建立KRAS突变和野生型肿瘤模型
比较KRAS突变对PARPi和抗PD-L1治疗反应的影响。
使用LPA1-T22(KRAS野生型)和LPA1-T127(KRAS突变)同系移植模型,以及CT26(KRASG12D)和MC38(KRAS野生型)皮下模型。
MEK Inhibition Remodels the Immune Landscape of Mutant KRAS Tumors to Overcome Resistance to PARP and Immune Checkpoint Inhibitors
包含体外细胞实验(STING通路、DNA损伤、细胞因子)、多种小鼠模型(同系移植瘤、皮下瘤)及CyTOF免疫分型等多层级验证,并进行了机制验证(siRNA/抑制剂)。
LPA1-T127小鼠乳腺癌同系移植模型 CT26小鼠结直肠癌皮下模型 MC38小鼠结直肠癌皮下模型 iKRAS诱导性小鼠胰腺癌细胞
KRAS突变状态(如KRASQ61H、KRASG12D) 药物剂量和给药方案(如olaparib 50mg/kg/天,trametinib 1mg/kg/天,抗PD-L1 200μg/只/3天) 免疫细胞分析(CyTOF、流式细胞术) STING通路激活标志物(pTBK1、pIRF3、pSTAT1)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较KRAS突变对PARPi和抗PD-L1治疗反应的影响。
使用LPA1-T22(KRAS野生型)和LPA1-T127(KRAS突变)同系移植模型,以及CT26(KRASG12D)和MC38(KRAS野生型)皮下模型。
验证KRAS突变肿瘤对PARPi和免疫检查点抑制剂的耐药性。
用olaparib或BMN673、抗PD-L1抗体及其联合处理荷瘤小鼠,测量肿瘤体积。
探索KRAS突变对PARPi诱导STING激活的影响。
在iKRAS细胞和多种KRAS突变/野生型细胞系中,通过Western blot检测STING通路蛋白(pTBK1、pIRF3、pSTAT1),通过RT-qPCR检测ISG(CCL5、CXCL10、ISG15、IFI44)表达,通过ELISA检测CXCL10分泌。
验证MEKi是否增强PARPi诱导的DNA损伤和胞质dsDNA积累。
使用Western blot检测γH2AX,彗星实验量化DNA损伤,PicoGreen染色检测胞质dsDNA。
确认STING通路介导MEKi和PARPi诱导的ISG表达。
使用STING抑制剂(H151)或siRNA敲低STING,检测ISG表达变化;用dsDNA90直接激活STING以排除传感器缺陷。
验证MAPK通路激活是否抑制PARPi诱导的IFN激活。
在Hela-S3细胞中用FBS或EGF激活MAPK通路,检测PARPi诱导的ISG表达和DNA损伤。
验证MEKi通过减少MDSC和增加T细胞浸润重塑肿瘤微环境。
用CyTOF分析LPA1-T127肿瘤中免疫细胞组成,用细胞因子阵列和ELISA检测IL-6、GM-CSF等水平。
验证三联治疗对KRAS突变肿瘤的协同抗肿瘤作用。
在LPA1-T127和CT26模型中,用olaparib、trametinib和抗PD-L1联合治疗,监测肿瘤生长并分析免疫细胞浸润。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 多西环素 | Sigma | D9891 |
| 药物处理 | 奥拉帕利 | Selleck | -- |
| BMN673 | Selleck | -- | |
| 曲美替尼 | Selleck | -- | |
| 考比替尼 | MCE | -- | |
| H151 | MCE | -- | |
| C176 | MCE | -- | |
| 体内实验 | 抗PD-L1抗体 | BioXcell | BE0101 |
| IgG同型对照 | BioXcell | BE0090 | |
| 流式细胞术 | CD45抗体 | BD Biosciences | BV605 30-F11 |
| Western blot | GAPDH抗体 | ABclonal | AC033 |
| STING抗体 | ABclonal | A3575 | |
| pMEK1/2抗体 | ABclonal | AP0209 | |
| TBK1抗体 | ABclonal | A14641 | |
| IRF3抗体 | ABclonal | A11373 | |
| CD4抗体 | Abcam | ab183685 | |
| CD8抗体 | Abcam | ab209775 | |
| pERK1/2抗体 | Abcam | ab214362 | |
| pSTAT1抗体 | Abcam | ab109461 | |
| pTBK1抗体 | Abcam | ab109272 | |
| pERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4370 | |
| pIRF3抗体 | Cell Signaling Technology | 29047 | |
