生成和验证Pkm1条件性敲除小鼠
建立能够条件性敲除Pkm1的小鼠模型以研究PKM1在前列腺癌中的作用。
通过同源重组在Pkm基因的exon 9两侧插入loxP位点,生成Pkm1条件性等位基因。通过Southern blot和PCR基因分型验证靶向正确,随后与PbCre4小鼠交配获得前列腺特异性Pkm1敲除小鼠(Pkm1pc–/–),并通过qRT-PCR和Western blot确认Pkm1表达缺失和Pkm2表达增加。
Pyruvate Kinase M1 Suppresses Development and Progression of Prostate Adenocarcinoma
包含基因敲除小鼠模型、代谢组学、体内药物实验及人类样本分析等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
Ptenpc–/–小鼠前列腺癌模型 Pkm1;Ptenpc–/–小鼠 Pkm2;Ptenpc–/–小鼠 人类前列腺癌组织样本
Pkm1条件性等位基因的构建及验证(通过Southern blot、qRT-PCR和Western blot确认) Pkm1缺失对Pten缺失前列腺癌进展的影响(生存分析、MRI监测肿瘤生长) Pkm2缺失导致的代谢变化和DNA复制应激及衰老的检测(LC/MS代谢组学、pCHK1和SA-β-gal染色) TEPP-46治疗对已建立肿瘤的作用(MRI评估肿瘤体积变化) 人类前列腺癌中PKM1和PKM2的表达水平(IHC分析)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立能够条件性敲除Pkm1的小鼠模型以研究PKM1在前列腺癌中的作用。
通过同源重组在Pkm基因的exon 9两侧插入loxP位点,生成Pkm1条件性等位基因。通过Southern blot和PCR基因分型验证靶向正确,随后与PbCre4小鼠交配获得前列腺特异性Pkm1敲除小鼠(Pkm1pc–/–),并通过qRT-PCR和Western blot确认Pkm1表达缺失和Pkm2表达增加。
确定Pkm1缺失是否加速Pten缺失驱动的前列腺癌。
将Pkm1条件性小鼠与Ptenpc–/–小鼠杂交,生成Pkm1;Ptenpc–/–小鼠。通过生存分析、MRI监测肿瘤生长、组织学病理分析和Ki-67染色评估肿瘤进展。
确定Pkm2缺失是否抑制Pten缺失驱动的前列腺癌。
将Pkm2条件性小鼠与Ptenpc–/–小鼠杂交,生成Pkm2;Ptenpc–/–小鼠。通过MRI监测肿瘤生长、组织学分析和Ki-67染色评估肿瘤进展。
探究Pkm2缺失导致的代谢改变及其与DNA复制应激和衰老的关系。
对6个月龄的各基因型小鼠前列腺组织进行LC/MS代谢组学分析,检测pCHK1和SA-β-gal染色以评估DNA复制应激和衰老。
验证PKM2激活剂(TEPP-46)是否能抑制已建立的Pten缺失前列腺肿瘤的生长。
对携带已建立肿瘤的Ptenpc–/–小鼠随机分组,分别给予TEPP-46或载体,每日两次灌胃,持续1个月,通过MRI监测肿瘤体积变化和Ki-67染色评估增殖。
评估人类前列腺癌中PKM1和PKM2的表达情况,以探讨PKM2激活剂治疗的潜在适用性。
利用组织微阵列(TMA)对304例人类前列腺癌和正常前列腺组织进行IHC染色,量化PKM1和PKM2的表达水平,并分析其与Gleason分级和TNM分期的关系。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| Western blot和IHC | 抗PKM1抗体 | Sigma-Aldrich | SAB4200094 |
| 抗PKM2抗体 | Cell Signaling Technology | 4053 | |
| Western blot | 抗PKM抗体 | Cell Signaling Technology; Abcam | 3190; ab6191 |
| 抗Vinculin抗体 | Sigma-Aldrich | V4505 | |
| IHC | 抗PKM1抗体 | Cell Signaling Technology | 7067 |
| 抗磷酸化CHK1(ser317)抗体 | MyBioSource | MBS9600779 | |
| 抗波形蛋白抗体 | Abcam | ab24525 | |
| 抗泛细胞角蛋白抗体 | Abcam | ab9377 | |
| 抗突触素抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5–16417 | |
| 抗PCNA抗体 | Cell Signaling Technology | 2586 | |
| 抗Ki-67抗体 | BD Pharmingen | 556003 | |
| 抗AR抗体 | Santa Cruz | sc-816-G | |
| IHC抗原修复 | Citra pH 6.0溶液 | Biogenex | HK086 |
| IHC | BLOXALL | Vector Labs | SP-6000 |
| 蛋白封闭液 | Dako | X0909 | |
| SignalStain Boost | Cell Signaling | 8114 | |
| SignalStain DAB底物 | Cell Signaling | 8059 | |
| Vector Labs ABC-HRP试剂盒 | Vector Labs | PK-4001 | |
| DAB底物 | Vector Labs | SK-4100 | |
| AP偶联山羊抗鸡 | Thermo Fisher Scientific | PA1–28799 | |
| Vulcan Fast Red Kit 2 | Biocare | FR805 | |
| 代谢组学 | QExactive台式轨道阱质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Dionex UltiMate 3000超高效液相色谱系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| ZIC-pHILIC色谱柱 | EMD Millipore | -- | |
| 缬氨酸-D8 | -- | -- | |
| Retsch冷冻研磨仪 | Retsch | -- | |
| PET成像 | Sofie G8 PET/CT | Sofie | -- |
| MRI | Varian 7T磁共振成像系统 | Varian | -- |
| 药物处理 | TEPP-46 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型构建 | Pkm1条件性等位基因的loxP位点位置;PbCre4介导的前列腺特异性敲除;Pten、Pkm1、Pkm2等位基因型;小鼠遗传背景(混合背景);同窝对照。 阅读提示:见材料与方法中的"Generation and breeding of Pkm1 conditional mice and mouse strains" |
| 肿瘤进展监测 | MRI成像参数(TR、TE、矩阵、切片厚度);肿瘤体积评估方法;Kaplan-Meier生存分析。 阅读提示:见材料与方法中的"MRI"和结果部分 |
| 代谢组学分析 | 前列腺组织样本量(10-40 mg);LC/MS参数;代谢物提取方法。 阅读提示:见材料与方法中的"Metabolite measurement and analysis" |
| TEPP-46治疗 | 肿瘤大小阈值(>2 mm3);给药剂量(50 mg/kg);给药频率(每日两次);给药途径(口服灌胃);治疗时间(4周);载体成分。 阅读提示:见材料与方法中的"TEPP-46 treatment of Ptenpc–/– mice" |
| 人类样本分析 | 组织微阵列的设计(每个患者3个肿瘤核心和2个正常核心);IHC染色方案;评分系统(阴性、低、中、高)。 阅读提示:见材料与方法中的"IHC analysis of human prostate cancer" |