验证软骨细胞中糖酵解乳酸依赖的组蛋白乳酸化
确认软骨细胞中乳酸水平与组蛋白乳酸化的关系,并鉴定乳酸化修饰位点。
使用糖酵解抑制剂2-DG和LDHA抑制剂(oxamate, FX-11)处理原代软骨细胞,检测细胞内乳酸水平和乳酸化水平;添加外源性乳酸验证对乳酸化的影响;通过HPLC-MS鉴定乳酸化位点;通过pull-down实验验证H3K56la的存在。
H3K56 lactylation promotes collagen II synthesis to modulate chondrocyte metabolism in posttraumatic osteoarthritis
研究包含体外原代软骨细胞实验(抑制剂、敲低/过表达、ChIP-qPCR、Co-IP)和体内ACLT小鼠模型(组织学、micro-CT、免疫组化),并涉及组学(RNA-seq、质谱)分析,包含功能验证和机制验证。
原代小鼠软骨细胞 前交叉韧带横断(ACLT)诱导的创伤后骨关节炎小鼠模型 原代小鼠心肌细胞
原代软骨细胞分离自5日龄雌性C57BL/6J小鼠的膝关节软骨 ACLT手术在8周龄雌性C57BL/6J小鼠上进行,实验组和假手术组各5只 αKG体内给药方式为饮水,剂量为0.25%和0.75% 体外实验中,αKG处理浓度为1 mM和2 mM,TBHP处理浓度为20 μM HIF 1α敲低和过表达均通过转染实现,转染时间为48小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认软骨细胞中乳酸水平与组蛋白乳酸化的关系,并鉴定乳酸化修饰位点。
使用糖酵解抑制剂2-DG和LDHA抑制剂(oxamate, FX-11)处理原代软骨细胞,检测细胞内乳酸水平和乳酸化水平;添加外源性乳酸验证对乳酸化的影响;通过HPLC-MS鉴定乳酸化位点;通过pull-down实验验证H3K56la的存在。
探究H3K56la和HIF 1α对Col2a1表达的调控作用及其相互作用。
对乳酸处理的软骨细胞进行RNA-seq分析,检测HIF 1α和Col2a1表达变化;使用CBP/P300抑制剂验证乳酸化对HIF 1α和Col2a1表达的影响;通过siRNA敲低和质粒过表达HIF 1α,检测H3K56la水平、Col2a1表达、细胞内乳酸和丙酮酸水平;用FX-11抑制LDHA验证其对经HIF 1α过表达诱导的乳酸化和Col2a1表达的影响;通过Co-IP检测HIF 1α和LDHA的结合;通过ChIP-qPCR验证HIF 1α与Col2a1启动子的结合。
确定αKG是否能改变软骨细胞的氧化还原状态并保护细胞免受氧化应激损伤。
用不同浓度的αKG和TBHP处理软骨细胞,进行CCK8细胞活力测定;ELISA检测乙酰辅酶A、琥珀酰辅酶A、αKG脱氢酶和ATP水平;检测NAD/NADH和NADP/NADPH比率;用DCFH-DA探针检测ROS水平;通过流式细胞术分析细胞凋亡;通过透射电镜观察线粒体形态。
验证αKG治疗是否通过调节H3K56la/HIF 1α轴缓解小鼠创伤后骨关节炎的病理变化。
对8周龄雌性C57BL/6J小鼠进行ACLT手术建立PTOA模型,术后通过饮水给予αKG(0.25%和0.75%)治疗4周。通过micro-CT分析骨赘和软骨下骨结构;通过免疫荧光检测HIF 1α和H3K56la表达;通过免疫组化检测Col2a1, Aggrecan, MMP13和ADAMTS5表达;通过HE、番红O和甲苯胺蓝染色评估软骨组织学变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 胰蛋白酶 | -- | -- | |
| IV型胶原酶 | -- | -- | |
| 细胞增殖 | 细胞计数试剂盒-8 (CCK-8) | -- | -- |
| 流式分析 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | Solarbio | CA1020 |
| 无EDTA胰蛋白酶 | Beyotime | C0205 | |
| CytoFLEX流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- | |
| 组织学 | 切片机 | Leica | RM2125 |
| 玻片扫描仪 | Olympus | VS200 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 核蛋白提取试剂 | Solarbio | R0050 | |
