析WNT5A与CXCL2/CXCL5/CXCR2的相关性;Western blot检测Wnt5a、YAP、CXCL5表达;体外用重组Wnt5a处理黑色素瘤细胞系;体内用Wnt5a敲低的肿瘤模型观察PMN-MDSC浸润和肿瘤生长。
探究抗PD-1治疗后Wnt5a上调的上游机制。
通过LC-MS/MS分泌组学分析鉴定HSP70释放;ELISA检测血浆HSP70;qRT-PCR检测TLR表达;体外用重组HSP70处理肿瘤细胞,并用TLR4抑制剂或基因沉默验证其依赖性。
验证CD8+ T细胞激活是否依赖NLRP3炎症小体诱导HSP70释放。
将OT-1 CD8+ T细胞与表达OVA的BRAFV600E PTEN–/–黑色素瘤细胞共培养,检测HSP70分泌和Wnt5a表达;使用NLRP3抑制剂或基因沉默验证;并检测ATP刺激下的HSP70释放。
确定PD-L1如何激活NLRP3炎症小体。
用IFN-γ和抗PD-L1抗体处理肿瘤细胞,检测caspase-1 cleavage、ASC聚合、PKR磷酸化及STAT3水平;通过基因沉默PD-L1或STAT3组成性激活验证信号通路。
验证抑制NLRP3是否可以增强抗PD-1免疫治疗的效果。
在自发性黑色素瘤模型中,使用NLRP3基因敲低或MCC950抑制剂与抗PD-1抗体联合治疗,检测肿瘤生长、免疫细胞浸润及信号通路蛋白表达。
确认该信号通路在人类黑色素瘤中是否存在。
用WM266人黑色素瘤细胞系进行体外实验;分析TCGA-SKCM数据库中的基因表达相关性;对接受抗PD-1治疗的患者肿瘤和血浆样本进行RNA-Seq和ELISA分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Invitrogen, Thermo Fisher Scientific | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| L-谷氨酰胺 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 细胞处理 | 重组Wnt5a | R&D Systems, Bio-Techne | 645-WN-010 |
| 干扰素-γ | BioAbChem | 42-IFNg | |
| 抗PD-L1抗体 | Bio X Cell | BE0101 | |
| 热休克蛋白70 | Enzo | ADI-ESP-502-D | |
| HSP70抑制剂(VER155008) | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| CLI-095(TLR4抑制剂) | Invivogen | tlrl-cli95 | |
| MCC950(NLRP3抑制剂) | Invivogen | inh-mcc | |
| 三磷酸腺苷 | Invivogen | tlrl-atpl | |
| 维替泊芬(YAP抑制剂) | R&D Systems, Bio-Techne | 530510 | |
| XAV939(β-连环蛋白抑制剂) | MilliporeSigma | X3004-5MG | |
| 2-氨基嘌呤(PKR抑制剂) | Invivogen | tlrl-apr | |
| 达卡巴嗪 | MilliporeSigma | D2390 | |
| 抗体 | 抗β-肌动蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-47778 |
| 抗NLRP3抗体 | Cell Signaling Technology | 15101S | |
| 抗ASC抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-514414 | |
| 抗caspase-1 p20抗体 | Adipogen | AG-20B-0042-C100 | |
| 抗HSP70抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-66048 | |
| 抗CXCL5抗体 | R&D Systems | AF433 | |
| 抗YAP/TAZ抗体 | Cell Signaling Technology | 8418S | |
| 抗Wnt5a抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-365370 | |
| 抗GAPDH抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-32233 | |
| 抗PKR抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-6282 | |
| 抗磷酸化PKR (Thr446)抗体 | Abcam | ab32036 | |
| 抗STAT3抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-8019 | |
| 抗磷酸化STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | 9131 | |
| 抗纽蛋白抗体 | Invitrogen, Pierce, Thermo Fisher Scientific | 700062 | |
| 抗小鼠CD8a抗体 | Bio X Cell | BE0004-1 | |
| InVivoMAb抗小鼠PD-1抗体 | Bio X Cell | BE0146 | |
