功能分析识别与癌症风险增加相关的有害CHEK2错义变异

种系肿瘤抑制基因检查点激酶2（CHEK2）功能丧失变异的杂合携带者患乳腺癌和其他癌症的风险增加。虽然已知CHEK2截短变异是致病的，但意义不确定的错义变异（VUS）的解释具有挑战性。因此，许多VUS在功能上和临床上仍未分类。在这里，我们描述了一种基于小鼠胚胎干细胞（mES）的系统，用于定量确定50个人类CHEK2错义VUS的功能影响。通过评估人类CHK2在Chek2敲除mES细胞中磷酸化其主要靶标之一Kap1的活性，发现31个CHEK2错义VUS损害蛋白质功能至与截短变异相似的程度，而9个CHEK2错义VUS导致中间功能缺陷。机制上，大多数VUS通过引起蛋白质不稳定或损害通过（自身）磷酸化的激活来损害CHK2激酶功能。定量结果表明，CHK2激酶功能障碍的程度与乳腺癌风险增加相关。有害CHEK2变异作为一组[OR 2.23；95%置信区间（CI），1.62–3.07；P < 0.0001]和中间变异（OR 1.63；95% CI，1.21–2.20；P = 0.0014）均与乳腺癌风险增加相关，而功能变异未显示这种关联（OR 1.13；95% CI，0.87–1.46；P = 0.378）。最后，还鉴定了一个有害的CHEK2 VUS，c.486A>G/p.D162G，它与家族性前列腺癌共分离。总之，这些功能测定有效且可靠地识别了与癌症相关的CHEK2 VUS。