I期剂量递增与安全性评估
确定inavolisib在PIK3CA突变实体瘤患者中的最大耐受剂量和安全性
开放标签、多中心、多臂I期研究(NCT03006172),采用3+3剂量递增设计,评估口服inavolisib(6、9、12 mg每日一次)的安全性和耐受性。
PI3Kα Inhibitor and Degrader Inavolisib Can Co-opt FGFR2 to Enhance Responses in Patients with PIK3CA-Mutated Solid Tumors and in Preclinical Models
包含I期临床试验(患者样本、ctDNA分析)、细胞系体外实验(PRISM筛选、siRNA敲低、Western blot)、异种移植瘤模型以及数据库分析等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
PIK3CA突变实体瘤患者(I期临床试验) FGFR2高表达细胞系(如MFM223、SUM52PE) MFM223 X2.2异种移植瘤模型 PRISM癌症细胞系panel
患者PIK3CA和FGFR2突变状态(ctDNA或组织) 细胞系FGFR2蛋白表达水平(高/低分类) inavolisib剂量(临床:每日6/9/12 mg;体外:GR50测定) FGFR2抑制剂联合处理(体外:Bliss评分;体内:10/30 mg/kg口服) MFM223 X2.2异种移植瘤模型中肿瘤体积测量
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定inavolisib在PIK3CA突变实体瘤患者中的最大耐受剂量和安全性
开放标签、多中心、多臂I期研究(NCT03006172),采用3+3剂量递增设计,评估口服inavolisib(6、9、12 mg每日一次)的安全性和耐受性。
评估inavolisib的药代动力学特征和靶点抑制效果
采集血浆样本进行PK分析,通过FDG-PET和配对肿瘤活检IHC评估PI3K通路抑制和增殖抑制,并分析ctDNA中PIK3CA MAF变化。
评估inavolisib的抗肿瘤活性并发现与临床获益相关的基因组改变
根据RECIST v1.1评估客观缓解率和临床获益率,并对ctDNA进行靶向测序以分析基因组改变与应答的关系。
在细胞系中验证FGFR2改变与inavolisib敏感性的关联
利用PRISM panel(736个细胞系)分析inavolisib AUC与PIK3CA/FGFR2改变及FGFR2表达的相关性。
阐明FGFR2增强inavolisib敏感性的分子机制
通过Western blot、免疫共沉淀、RAS-GTP pulldown、泛素化pulldown等实验,验证FGFR2与HER3、RAS、p85β的相互作用及对突变p110α降解的影响。
验证FGFR2表达是否足以增强inavolisib诱导的突变p110α降解
利用CRISPR/Cas9构建T47D PIK3CA H1047R纯合突变细胞系,并诱导表达FGFR2 WT或N550K,检测inavolisib处理后的p110α泛素化和降解。
评估inavolisib与FGFR2抑制剂联合使用在FGFR2高表达细胞系中的协同效应
使用siRNA敲低FGFR2或采用FGFR2i联合inavolisib处理,测定细胞活力并计算Bliss协同评分。
在体内模型中验证inavolisib和FGFR2抑制剂的联合抗肿瘤活性
在MFM223 X2.2异种移植瘤模型(PIK3CA H1047R、FGFR2扩增)中,每日口服给药22天,评估单药和联合治疗的肿瘤生长抑制和耐药延迟。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 患者入组检测 | cobas PIK3CA突变检测 | Roche | PIK3CA Mutation Test |
| 免疫组化 | Ki67抗体(克隆30-9) | Ventana/Roche Diagnostics | 790-4286 |
| pAKT(Ser473)抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| pS6(Ser235/236)抗体 | Cell Signaling Technology | 4858 | |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Gibco | 31800-105 |
| 胎牛血清 | Corning | 35-016-cm | |
| GlutaMax | Gibco | 35050-061 | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140-122 | |
| 胰蛋白酶 | -- | -- | |
| 细胞活力检测 | CellTiter-Glo试剂盒 | Promega | -- |
| siRNA转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | 13778150 |
| FGFR1 siRNA | Dharmacon | L-003131-00-0005 | |
| FGFR2 siRNA | Dharmacon | L-003132-00-0005 | |
| FGFR3 siRNA | Dharmacon | L-003133-00-0005 | |
| FGFR4 siRNA | Dharmacon | L-003134-00-0005 | |
| ERBB3 siRNA | Dharmacon | L-003127-00-0005 | |
| CRISPR基因编辑 | TurboFectin转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RNA提取 | RNeasy Plus Mini Kit | Qiagen | -- |
| qRT-PCR | 一步法qRT-PCR试剂 | Applied Biosystems | -- |
| Western blot | Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23225 |
| NuPAGE Novex Bis-Tris 4-12%梯度胶 | Invitrogen | -- | |
