结合体内输卵管电穿孔与CRISPR-Cas9介导的基因组编辑建立高级别浆液性卵巢癌模型

Modeling High-Grade Serous Ovarian Carcinoma Using a Combination of In Vivo Fallopian Tube Electroporation and CRISPR-Cas9-Mediated Genome Editing

作者信息Katie Teng, Matthew J Ford, Keerthana Harwalkar, YuQi Li, Alain S Pacis, David Farnell, Nobuko Yamanaka, Yu-Chang Wang, Dunarel Badescu, Tuyet Nhung Ton Nu, Jiannis Ragoussis, David G Huntsman, Jocelyne Arseneau, Yojiro Yamanaka
PMID34301761
发布时间2021-10-15
DOI10.1158/0008-5472.CAN-20-1518

实验完整度

包含体内动物模型、组织病理学、全基因组测序和单细胞RNA测序等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。

主要模型

Lkb1完整小鼠(Lkb1flox/flox; Rosa-LSL-tdTomato) Lkb1缺失小鼠(Lkb1flox/flox; Rosa-LSL-tdTomato) 小鼠输卵管上皮细胞 小鼠卵巢表面上皮细胞

重点核对

电穿孔参数(30 V、3脉冲、1秒间隔、50 ms脉冲长度) 质粒浓度(100-400 ng/μL) 小鼠品系(C57BL/6背景) 基因突变组合(Brca1、Tp53、Pten,有或无Lkb1) 肿瘤发生潜伏期和渗透率(Lkb1缺失组6-14个月腹膜转移96%,腹水74%;Lkb1完整组腹膜转移21%)

摘要

卵巢癌是迄今为止最致命的妇科癌症。高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)占卵巢癌病例的大部分,且最常在晚期被诊断。在此,我们开发了一种新策略,通过结合体内电穿孔和CRISPR-Cas9介导的基因组编辑来生成体细胞卵巢癌小鼠模型。与HGSOC相关的肿瘤抑制基因以两种不同组合(Brca1、Tp53、Pten,有或无Lkb1)突变,成功生成了HGSOC,尽管潜伏期和病理生理学有所不同。在该系统中实施Cre谱系追踪,能够在免疫活性环境中可视化腹膜微小转移。此外,这些模型显示出拷贝数改变和与人类HGSOC相似的表型。由于该策略在选择突变组合和靶向区域方面具有灵活性,它可能对生成小鼠模型以推进对卵巢癌的理解和治疗非常有用。意义:这项研究揭示了一种新策略,用于生成卵巢癌遗传小鼠模型,在选择突变组合和靶向区域方面具有高度灵活性。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
如何利用体内电穿孔和CRISPR-Cas9技术灵活生成可模拟人类HGSOC的小鼠模型,并研究不同肿瘤抑制基因组合和细胞起源对肿瘤发生的影响?
核心机制
PTEN和Lkb1缺失导致AKT/mTOR通路激活;Lkb1缺失影响细胞极性、完整性和能量代谢,促进肿瘤起始和进展;不同细胞类型(输卵管上皮和卵巢表面上皮)对特定突变组合具有不同的易感性。
主要证据
通过体内输卵管电穿孔递送CRISPR-Cas9和Cre质粒,靶向Brca1、Tp53、Pten和Lkb1,成功诱导HGSOC;组织病理学和免疫组化证实肿瘤表达PAX8、WT1、CK8;全基因组测序显示拷贝数改变与人类HGSOC相似;单细胞RNA测序显示腹水细胞组成与人类相似。
研究意义
该策略为生成HGSOC及其他卵巢癌遗传小鼠模型提供了灵活工具,有助于研究细胞起源、肿瘤异质性、腹膜转移机制,并可用于评估治疗策略。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

