鉴定NGF在CRC中的表达和来源
确定NGF在人类和小鼠CRC中的表达定位及细胞来源。
使用scRNA-seq分析人类CRC数据,通过RNA原位杂交和免疫荧光验证NGF在人类和小鼠CRC组织中的表达,并利用Lepr-Cre谱系标记小鼠验证NGF主要由Lepr-lineage CAFs表达。
Neuro-Mesenchymal Interaction Mediated by a β2-Adrenergic Nerve Growth Factor Feedforward Loop Promotes Colorectal Cancer Progression
包含体外细胞实验、类器官模型、小鼠原位移植瘤模型、自发肿瘤模型及人类样本分析,并进行了分子机制(通路)和体内功能验证。
人结肠CAFs(CAF05) AKP肿瘤类器官(小鼠结直肠癌类器官) Cdx2-CreERT2; Apcflox/flox; KrasG12D小鼠结直肠癌模型 Lepr-Cre; Rosa26-NGF小鼠
NGF在CRC中主要表达于Lepr-lineage CAFs(Stromal 3成纤维细胞) NE通过β2肾上腺素能受体(ADRB2)诱导CAFs分泌NGF NE通过ADRA2A/Gi介导YAP去磷酸化激活 NGF通过TrkA-PI3K/AKT通路直接促进肿瘤细胞生长 Trk抑制剂(selitrectinib)抑制肿瘤生长并延长生存期
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定NGF在人类和小鼠CRC中的表达定位及细胞来源。
使用scRNA-seq分析人类CRC数据,通过RNA原位杂交和免疫荧光验证NGF在人类和小鼠CRC组织中的表达,并利用Lepr-Cre谱系标记小鼠验证NGF主要由Lepr-lineage CAFs表达。
探究去甲肾上腺素是否通过ADRB2受体信号通路诱导CAFs中NGF表达。
体外培养人结肠CAFs(CAF05),用NE或ISO处理,使用ADRB2拮抗剂或PKA/MEK抑制剂观察NGF表达变化;Western blot检测CREB和ERK磷酸化;ELISA检测NGF分泌。
验证CAFs分泌的NGF能否促进神经突生长和肿瘤内交感神经密度。
收集药物处理后的CAFs条件培养基,处理小鼠腹腔神经节外植体或PC12细胞,观察神经突生长;体内小鼠模型使用ISO处理或Adrb2敲除,观察TH+神经密度和NE水平的变化。
阐明NE如何通过ADRA2A受体信号通路促进CRC细胞生长。
使用AKP肿瘤类器官和人类CRC细胞系(HT-29, LS174T),NE或DEX处理,观察生长变化;RNA-seq及GSEA分析;检测LATS1/YAP磷酸化、TEAD活性及YAP靶基因表达;使用Yohimbine(α2拮抗剂)、PTX(Gi抑制剂)和Verteporfin(YAP抑制剂)验证通路。
确定CAFs分泌的NGF是否直接促进CRC细胞生长及其下游信号通路。
用条件培养基或重组NGF处理CRC细胞和类器官,观察生长变化;检测AKT磷酸化及其下游基因表达;使用Trk抑制剂(GW441756, Selitrectinib)和PI3K抑制剂(Copanlisib)验证通路依赖性。
验证阻断NGF-神经-间质环路对CRC进展的影响,并评估Trk抑制剂的治疗潜力。
利用小鼠CRC模型(AKP原位移植瘤和Cdx2-CreERT2;Apcflox/flox;KrasG12D),通过NGF过表达、CAFs消融、化学交感神经切除或药物处理(ISO, Yohimbine, Selitrectinib)观察肿瘤生长、小鼠生存期、神经密度、YAP/AKT活性等指标。
评估NGF表达与人类CRC患者预后及分子亚型的关联。
分析TCGA COADREAD等人类CRC数据集,根据NGF表达高低分组,进行生存分析和GSEA富集分析,比较不同CMS亚型中NGF表达差异。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Advanced DMEM/F12培养基 | Life Technologies | 12634-010 |
| 胎牛血清 | GeminiBio | 900-108 | |
| 基质胶 | Corning | 356231 | |
| Cultrex BME II型基质胶 | R&D Systems | -- | |
| TrypLE消化液 | Thermo Fisher | 12605028 | |
| Y-27632 | Sigma | Y0503 | |
| 嘌呤霉素 | InvivoGen | ant-pr-1 | |
| 杀稻瘟菌素 | Invivogen | ant-bl-05 | |
