建立PS-NP暴露的AD小鼠模型
评估PS-NP暴露对AD小鼠认知功能的影响
对2月龄雄性APP/PS1小鼠进行90天灌胃PS-NPs(0.25或25 mg/kg体重)或纯水,随后进行行为学测试和组织学分析。
Nanoplastics trigger glial-neuronal collagen signaling miscommunication to exacerbate cognitive impairment in Alzheimer's disease
包含体内动物模型(APP/PS1小鼠)、体外三培养细胞模型、细胞类型分辨蛋白质组学、单核转录组分析及功能验证(siRNA、药理抑制),多层次验证机制。
APP/PS1小鼠(C57BL/6J背景) 星形胶质细胞-小胶质细胞-神经元三培养体系(SVG p12、HMC3、RA-SH-SY5Y) 人类AD脑组织单核转录组数据(GSE188545)
PS-NPs剂量:0.25、25 mg/kg体重,灌胃90天 TC-I 15给药剂量:10 µg/只,隔日腹腔注射 三培养体系中PS-NPs浓度:0、2、10、50 µg/mL处理48小时 si-COL1A1转染浓度:30 nM 动物性别和月龄:雄性APP/PS1小鼠,2月龄
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估PS-NP暴露对AD小鼠认知功能的影响
对2月龄雄性APP/PS1小鼠进行90天灌胃PS-NPs(0.25或25 mg/kg体重)或纯水,随后进行行为学测试和组织学分析。
鉴定PS-NP暴露后海马各细胞类型间的通讯变化
分离海马星形胶质细胞、小胶质细胞、神经元和少突胶质细胞,进行无标记定量蛋白质组学分析,利用CellChat分析细胞间通讯网络。
验证PS-NPs是否通过胶原-整合素轴增强细胞间通讯
建立星形胶质细胞(SVG p12)、小胶质细胞(HMC3)和神经元(RA-SH-SY5Y)的三培养系统,PS-NP处理后检测COL1A1/COL1A2与整合素的结合、小胶质细胞极化、Aβ水平、p38 MAPK活化和神经元死亡。
验证阻断胶原信号是否能逆转PS-NP诱导的神经毒性
在三培养系统中通过siRNA敲低COL1A1或使用TC-I 15抑制整合素,检测下游效应;并在体内对PS-NP暴露的APP/PS1小鼠给予TC-I 15治疗。
验证胶原信号通路在人类AD中的保守性
分析人类AD患者和健康对照的snRNA-seq数据(GSE188545),比较细胞间通讯和胶原信号通路活性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 聚苯乙烯纳米塑料 | Magsphere Inc. | PS050NM |
| 荧光聚苯乙烯纳米塑料 | Magsphere Inc. | PSYF050NM | |
| 药理干预 | TC-I 15 | MedChemExpress | 916734-43-5 |
| 动物灌注与固定 | 磷酸盐缓冲液 | Servicebio | G0002 |
| 行为测试 | Y迷宫装置 | -- | -- |
| 旷场箱 | Flyde | -- | |
| MRI | Bruker 7T磁共振成像仪 | Bruker | -- |
| 小鼠头部低温线圈 | Bruker | -- | |
| ParaVision 360 | Bruker | -- | |
| 行为测试 | 迷宫视频追踪系统 | Chucai Electronic Technology Co. | -- |
| 图像分析 | ezTrack位置追踪模块 | -- | -- |
| ImageJ | NIH | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Sigma-Aldrich | D6429 |
| 胎牛血清 | Gibco | 10099141C | |
| 青霉素-链霉素 | Meilunbio | MA0110 | |
| 视黄酸 | -- | -- | |
| Transwell聚碳酸酯膜插入物 | BIOFIL | TCP001006 | |
| 一步法快速颜色支原体检测试剂盒 | Yise Medical Technology | MD001 | |
| 细胞系 | SVG p12 | ATCC | CRL-8621 |
| HMC3 | Procell | CL_0620 | |
| SH-SY5Y | Procell | CL_0208 | |
| siRNA转染 | RNAFit | HanBio | HB-RF-1000 |
| 细胞分选 | TrypLE Select胰蛋白酶 | Gibco | 12563029 |
| 70微米细胞过滤器 | SORFA | SCS701 | |
| MACS BSA储备液 | Miltenyi Biotec | 130-091-376 | |
| 抗髓鞘磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-104-262 | |
| LS分离柱 | Miltenyi Biotec | 130-042-401 | |
| MidiMACS分离器 | Miltenyi Biotec | 130-042-302 | |
| MACS神经元分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-115-389 | |
| MACS CD11b+磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-093-634 | |
| MACS ACSA-2磁珠试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-097-678 | |
| 蛋白质组学 | IP裂解缓冲液 | Beyotime | P0013 |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Keygen | KGB5101-100 | |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Keygen | KGB5101-2 | |
| 3 kDa分子量截留装置 | Millipore | UFC5003 | |
| 二硫苏糖醇 | -- | -- | |
| 胰蛋白酶 | Thermo Fisher Scientific | 90057 | |