体内输卵管电穿孔递送质粒

验证通过电穿孔将Cre和CRISPR质粒递送至输卵管远端上皮细胞的效率。

向4-6周龄Rosa-LSL-tdTomato小鼠输卵管管腔注射含有Cre和CRISPR质粒的溶液,进行电穿孔,通过检测RFP表达评估递送效率。

2

诱导肿瘤抑制基因突变

在输卵管上皮细胞中引入Brca1、Tp53、Pten及Lkb1的突变,模拟HGSOC相关遗传改变。

电穿孔递送针对Brca1、Tp53、Pten的sgRNA质粒和Cre质粒,在Lkb1完整和缺失小鼠中诱导基因敲除或突变。

3

肿瘤发生监测和组织病理学分析

观察不同基因突变组合下肿瘤的发生时间、位置和生长模式。

对电穿孔后小鼠进行不同时间点的解剖,记录卵巢肿瘤、腹膜转移和腹水形成,并通过H&E和免疫组化染色分析肿瘤组织。

4

腹膜微转移可视化

利用Cre谱系追踪检测传统方法无法发现的腹膜微小转移灶。

通过RFP表达在免疫活性环境中观察腹膜微转移的形成和形态特征。

5

基因突变分析(MiSeq)

验证电穿孔后靶基因的突变类型和频率。

对RFP+输卵管上皮细胞和肿瘤样本进行MiSeq扩增子测序,分析Brca1、Tp53、Pten的插入缺失突变。

6

全基因组测序和拷贝数分析

评估肿瘤样本的拷贝数改变,并与人类HGSOC特征比较。

对多个肿瘤样本进行全基因组测序,使用CNVkit分析拷贝数变异,并生成热图。

7

单细胞RNA测序分析腹水细胞组成

分析腹水中肿瘤细胞和免疫细胞的组成,与人类HGSOC腹水环境比较。

从一只Lkb1缺失小鼠的腹水中分离单细胞,进行scRNA-seq,鉴定不同细胞群体。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
PX330质粒--Addgene #42230
PCS2 CreNLS质粒----
BTX 830电穿孔仪BTX--
3mm镊式电极BTXItem #45-0487
PAX8抗体ProteinTech10336-1-AP
Ki67抗体Invitrogen14-5698-82
WT1抗体Abcamab89901
CK8抗体Abcamab53280
乙酰化微管蛋白抗体SigmaT7451
磷酸化AKT抗体Cell Signaling Technology#4060
GATA4抗体Invitrogen#14-9980-82
LYVE1抗体ReliaTech#103-PA50AG
AF-488鬼笔环肽Life TechnologiesA12379
AF-635鬼笔环肽Life TechnologiesA34054
兔二抗488InvitrogenA21206
大鼠二抗488InvitrogenA21208
小鼠二抗488InvitrogenA21202
ProLong Gold封片剂InvitrogenP10144
蔡司LSM800共聚焦显微镜Zeiss--
GeneRead DNA FFPE试剂盒Qiagen--
基因组DNA纯化浓缩试剂盒-10Zymo--
NovaSeq 6000 S4 PE150测序仪Illumina--
Chromium单细胞3'试剂盒v210X Genomics--
Chromium控制器10X Genomics--
Dynabeads磁珠Thermo Fisher Scientific2000048
SPRIselect磁珠Beckman CoulterB23318
LabChip微流控芯片PerkinElmer760517 CLS760672
Illumina Hiseq4000 PE100测序仪Illumina--
红细胞裂解液Geneaid--
DMEM/F12培养基Gibco--
钙黄绿素-AM----
乙锭同二聚体1Thermo Fisher ScientificL3224
EVOS FL Auto荧光显微镜Thermo Fisher Scientific--
胰蛋白酶----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
模型建立
电穿孔参数(电压、脉冲次数、间隔、脉冲长度)
阅读提示:Methods: In vivo oviductal electroporation
模型建立
质粒浓度和注射体积
阅读提示:Methods: In vivo oviductal electroporation
基因突变
sgRNA序列和靶向外显子
阅读提示:Methods: Plasmids
肿瘤观察
观察时间点(1, 4-5, 6-8, 9-10, 11-14, 15-16个月)
阅读提示:Results: 表1和图2
肿瘤观察
肿瘤发生率、腹膜转移率和腹水发生率
阅读提示:Results: 表1
组学分析
测序深度和样本数量
阅读提示:Methods: Whole-genome sequencing