体内输卵管电穿孔递送质粒
验证通过电穿孔将Cre和CRISPR质粒递送至输卵管远端上皮细胞的效率。
向4-6周龄Rosa-LSL-tdTomato小鼠输卵管管腔注射含有Cre和CRISPR质粒的溶液,进行电穿孔,通过检测RFP表达评估递送效率。
Modeling High-Grade Serous Ovarian Carcinoma Using a Combination of In Vivo Fallopian Tube Electroporation and CRISPR-Cas9-Mediated Genome Editing
包含体内动物模型、组织病理学、全基因组测序和单细胞RNA测序等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
Lkb1完整小鼠(Lkb1flox/flox; Rosa-LSL-tdTomato) Lkb1缺失小鼠(Lkb1flox/flox; Rosa-LSL-tdTomato) 小鼠输卵管上皮细胞 小鼠卵巢表面上皮细胞
电穿孔参数(30 V、3脉冲、1秒间隔、50 ms脉冲长度) 质粒浓度(100-400 ng/μL) 小鼠品系(C57BL/6背景) 基因突变组合(Brca1、Tp53、Pten,有或无Lkb1) 肿瘤发生潜伏期和渗透率(Lkb1缺失组6-14个月腹膜转移96%,腹水74%;Lkb1完整组腹膜转移21%)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证通过电穿孔将Cre和CRISPR质粒递送至输卵管远端上皮细胞的效率。
向4-6周龄Rosa-LSL-tdTomato小鼠输卵管管腔注射含有Cre和CRISPR质粒的溶液,进行电穿孔,通过检测RFP表达评估递送效率。
在输卵管上皮细胞中引入Brca1、Tp53、Pten及Lkb1的突变,模拟HGSOC相关遗传改变。
电穿孔递送针对Brca1、Tp53、Pten的sgRNA质粒和Cre质粒,在Lkb1完整和缺失小鼠中诱导基因敲除或突变。
观察不同基因突变组合下肿瘤的发生时间、位置和生长模式。
对电穿孔后小鼠进行不同时间点的解剖,记录卵巢肿瘤、腹膜转移和腹水形成,并通过H&E和免疫组化染色分析肿瘤组织。
利用Cre谱系追踪检测传统方法无法发现的腹膜微小转移灶。
通过RFP表达在免疫活性环境中观察腹膜微转移的形成和形态特征。
验证电穿孔后靶基因的突变类型和频率。
对RFP+输卵管上皮细胞和肿瘤样本进行MiSeq扩增子测序,分析Brca1、Tp53、Pten的插入缺失突变。
评估肿瘤样本的拷贝数改变,并与人类HGSOC特征比较。
对多个肿瘤样本进行全基因组测序,使用CNVkit分析拷贝数变异,并生成热图。
分析腹水中肿瘤细胞和免疫细胞的组成,与人类HGSOC腹水环境比较。
从一只Lkb1缺失小鼠的腹水中分离单细胞,进行scRNA-seq,鉴定不同细胞群体。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 体内输卵管电穿孔 | PX330质粒 | -- | Addgene #42230 |
| PCS2 CreNLS质粒 | -- | -- | |
| BTX 830电穿孔仪 | BTX | -- | |
| 3mm镊式电极 | BTX | Item #45-0487 | |
| 组织病理和免疫荧光 | PAX8抗体 | ProteinTech | 10336-1-AP |
| Ki67抗体 | Invitrogen | 14-5698-82 | |
| WT1抗体 | Abcam | ab89901 | |
| CK8抗体 | Abcam | ab53280 | |
| 乙酰化微管蛋白抗体 | Sigma | T7451 | |
| 磷酸化AKT抗体 | Cell Signaling Technology | #4060 | |
| GATA4抗体 | Invitrogen | #14-9980-82 | |
| LYVE1抗体 | ReliaTech | #103-PA50AG | |
| AF-488鬼笔环肽 | Life Technologies | A12379 | |
| AF-635鬼笔环肽 | Life Technologies | A34054 | |
| 兔二抗488 | Invitrogen | A21206 | |
| 大鼠二抗488 | Invitrogen | A21208 | |
| 小鼠二抗488 | Invitrogen | A21202 | |
| ProLong Gold封片剂 | Invitrogen | P10144 | |
| 共聚焦显微镜 | 蔡司LSM800共聚焦显微镜 | Zeiss | -- |
| 全基因组测序 | GeneRead DNA FFPE试剂盒 | Qiagen | -- |
| 基因组DNA纯化浓缩试剂盒-10 | Zymo | -- | |
| NovaSeq 6000 S4 PE150测序仪 | Illumina | -- | |
| 单细胞RNA测序 | Chromium单细胞3'试剂盒v2 | 10X Genomics | -- |
| Chromium控制器 | 10X Genomics | -- | |
| Dynabeads磁珠 | Thermo Fisher Scientific | 2000048 | |
| SPRIselect磁珠 | Beckman Coulter | B23318 | |
| LabChip微流控芯片 | PerkinElmer | 760517 CLS760672 | |
| Illumina Hiseq4000 PE100测序仪 | Illumina | -- | |
| 细胞分离 | 红细胞裂解液 | Geneaid | -- |
| DMEM/F12培养基 | Gibco | -- | |
| 钙黄绿素-AM | -- | -- | |
| 乙锭同二聚体1 | Thermo Fisher Scientific | L3224 | |
| EVOS FL Auto荧光显微镜 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 胰蛋白酶 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 模型建立 | 电穿孔参数(电压、脉冲次数、间隔、脉冲长度) 阅读提示:Methods: In vivo oviductal electroporation |
| 模型建立 | 质粒浓度和注射体积 阅读提示:Methods: In vivo oviductal electroporation |
| 基因突变 | sgRNA序列和靶向外显子 阅读提示:Methods: Plasmids |
| 肿瘤观察 | 观察时间点(1, 4-5, 6-8, 9-10, 11-14, 15-16个月) 阅读提示:Results: 表1和图2 |
| 肿瘤观察 | 肿瘤发生率、腹膜转移率和腹水发生率 阅读提示:Results: 表1 |
| 组学分析 | 测序深度和样本数量 阅读提示:Methods: Whole-genome sequencing |