检测感染组织和病变中的促炎因子
评估溃疡分枝杆菌感染是否在体内诱导促炎反应。
通过多重ELISA检测感染小鼠皮肤组织和患者病变中的可溶性因子,并通过转录组分析患者全血中的炎症基因表达。
Mycolactone toxin induces an inflammatory response by targeting the IL-1β pathway: Mechanistic insight into Buruli ulcer pathophysiology
包含体外巨噬细胞实验、基因敲除细胞、体内小鼠模型及患者样本,并涵盖机制验证(ROS、钾外流、炎症小体抑制剂)和功能验证。
小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDM) 人单核细胞来源巨噬细胞(hMDM) C57Bl/6小鼠感染模型 BALB/c小鼠足垫注射模型
小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDM)和人单核细胞来源巨噬细胞(hMDM) LPS刺激浓度(50 ng/mL)及mycolactone剂量(3 ng/mL) TLR2敲除(TLR2-/-)小鼠巨噬细胞 NLRP3敲除(NLRP3-/-)小鼠巨噬细胞 MEVs注射剂量(含2 μg mycolactone)及地塞米松处理(10 mg/kg)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估溃疡分枝杆菌感染是否在体内诱导促炎反应。
通过多重ELISA检测感染小鼠皮肤组织和患者病变中的可溶性因子,并通过转录组分析患者全血中的炎症基因表达。
确定mycolactone是否直接诱导巨噬细胞分泌IL-1β。
用LPS和mycolactone(3 ng/mL)处理BMDM和hMDM,检测IL-1β和IL-18的分泌。
确定mycolactone是否提供第二信号并激活NLRP3/1炎症小体。
使用ROS抑制剂NAC、钾外流抑制剂KCl、NLRP3抑制剂MCC950、NLRP3/1抑制剂15d-PGJ2,以及NLRP3敲除巨噬细胞,检测IL-1β分泌。
确定在感染背景下,MEVs能否提供第一信号并激活TLR2。
用野生型或TLR2敲除BMDM,以MEVs(NPM和PM)或细菌刺激,加入或不加入mycolactone,检测IL-1β分泌。
验证mycolactone在体内能否诱导炎症和组织损伤,并测试地塞米松的预防作用。
将MEVs(含2 μg mycolactone)或纯化mycolactone注射入小鼠足垫,测量肿胀并组织学分析,地塞米松预处理组对比。
验证IL-1β在人体病变中的产生及其位置分布。
对活动性布鲁里溃疡患者和已治疗患者的皮肤活检进行IL-1β免疫组化染色,并评估与抗酸杆菌的位置关系。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞刺激 | 脂多糖 | Sigma-Aldrich | -- |
| 焦磷酸钙二水合物晶体 | InvivoGen | -- | |
| 细胞处理 | MCC950 | InvivoGen | -- |
| 15-脱氧-δ-12,14-前列腺素J2 | Cayman Chemicals | -- | |
| N-乙酰-L-半胱氨酸 | Sigma | -- | |
| Z-VAD-FMK | InvivoGen | -- | |
| 细胞因子检测 | IL-1β ELISA试剂盒 | Invitrogen | -- |
| Luminex检测试剂盒 | R&D Systems | -- | |
| 细胞培养 | 巨噬细胞集落刺激因子 | -- | -- |
| 粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子 | -- | -- | |
| 动物实验 | 地塞米松 | -- | -- |
| 15d-PGJ2 | -- | -- | |
| 组织学 | 抗IL-1β抗体 | Abcam | ab9722 |
| 抗IL-12抗体 | Bioss | bs-1789R | |
| 兔IgG | Vector Laboratories | I-1000 | |
| RNA提取 | Tempus管 | Applied Biosystems | -- |
| Tempus样本RNA分离试剂盒 | Applied Biosystems | -- | |
| RNA质量检测 | 生物分析仪 | Agilent | -- |
| 基因表达分析 | Illumina HumanHT-12 v4表达珠芯片 | Illumina | -- |
| 细胞毒性检测 | ToxiLight生物检测试剂盒 | Lonza | -- |
| 细胞凋亡检测 | TUNEL检测 | -- | -- |
| 蛋白质提取 | Complete EDTA-free蛋白酶抑制剂混合物 | -- | -- |
| 脱氧核糖核酸酶 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞实验 | BMDM和hMDM的分离与分化条件;LPS刺激浓度50 ng/mL;mycolactone剂量3 ng/mL;CPPD剂量20 μg/mL;抑制剂浓度(NAC 2.5/25 mM,KCl 5/50 mM,MCC950 0.1/1 μM,15d-PGJ2 1/10 μM) 阅读提示:Materials and methods: Murine bone marrow-derived macrophages, Human peripheral blood mononuclear cells, Cellular tests |
| MEV制备 | M. ulcerans菌株(1615及其Tn:118突变体)培养至35天;EV纯化方法;mycolactone含量通过HPLC定量 阅读提示:Materials and methods: M. ulcerans, vesicles and mycolactone; Mycolactone concentration |
| 体外刺激 | MEVs NPM和PM的用量(1×10^8及2.5×10^8);细菌MOI 50;TLR2-/-和NLRP3-/-小鼠来源 阅读提示:Materials and methods: Cellular tests; Figure 5A-B legend |
| 动物实验 | 小鼠品系(C57Bl/6和BALB/c)及周龄;感染剂量1×10^4 bacilli(尾静脉);MEVs注射量(含2 μg mycolactone);纯化mycolactone 2 μg(corn oil+8% ethanol);地塞米松10 mg/kg口服;15d-PGJ2 1 mg/kg腹腔注射(每3小时) 阅读提示:Materials and methods: Animal procedures; Figure 5C-E legend |
| 组织学与免疫组化 | 组织固定(4% PFA 24h);切片厚度3 μm;抗体稀释度(anti-IL-1β 1:300,anti-IL-12 1:300);抗原修复条件(柠檬酸钠缓冲液加热20分钟) 阅读提示:Materials and methods: Histology |
| 转录组学 | 患者全血采集(3 mL)于Tempus管;RNA提取试剂盒;芯片类型(Illumina HumanHT-12 v4);归一化方法(VST和quantile);差异表达阈值(log2FC>0.3,FDR q<0.05) 阅读提示:Materials and methods: Whole-blood assay and RNA extraction; Analysis of gene expression in blood samples |
| 统计 | 非参数Mann-Whitney U检验;ANOVA(Dunn's或Tukey's);多重比较校正(Benjamini-Krieger-Yekutieli) 阅读提示:Materials and methods: Statistical analysis |