| 药物处理 | ICI118,551 | MedChem Express | HY-13951 |
| 育亨宾 | Cayman Chemical | 19869 | |
| 百日咳毒素 | Cayman Chemical | 23220 | |
| 维替泊芬 | MedChem Express | HY-B0146 | |
| 塞利替尼 | Ambeed Inc | A285925 | |
| GW441756 | Selleck Chemicals | S2891 | |
| 库潘尼西 | MedChem Express | HY-15346 | |
| 6-羟基多巴胺 | Selleckchem | S5324 | |
| 白喉毒素 | Millipore Sigma | 322326 | |
| 重组蛋白 | 重组人NGF-β | R&D Systems | 256-GF |
| 检测试剂盒 | 人NGFβ ELISA试剂盒 | Abcam | ab193760 |
| RNA检测 | RNAscope 2.5 HD检测试剂盒 | Advanced Cell Diagnostics | -- |
| TRIzol裂解液 | Invitrogen | -- | |
| NucleoSpin RNA提取试剂盒 | Macherey-Nagel | 740955 | |
| 蛋白检测 | RIPA裂解缓冲液 | Thermo Fisher | 78501 |
| PVDF膜 | Millipore | IEVH07850 | |
| 抗体 | 抗酪氨酸羟化酶抗体 | Cell Signaling Technology | 58844 |
| 抗NGF抗体 | ABclonal | A13922 | |
| 抗磷酸化AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| 抗非磷酸化YAP抗体 | Abcam | ab205270 | |
| 抗Ki67抗体 | Abcam | ab16667 | |
| 设备 | 小动物活体成像系统 | PerkinElmer | -- |
| BZ-X710显微镜 | Keyence | -- | |
| QuantStudio 3实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| ChemiDoc MP成像系统 | Bio-Rad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系(CAF05, HT-29, LS174T, CCD-18Co)的培养条件,包括培养基(Advanced DMEM/F12)、血清浓度、抗生素、生长因子(如Noggin, R-spondin, Wnt-3A) 阅读提示:Methods 中 'Cell culture' 部分 |
| 药物处理 | 药物浓度和处理时间(如NE 10 μM, ISO 50 nM, ICI 118,551 25 μM, Yohimbine 25 μM, Dexmedetomidine 10 μM, Pertussis toxin 100 ng/mL, Verteporfin 0.5 μM, Selitrectinib 1 μM) 阅读提示:Methods 中 'Drug treatment of AKP tumor organoids' 和 'CellTiter-Glo assay' 部分 |
| 动物模型 | 小鼠品系(Lepr-Cre, Rosa26-NGF, Adrb2 flox/flox等),细胞注射量(5×10^5或1×10^5),注射部位(直肠黏膜),药物剂量和给药途径(ISO 10 mg/kg/day, ICI 0.5 mg/kg/day, Yohimbine 0.1 mg/kg/day, Selitrectinib 30 mg/kg/day) 阅读提示:Methods 中 'Mice' 和 'In vivo drug treatment' 部分 |
| 分子生物学检测 | 抗体信息(如anti-TH, anti-NGF, anti-pAKT等)及其工作浓度,ELISA试剂盒货号,qRT-PCR引物序列 阅读提示:Methods 中 'Antibodies' 和 'Quantitative reverse-transcription PCR' 部分 |
| 组织学分析 | 组织固定和切片方法,抗原修复条件,抗体孵育时间,图像分析软件和参数(如QuPath, ImageJ) 阅读提示:Methods 中 'Immunohistochemistry (IHC) and immunofluorescence (IF)' 和 'Quantitative image analysis' 部分 |