| 试剂盒 | RNeasy Plus微型试剂盒 | QIAGEN | 74134 |
| RT-qPCR | iScript逆转录预混液 | Bio-Rad | 1708841 |
| SsoAdvanced通用SYBR Green预混液 | Bio-Rad | 1725271 | |
| SsoAdvanced通用探针预混液 | Bio-Rad | 1725281 | |
| ELISA | 小鼠CXCL5 ELISA试剂盒 | R&D Systems | -- |
| 小鼠HSP70 ELISA试剂盒 | R&D Systems | DYC1663-2 | |
| 人HSP70 DuoSet检测试剂盒 | R&D Systems | DY1663 | |
| 小鼠IL-1β ELISA试剂盒 | BioLegend | 432601 | |
| 流式细胞术 | CellTrace紫 | Thermo Fisher Scientific | C34571 |
| 抗小鼠CD11b抗体(PE) | BD Pharmingen | 558091 | |
| 抗小鼠Ly6G抗体(FITC) | BD Pharmingen | 553127 | |
| 抗小鼠F4/80抗体(APC) | BD Pharmingen | 560408 | |
| 抗小鼠Ly6C抗体(PE-Cy7) | BD Pharmingen | 560593 | |
| 抗小鼠CD45抗体(PerCP-Cy5.5) | BD Pharmingen | 551163 | |
| 抗小鼠CD8a抗体(BV510) | BD Pharmingen | 563068 | |
| 抗人CD33抗体(BV510) | BD Pharmingen | 563257 | |
| FACSCanto II流式细胞仪 | BD | -- | |
| LSR II流式细胞仪 | BD | -- | |
| Western blot | PVDF膜 | Bio-Rad | -- |
| 化学发光底物 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| ChemiDoc XRSplus成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 免疫沉淀 | DSS(双琥珀酰亚胺辛二酸酯) | Thermo Fisher Scientific | 21655 |
| RNA-seq | Illumina HiSeq 4000测序仪 | Illumina | -- |
| 动物实验 | AZD5069(CXCR2抑制剂) | AstraZeneca | -- |
| 4-羟基他莫昔芬 | MilliporeSigma | H6278 | |
| 细胞分离 | gentleMACS组织解离器 | Miltenyi Biotec | -- |
| IV型胶原酶 | MilliporeSigma | -- | |
| 透明质酸酶 | MilliporeSigma | -- | |
| 脱氧核糖核酸酶 | MilliporeSigma | -- | |
| 红细胞裂解液 | MilliporeSigma | -- | |
| CD8磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-104-075 | |
| 细胞处理 | SIINFEKL肽 | New England Peptide | BP10-915 |
| 白细胞介素-2 | -- | -- | |
| 嘌呤霉素 | MilliporeSigma | P8833 | |
| G418 | -- | -- | |
| 重组IL-1β | BioLegend | 575102 | |
| 脂多糖 | MilliporeSigma | L4391 | |
| MPLA(TLR4激动剂) | Enzo | ALX-581-205-C100 | |
| 细胞转染 | shRNA慢病毒载体 | MilliporeSigma | -- |
| pMD2.G包膜载体 | -- | -- | |
| psPAX2包装载体 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 抗PD-1治疗模型 | 肿瘤模型类型(自发性或移植瘤)、药物剂量、给药途径、给药频率、治疗时间点 阅读提示:Methods: In vivo animal studies; Autochthonous tumor studies; Syngeneic transplant tumor studies |
| PMN-MDSC检测 | 组织消化方法、抗体克隆、荧光标记、流式细胞术门控策略、细胞计数方法 阅读提示:Methods: Murine cell isolation; Flow cytometric analysis |
| 细胞共培养 | OT-1 CD8+ T细胞激活条件(IL-2浓度、SIINFEKL浓度、培养时间)、共培养比例、处理时间 阅读提示:Methods: In vitro tumor-killing assays |
| NLRP3抑制 | MCC950浓度、给药方式(体内i.p.或体外处理)、作用时间 阅读提示:Methods: Cell lines and culture conditions; Autochthonous tumor studies |
| 基因沉默 | shRNA序列、载体、筛选方法(如嘌呤霉素浓度)、沉默效率验证 阅读提示:Methods: Cell lines and culture conditions |