| SeeBlue Plus2预染蛋白标准 | Thermo Fisher Scientific | LC5925 | |
| iBlot系统 | Invitrogen | -- | |
| ECL化学发光试剂 | Bio-Rad | -- | |
| 放射自显影胶片 | Amersham Biosciences, GE Healthcare | -- | |
| 免疫沉淀 | p85β抗体 | Abcam | ab28346 |
| HER3抗体(生物素偶联) | Invitrogen | MA5-13037 | |
| FGFR2抗体(生物素偶联) | OriGene | TA502917AM | |
| 抗RAS磁珠 | Millipore | 16-321 | |
| 小鼠抗IgG磁珠偶联物 | Cell Signaling Technology | 5873S | |
| 泛素化检测 | TUBE1 | LifeSensors | UM101 |
| Western blot | p110α抗体 | Cell Signaling Technology | 4249 |
| pAKT Ser473抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| pS6 S235/236抗体 | Cell Signaling Technology | 2211 | |
| HER3抗体 | Cell Signaling Technology | 12708 | |
| HER2抗体 | Cell Signaling Technology | 2242 | |
| pHER2 Y1221/Y1222抗体 | Cell Signaling Technology | 2243 | |
| pHER3 Y128抗体 | Cell Signaling Technology | 4791 | |
| pHER3 Y1328抗体 | Cell Signaling Technology | 14525 | |
| pPLCγ Y783抗体 | Cell Signaling Technology | 14008 | |
| pERK T202/T204抗体 | Cell Signaling Technology | 9101 | |
| p4EBP T37/46抗体 | Cell Signaling Technology | 9459 | |
| FGFR1抗体 | Cell Signaling Technology | 9740 | |
| FGFR2抗体 | Cell Signaling Technology | 11835 | |
| FGFR3抗体 | Cell Signaling Technology | 4574 | |
| FGFR4抗体 | Cell Signaling Technology | 8562 | |
| pFGFR Y653/654抗体 | Cell Signaling Technology | 3476 | |
| pFRS2A Y196抗体 | Cell Signaling Technology | 3864 | |
| β-actin抗体 | Sigma-Aldrich | A5441 | |
| Ras抗体 | Abcam | ab52939 | |
| p85α抗体 | Abcam | ab133595 | |
| p85β抗体 | Abcam | ab28356 | |
| 过氧化物酶标记的山羊抗兔IgG | Jackson ImmunoResearch | 111-035-144 | |
| 过氧化物酶标记的山羊抗小鼠IgG | Jackson ImmunoResearch | 115-035-146 | |
| 细胞内蛋白检测 | GTP结合RAS下拉 | -- | -- |
| 活细胞成像 | IncuCyte Zoom活细胞成像系统 | Essen Bioscience | -- |
| 异种移植瘤模型 | NCR裸鼠 | Taconic Biosciences | -- |
| Matrigel | BD Biosciences | -- | |
| 17β-雌二醇缓释片 | Innovative Research of America | SE121 | |
| FGFR2抑制剂(工具化合物) | -- | -- | |
| Inavolisib | -- | -- | |
| 药物处理 | 拉帕替尼 | -- | -- |
| 阿培利司 | -- | -- | |
| 英菲替尼 | -- | -- | |
| AZD4547 | -- | -- | |
| LY2874455 | -- | -- | |
| MG132 | -- | -- | |
| 细胞培养 | 多西环素 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者入组标准 | PIK3CA突变类型和检测方法(组织或ctDNA) 阅读提示:Patients and Methods: 患者入组标准 |
| 剂量递增方案 | inavolisib起始剂量、剂量水平和DLT评估窗口 阅读提示:Patients and Methods: 临床研究设计 |
| 药效学评估 | IHC标记物和评分方法、FDG-PET采集时间 阅读提示:Patients and Methods: IHC分析、FDG-PET成像 |
| ctDNA分析 | 血浆采集时间点、测序平台和突变分析标准 阅读提示:Patients and Methods: ctDNA分析 |
| 细胞系培养 | 培养基配方、FBS浓度、细胞系认证方法 阅读提示:Patients and Methods: 细胞培养 |
| 药物处理 | inavolisib和FGFR2i的浓度、处理时间 阅读提示:Patients and Methods: 活力测定、联合实验 |
| siRNA敲低 | siRNA序列、转染试剂和敲低效率验证 阅读提示:Patients and Methods: siRNA转染 |
| 机制研究 | 免疫共沉淀和泛素化下拉的具体条件 阅读提示:Patients and Methods: 免疫沉淀和下拉 |
| 体内实验 | 动物品系、细胞接种数、给药剂量和疗程 阅读提示:Patients and Methods: 体内异种移植瘤研究 |