化学遗传学筛选
系统性筛选不同神经元亚群对肠道免疫细胞的影响
利用AAV.PhP.S-hSyn-DIO-hM3Dq-mCherry病毒和8种Cre转基因小鼠,在新生小鼠体内表达DREADD,成年后通过CNO激活特定神经元,进行免疫表型分析。
A chemogenetic screen reveals that Trpv1-expressing neurons control regulatory T cells in the gut
包括化学遗传学激活八种神经元进行体内筛选、深度免疫表型分析、微生物组分析和单细胞转录组学,并通过基因敲除、药理学和神经解剖学方法进行功能验证和机制验证。
小鼠(C57BL/6J及多种Cre转基因系) 背根神经节(DRG)Trpv1+神经元 肠道免疫细胞(包括RORγ+ Treg细胞)
Cre转基因小鼠品系(8种)及CNO给药方案 AAV.PhP.S-hSyn-DIO-hM3Dq-mCherry病毒载体 Trpv1+神经元消融(RTX)及CGRP-Ramp1轴阻断 DSS诱导结肠炎和柠檬酸杆菌感染模型
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
系统性筛选不同神经元亚群对肠道免疫细胞的影响
利用AAV.PhP.S-hSyn-DIO-hM3Dq-mCherry病毒和8种Cre转基因小鼠,在新生小鼠体内表达DREADD,成年后通过CNO激活特定神经元,进行免疫表型分析。
评估神经元激活对肠道免疫细胞和微生物组的影响
通过流式细胞术分析肠道各段免疫细胞,通过16S rDNA测序分析肠道菌群组成。
确定Trpv1+神经元调节肠道Treg细胞的解剖位置和分子机制
通过基因敲除(Tac1-/-,Calca-/-)、药理阻断(BIBN4096)、Treg特异性Ramp1敲除和DRG/NG特异性注射病毒,验证DRG Trpv1+神经元通过CGRP-Ramp1轴调控RORγ+ Treg细胞。
验证Trpv1+神经元激活导致的Treg减少是否影响肠道炎症
使用DSS诱导结肠炎和柠檬酸杆菌感染模型,评估疾病严重程度。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞分离 | 胶原酶VIII | Sigma | -- |
| 脱氧核糖核酸酶I | Sigma | -- | |
| 胶原酶II | Gibco | -- | |
| 分散酶 | Gibco | -- | |
| 流式细胞术 | zombie活/死染料 | BioLegend | -- |
| eBioscience固定/破膜缓冲液 | eBioscience | -- | |
| eBioscience破膜缓冲液 | eBioscience | -- | |
| 化学遗传学激活 | 氯氮平-N-氧化物 | Tocris | 4936 |
| 神经元消融 | 树脂毒素 | Alamone labs | R-400 |
| 药理拮抗 | BIBN4096 | Torcis | 4561 |
| DSS结肠炎 | 硫酸葡聚糖钠盐 | Thermo Scientific | -- |
| 细菌感染 | 柠檬酸杆菌DBS100菌株 | ATCC | 51459 |
| 16S测序 | QIAquick PCR纯化试剂盒 | Qiagen | -- |
| Qubit dsDNA HS检测 | Thermo Fisher | -- | |
| 单细胞测序 | 10X Chromium仪器 | 10X Genomics | -- |
| Chromium单细胞3'试剂盒v2 | 10X Genomics | -- | |
| 显微镜检查 | Ti2转盘共聚焦显微镜 | Nikon | -- |
| Stellaris 8 FALCON CFS系统 | Leica | -- | |
| 流式细胞术 | Symphony流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 光转换 | 405nm蓝紫色激光器 | -- | -- |
| ZIBRA光纤内窥镜 | ZIBRA Corporation | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 化学遗传学激活 | 病毒类型、剂量、注射途径、注射年龄;CNO浓度、给药频率和持续时间 阅读提示:Materials and Methods: Systemic and targeted viral DREADD expression and chemogenetic activation |
| 免疫表型分析 | 抗体克隆、染色方案、流式细胞仪设置;肠道组织处理(酶消化、红细胞裂解等) 阅读提示:Materials and Methods: Flow cytometry |
| DRG/NG靶向 | 病毒注射部位(颈静脉节或鞘内)、病毒体积和滴度、注射后恢复时间 阅读提示:Materials and Methods: Systemic and targeted viral DREADD expression and chemogenetic activation |
| RTX消融 | RTX剂量、注射途径、注射天数、车辆对照 阅读提示:Materials and Methods: Trpv1+ DRG neuron ablation |
| DSS结肠炎 | DSS浓度、给予方式(饮水中)、持续时间、监测指标(体重、组织学评分) 阅读提示:Materials and Methods: DSS induced colitis |
| C. rodentium感染 | 菌株、感染剂量、感染途径、监测时间点、组织细菌载量测定方法 阅读提示:Materials and Methods: Citrobacter rodentium infection |