| Col2a1抗体 | Beyotime | AF6528 | |
| ADAMTS5抗体 | Bioss | bs-3573R | |
| Aggrecan抗体 | Beyotime | AF6126 | |
| MMP13抗体 | Beyotime | AF7479 | |
| β-actin抗体 | Beyotime | AF0003 | |
| Histone H3抗体 | Beyotime | AF0009 | |
| Histone H4抗体 | Beyotime | AF2581 | |
| 泛赖氨酸乳酸化抗体 | PTM | PTM-1401 | |
| 泛赖氨酸乙酰化抗体 | PTM | PTM-101 | |
| H3K56la抗体 | PTM | PTM-1421RM | |
| HIF 1α抗体 | CST | 36169 | |
| HIF 1α抗体 | Beyotime | AF7087 | |
| HIF 1α抗体 | Huabio | -- | |
| siRNA/质粒转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher | -- |
| 质粒转染 | LV003-HIF 1α质粒 | -- | -- |
| 乳酸检测 | 乳酸检测试剂盒 | BioVision | K627 |
| qPCR | PrimeScript™ RT Master Mix反转录试剂 | Takara | -- |
| SYBR Premix Ex Taq™ PCR试剂 | Takara | -- | |
| ATP检测 | ATP检测试剂盒 | Beyotime | S0027 |
| NAD/NADH检测 | NAD/NADH检测试剂盒 | Beyotime | S0175 |
| NADP/NADPH检测 | NADP/NADPH检测试剂盒 | Beyotime | S0179 |
| ROS检测 | DCFH-DA荧光探针 | Beyotime | S0033S |
| 透射电镜 | 透射电子显微镜 | Hitachi | HT7800 |
| 药物处理 | α-酮戊二酸 | -- | -- |
| 2-脱氧-D-葡萄糖 | -- | -- | |
| 草氨酸 | -- | -- | |
| FX-11 | -- | -- | |
| CBP/P300-IN-3 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系、性别、年龄:8周龄雌性C57BL/6J小鼠;ACLT手术操作;动物分组:假手术组和ACLT组各5只;饲养环境:温度和湿度控制。 阅读提示:Methods - Animal osteoarthritis model |
| 原代细胞分离与培养 | 软骨细胞来源(5日龄雌性C57BL/6J小鼠关节软骨);消化条件和时间(0.25%胰蛋白酶60分钟,0.25%胶原酶IV 6小时);培养条件(DMEM+10%FBS,37°C,5% CO2)。 阅读提示:Methods - Isolation and culture of mouse chondrocytes and cardiomyocytes |
| 细胞处理 | αKG浓度(1mM和2mM);TBHP浓度(20μM用于诱导氧化应激);处理时间(αKG 24小时;TBHP 6小时);2-DG和乳酸处理方式。 阅读提示:Methods - Cell proliferation assay, Results - Addition of αKG altered the redox state in chondrocytes |
| 分子生物学检测 | HIF 1α siRNA和过表达质粒转染条件和时间(48小时);ChIP-qPCR中甲醛交联时间和条件;抗体使用信息;qPCR引物序列。 阅读提示:Methods - Si-RNA transfection and plasmid transfection, Chromatin immunoprecipitation (ChIP)-qPCR, qPCR analysis |
| 体内给药 | αKG给药方式(饮水)和剂量(0.25%和0.75%);治疗持续时间(4周)。 阅读提示:Methods - Animal osteoarthritis model, Results - αKG alleviated osteoarthritis by promoting H3K56 lactylation and HIF 1α expression |