建立铂耐药细胞系
获得对铂类药物耐药的卵巢癌细胞模型
通过逐步增加顺铂或卡铂浓度处理OVCAR4和Cov318细胞,诱导产生耐铂亚系Ov4Cis、Ov4Carbo和Cov-Cis,以及体内进化的IVR01。
Adaptive Therapy Exploits Fitness Deficits in Chemotherapy-Resistant Ovarian Cancer to Achieve Long-Term Tumor Control
包含体外共培养、体内移植瘤模型及患者样本分析等多个独立证据层级,并明确进行了功能验证(细胞周期、凋亡)和机制验证(适应性成本)。
OVCAR4人卵巢癌细胞系 OVCAR4/OV4Cis共培养模型 CD1nu/nu小鼠皮下移植瘤模型 卵巢癌患者纵向血液和肿瘤样本
细胞系:OVCAR4和Cov318及其耐铂亚系 共培养起始比例:85:15、50:50、15:85等 低资源条件:0.5% FBS每日换液 动物模型:CD1nu/nu小鼠,皮下双侧接种 AT方案:初始60 mg/kg卡铂,每周调整剂量
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得对铂类药物耐药的卵巢癌细胞模型
通过逐步增加顺铂或卡铂浓度处理OVCAR4和Cov318细胞,诱导产生耐铂亚系Ov4Cis、Ov4Carbo和Cov-Cis,以及体内进化的IVR01。
比较卡铂自适应治疗与标准治疗对肿瘤小鼠生存的影响
将敏感、耐药的OVCAR4细胞或混合比例接种于小鼠双侧皮下,分组接受标准治疗、自适应治疗或对照,监测肿瘤体积和生存期。
验证低资源条件下耐药细胞是否表现出适应性降低
将GFP标记的敏感细胞和RFP标记的耐药细胞按不同比例共培养,在低血清条件下培养,监测敏感与耐药细胞比例变化,比较其单培养和共培养的生长差异。
探究耐药细胞适应性降低的细胞机制是否存在凋亡增加和增殖减少
通过流式细胞术分析共培养中细胞周期和凋亡标记,验证敏感细胞对耐药细胞的影响。
在体内验证耐药细胞的适应性降低现象
将敏感和耐药细胞混合皮下注射,在不同时间点取材,通过qPCR和免疫组化定量敏感/耐药比例及凋亡标记。
通过患者样本验证耐药亚克隆的可追踪性及其与肿瘤负荷的相关性
对5名HGSC患者纵向采集血液和肿瘤样本,提取cfDNA,利用LiqCNA分析拷贝数变化,评估耐药亚克隆比例,并与CA125和临床病程关联。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 顺铂 | -- | -- | |
| 卡铂 | -- | -- | |
| 细胞增殖检测 | Incucyte活细胞成像系统 | Essen Biosciences | -- |
| 流式分析 | BD LSRFortessa流式细胞仪 | BD | -- |
| 凋亡检测 | BV605 Annexin V标记 | BD Horizon | -- |
| 细胞计数 | Countess IIR自动细胞计数器 | Life Technologies | -- |
| qPCR | QuantStudio 5实时定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- |
| 组织DNA提取 | DNeasy组织DNA提取试剂盒 | Qiagen | -- |
| 血DNA提取 | DNeasy血液和组织DNA提取试剂盒 | Qiagen | -- |
| FFPE DNA提取 | High Pure FFPET DNA提取试剂盒 | Roche | -- |
| 组织DNA片段化 | Covaris M220超声破碎仪 | Covaris | -- |
| 文库制备 | NEBNext FFPE DNA修复混合液 | New England Biolabs | -- |
| NEBNext Ultra II DNA文库制备试剂盒(Illumina) | New England Biolabs | -- | |
| cfDNA提取与文库制备 | QIAseq cfDNA一体化试剂盒 | QIAGEN | -- |
| 测序 | NovaSeq 6000测序平台 | Illumina | -- |
| Western blot或IHC(原文未说明具体,但为抗体) | p53抗体 | Cell Signaling Technology | 2527 |
| IHC | GFP抗体 | Cell Signaling Technology | 2956 |
| 抗切割型caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9664 | |
| 荧光素酶抗体 | Abcam | ab185924 | |
| 血液采集 | 游离DNA保存管 | Streck | -- |
| 荧光成像 | 活体成像系统 | PerkinElmer | -- |
| 统计 | GraphPad Prism | GraphPad | -- |
| Mathematica | Wolfram | -- | |
| 图像分析 | Adobe Photoshop | Adobe | -- |
| 扫描 | 滨松NanoZoomer-XR数字切片扫描仪 | Hamamatsu | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 耐药细胞系诱导 | 诱导药物类别、浓度梯度、暴露时间、维持耐药后的验证方法 阅读提示:Materials and Methods: Chemotherapy-resistant cell lines |
| 体外共培养实验 | 共培养起始比例、血清浓度、换液频率、培养时长 阅读提示:Materials and Methods: Cell proliferation and cocultures |
| 体内AT实验 | 细胞注射量、注射途径、肿瘤大小纳入标准、治疗方案(剂量、频率、调整规则) 阅读提示:Materials and Methods: Animal studies, AT experiment; Results: Carboplatin AT... |
| 患者cfDNA分析 | 患者例数、样本类型(血、组织)、采样时间点、DNA提取方法、测序深度、LiqCNA参数 阅读提示:Materials and Methods: Patient samples, DNA extraction and analysis |