分析TIGIT和CD226在肿瘤浸润淋巴细胞中的表达模式
探究TIGIT和CD226在不同免疫细胞亚群中的表达差异,尤其是Tregs。
利用公开的NSCLC scRNA-seq数据集(GSE131907)和多种实体瘤数据集分析TIGIT、CD226和PVR的表达。通过流式细胞术验证了治疗初治NSCLC患者肿瘤浸润淋巴细胞中TIGIT和CD226的表达。
Specific depletion of TIGIThigh CD226- clonally expanded intratumoral Tregs defines safe and effective TIGIT targeting
包含体外ADCC实验、细胞系模型、小鼠肿瘤模型、人源化小鼠模型、基因敲除小鼠模型、患者样本分析、scRNA/TCR-seq等多层级验证,以及体内外功能与机制验证。
MC38结肠癌小鼠模型 人源化TIGIT敲入小鼠(Tigith/h, Tigith/m) Treg特异性Tigit敲除小鼠(Foxp3Cre Tigitflox/flox) 非小细胞肺癌(NSCLC)患者样本
αTIGIT-IgG1-ADCC在MC38肿瘤模型中的抗肿瘤疗效及Treg清除效果 TIGIThigh CD226− Treg亚群的鉴定及其克隆性扩增状态 αTIGIT-IgG1-ADCC对干样CD4+ T细胞向Th1分化的促进作用 αTIGIT-IgG1-ADCC的安全性和irAE评估 NSCLC患者中Treg克隆扩增与免疫治疗反应的相关性
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究TIGIT和CD226在不同免疫细胞亚群中的表达差异,尤其是Tregs。
利用公开的NSCLC scRNA-seq数据集(GSE131907)和多种实体瘤数据集分析TIGIT、CD226和PVR的表达。通过流式细胞术验证了治疗初治NSCLC患者肿瘤浸润淋巴细胞中TIGIT和CD226的表达。
比较不同Fc工程改造的αTIGIT抗体的ADCC活性和TIGIT-PVR阻断能力。
通过生物层干涉法评估了抗体与FcγR的亲和力。使用细胞-based报告基因实验和原代NK细胞毒性实验评估了ADCC活性。
比较不同αTIGIT变体在体内的抗肿瘤疗效,并验证Treg清除是否为疗效的关键机制。
在MC38肿瘤接种的Tigith/h和Tigith/m小鼠中,腹腔注射不同αTIGIT抗体,监测肿瘤体积。通过流式细胞术分析肿瘤浸润免疫细胞,特别是Treg的变化。
探究αTIGIT-IgG1-ADCC选择性清除的Treg亚群特征及其克隆性。
对处理组小鼠的肿瘤浸润CD3+ T细胞进行scRNA-seq和scTCR-seq,分析Treg亚群组成、克隆扩增状态和基因表达特征。
验证高表达TIGIT的Treg亚群对抗体依赖性细胞毒性更敏感。
利用表达不同水平TIGIT的Jurkat细胞系和从MC38肿瘤中分选的PD-1high hyperTreg和PD-1low non-hyperTreg作为靶细胞,进行体外ADCC实验。
探究Treg清除后,肿瘤内CD4+ T细胞特别是干样CD4+ T细胞的分化命运。
对scRNA-seq数据中肿瘤浸润CD4+ Tconv细胞进行亚群分析和轨迹推断。通过流式细胞术验证干样CD4+ T细胞、Th1效应细胞的比例和功能。
探究克隆性扩增的Treg和干样CD4+ T细胞是否与NSCLC患者免疫治疗反应相关。
分析接受抗PD-1新辅助治疗的NSCLC患者的公开scRNA/TCR-seq数据(GSE243013),比较应答者和非应答者中Treg克隆扩增和干样CD4+ T细胞的比例。
评估ADCC增强的αTIGIT是否会引起自身免疫炎症等不良反应。
比较肿瘤和脾脏/淋巴结中Treg的TIGIT表达。评估αTIGIT-IgG1-ADCC是否诱导TIGIT内化和降解。在新生小鼠irAE模型中,比较αTIGIT-IgG1-ADCC与αPD-1、αCTLA-4及其联合用药的毒性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| ADCC实验 | αTIGIT-IgG1-ADCC抗体 | -- | -- |
| αTIGIT-IgG1-WT抗体 | -- | -- | |
| αTIGIT-IgG4-WT抗体 | -- | -- | |
| Tiragolumab抗体 | Roche | -- | |
| EasySep分离试剂盒 | STEMCELL | -- | |
| CellTrace Violet染料 | Invitrogen | C34571 | |
| 人IL-2 | Novoprotein | C013 | |
| 人IL-15 | PeproTech | GMP200-15 | |
| Annexin V/PI染色 | Yeasen | 40304ES60 | |
| 抗体生产 | 无叠氮化物人IgG-Fc | Athens Research and Technology | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| MC38肿瘤模型中的抗体疗效评估 | 小鼠品系(Tigith/h, Tigith/m),肿瘤细胞系(MC38),抗体类型(hIgG, αTIGIT-IgG1-WT, αTIGIT-IgG1-ADCC, αTIGIT-IgG4-WT, tiragolumab),给药剂量(20 mg/kg),给药时间(肿瘤接种后第6、9、12、15天) 阅读提示:Methods: In vivo tumor models(如存在);Figure 2C, D, H |
| scRNA-seq和scTCR-seq分析 | 样本处理(MC38肿瘤接种Tigith/h小鼠),抗体处理(hIgG, αTIGIT-IgG1-WT, αTIGIT-IgG1-ADCC),肿瘤浸润CD3+ T细胞分选,测序平台和分析流程 阅读提示:Methods: Collection of public scRNA/TCR-seq data; Clustering and annotation; Figure 3A, B, C, G, H, I, J, K |
| 体外ADCC实验 | 靶细胞(Jurkat-TIGIT-GFP, PD-1high/PD-1low Tregs),效应细胞(人/小鼠NK细胞),效靶比(3:1, 1:2, 4:1),抗体浓度,细胞因子浓度(hIL-2 500 IU/mL, hIL-15 10 ng/mL), 共培养时间 阅读提示:Methods: Primary NK cell-based in vitro ADCC assay; Figure 2B, 3E, 3F |
| irAE模型 | 小鼠品系(新生Pdcd1/Ctla4/Tigith/h小鼠),抗体(αPD-1, αCTLA-4, αTIGIT-IgG1-ADCC, tiragolumab),给药剂量(100 µg/抗体/小鼠),给药时间(出生后第10、13、16、19天) 阅读提示:Methods: irAE model and histopathology analysis; Figure 6F, G, H, I |
| 患者样本分析 | 患者队列(NSCLC),样本类型(肿瘤组织),分析方法(流式细胞术, scRNA-seq),关键指标(TIGIT, CD226表达,Treg克隆性) 阅读提示:Results部分关于NSCLC患者样本分析的内容;Figure 1 |