| Pierce肽脱盐离心柱 | Thermo Fisher Scientific | 89851 | |
| Orbitrap Exploris 480质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| C18捕集柱 | Thermo Fisher Scientific | 164535 | |
| Acclaim PepMap C18分析柱 | Thermo Fisher Scientific | 164941 | |
| Proteome Discoverer 2.1 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| UHPLC-HRMS | Vanquish超高效液相色谱系统 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| ACQUITY UPLC HSS T3色谱柱 | Waters | 176001608 | |
| Q-Exactive HFX质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Western blot | 增强型BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0009 |
| CO-IP | Protein A/G磁珠 | Solarbio | M2400 |
| Western blot | 增强化学发光试剂盒 | Millipore | WBKLS0500 |
| Tanon-5200化学发光成像系统 | Tanon | -- | |
| ELISA | 人特异性Aβ40 ELISA试剂盒 | ELK Biotechnology | ELK8921 |
| 人特异性Aβ42 ELISA试剂盒 | ELK Biotechnology | ELK8920 | |
| 酶标仪 | Tecan Spark | -- | |
| RT-qPCR | Trizol试剂 | Accurate Biology | AG21101 |
| Nanodrop 2000分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| HiScript II Q RT SuperMix逆转录试剂盒 | Vazyme | R323-01 | |
| SYBR Green实时PCR预混液 | Accurate Biology | AG11718 | |
| Applied Biosystems ViiA 7实时荧光定量PCR仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 流式细胞术 | CD206-APC抗体 | Proteintech | APC-65155 |
| CD86-PE抗体 | Biogems | 08911-60 | |
| Accuri C6流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| FITC Annexin V凋亡检测试剂盒(含PI) | Elabscience | E-CK-A151 | |
| 动物组织消化 | 蛋白酶K | Vetec | V900887 |
| 十二烷基硫酸钠 | Biosharp | BS088 | |
| 磷酸氢二钠 | Guangzhou Chemical Reagent Factory | BG06 | |
| 磷酸二氢钠 | Guangzhou Chemical Reagent Factory | BG05 | |
| 组织染色 | 尼氏染色液 | Servicebio | GP1043 |
| Permount封片剂 | Servicebio | WG10004160 | |
| 二氢乙啶 | Sigma-Aldrich | D7008-10 | |
| DAPI | Servicebio | G1407-25ML | |
| Tris缓冲盐溶液(含吐温) | Servicebio | G0004 | |
| 免疫荧光 | 柠檬酸抗原修复液 | Servicebio | G1202 |
| 组织笔 | Servicebio | G6100 | |
| 3%牛血清白蛋白 | Servicebio | GC305006 | |
| HRP标记二抗 | Servicebio | G3431-200UL | |
| 酪胺信号放大试剂 | Servicebio | G1255 | |
| DAPI(免疫荧光用) | Servicebio | G1012 | |
| 自发荧光淬灭剂 | Servicebio | G1221 | |
| 抗荧光淬灭封片剂 | Servicebio | G1401 | |
| 摆摇床 | Servicebio | SYC-Z100 | |
| 避光湿盒 | Servicebio | SIB-20F | |
| 透射电镜 | 透射电镜固定液 | Servicebio | G1102-100ML |
| 醋酸铀 | -- | -- | |
| 柠檬酸铅 | -- | -- | |
| Formvar膜铜网 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物暴露 | 模型:APP/PS1小鼠;性别:雄性;年龄:2月龄;暴露途径:灌胃;剂量:0.25、25 mg/kg体重;周期:90天;对照组:纯水 阅读提示:参考文献:2.1节动物研究 |
| 行为测试 | 测试方法:Y迷宫、旷场、新物体识别;训练天数:5天;测试时长:5分钟;间隔时间:1小时 阅读提示:参考文献:2.4-2.6节及图1图注 |
| 体外三培养 | 细胞系:SVG p12、HMC3、RA-SH-SY5Y;PS-NP浓度:0、2、10、50 µg/mL;处理时间:48小时;三培养顺序和细胞数量 阅读提示:参考文献:2.2节细胞培养和处理 |
| 药理干预 | TC-I 15剂量:体外2 µM,体内10 µg/只;给药途径:腹腔注射;频率:隔日;时长:90天 阅读提示:参考文献:2.1节及2.2节 |
| 分子检测 | 抗体信息(COL1A1、COL1A2、ITGA1、ITGB1)详细清单见表S1;ELISA试剂盒:ELK Biotechnology,Aβ40 Cat#ELK8921、Aβ42 Cat#ELK8920 阅读提示:参考文献:2.16节和2.17节及表S1 |