| STAT1抗体 | Cell Signaling Technology | 14994 | |
| γH2AX抗体 | Cell Signaling Technology | 2577 | |
| 细胞培养 | RIPA裂解液 | Servicebio | G2002-100 |
| Western blot | 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Servicebio | G2006 |
| ECL化学发光试剂盒 | Advansta | 190113-13 | |
| 细胞培养 | 脂质体3000 | Invitrogen | -- |
| DAPI | Sigma-Aldrich | D9542 | |
| ELISA | 人IL-6 ELISA试剂盒 | Neobioscience | EHC007(H).96 |
| 人GM-CSF ELISA试剂盒 | Neobioscience | EHC105.96 | |
| 人CXCL10 ELISA试剂盒 | Neobioscience | EHC157.96 | |
| 人CCL5 ELISA试剂盒 | R&D | DRN00B | |
| 小鼠CXCL10 ELISA试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | BMS6018 | |
| 细胞因子检测 | RayBio人炎症抗体芯片C3 | RayBiotech | -- |
| 流式细胞术 | 可固定活力染料510 | BD Biosciences | -- |
| 转录因子缓冲液套装 | BD Biosciences | -- | |
| 彗星实验 | 彗星实验试剂盒 | Trevigen | -- |
| RT-qPCR | HiScript Q-RT SuperMix用于qPCR | Vazyme Biotech | -- |
| SYBR Green实时PCR预混液 | Life Technologies | -- | |
| 流式细胞术 | CytoFlex流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- |
| 质谱流式 | CyTOF2质谱流式细胞仪 | Fluidigm | -- |
| 免疫荧光 | 奥林巴斯U-HGLGPS成像系统 | Olympus | -- |
| 免疫组化 | BX53F显微镜 | Olympus | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基、培养条件(37°C、5% CO2)、传代次数(不超过30次) 阅读提示:Methods: Cell lines and cell culture |
| 药物处理 | 药物浓度、溶剂(DMSO)、储存条件 阅读提示:Methods: Antibodies and Compounds |
| 体外STING激活检测 | olaparib浓度(5 μM)、trametinib浓度(500 nM)、处理时间(24小时)、Dox浓度(2 μg/mL)及处理时间(48小时) 阅读提示:Methods: Western Blot analysis, RT-qPCR assays, ELISA; Figure 2 legend |
| DNA损伤检测 | γH2AX免疫荧光和Western blot、彗星实验条件(电泳电压21V、时间30分钟)、PicoGreen染色条件(3 μl/mL,1小时) 阅读提示:Methods: Immunofluorescence staining and microscopy, Comet assays, PicoGreen staining |
| STING敲低/抑制 | siRNA浓度(100 μM)和转染时间(48小时)、STING抑制剂浓度(H151 1 μM)和处理时间(24小时) 阅读提示:Methods: RNA interference treatment, Antibodies and Compounds |
| 细胞因子检测 | ELISA试剂盒种类、细胞处理条件(olaparib 5 μM, trametinib 500 nM, 24小时) 阅读提示:Methods: ELISA; Figure 6 legend |
| 体内实验 | 动物品系、周龄、性别(雌性,8周龄)、肿瘤接种方式(细胞数或组织块大小)、给药方案(药物剂量、频率、持续时间) 阅读提示:Methods: Animal Models, CT26 subcutaneous model, MC38 subcutaneous model, Nude mouse model; Figure 1, 6, 7 legends |
| 免疫细胞分析 | 组织消化条件(胶原酶IV浓度、DNase I、时间)、抗体组合、流式细胞仪设置、CyTOF标记 阅读提示:Methods: Flow cytometry and intercellular cytokine staining, Mass Cytometry (CyTOF) |