体外激酶选择性评估
确定Zongertinib对HER2的选择性及其对EGFR等其他激酶的影响。
通过激酶组筛选和剂量-反应曲线测定Zongertinib对397种激酶的抑制活性。
Zongertinib (BI 1810631), an Irreversible HER2 TKI, Spares EGFR Signaling and Improves Therapeutic Response in Preclinical Models and Patients with HER2-Driven Cancers
包含体外激酶和细胞增殖实验、体内异种移植模型及患者临床数据等多个证据层级,并进行了信号通路和机制验证。
HER2依赖性人癌细胞系(如NCI-N87) HER2YVMA依赖的PC-9细胞模型 HER2YVMA依赖的PDX模型 患者肿瘤样本(临床试验)
HER2YVMA与EGFRWT在Ba/F3细胞中的选择性指数 Ba/F3细胞HER2YVMA,C805S突变对Zongertinib敏感性的影响 HER2依赖性异种移植模型中的给药剂量和方案(如每日一次、每日两次) 患者临床试验的客观缓解率(ORR)和疾病控制率(DCR)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定Zongertinib对HER2的选择性及其对EGFR等其他激酶的影响。
通过激酶组筛选和剂量-反应曲线测定Zongertinib对397种激酶的抑制活性。
评估Zongertinib对HER2依赖或EGFR依赖的细胞增殖的影响。
在Ba/F3细胞和多种人癌细胞系中测定Zongertinib的IC50值,并比较其对HER2和EGFR的选择性。
验证Zongertinib对HER2下游信号通路(如MAPK和PI3K)的抑制作用。
通过免疫印迹和基因表达分析检测Zongertinib处理后HER2、ERK、AKT等蛋白磷酸化水平的变化。
评估Zongertinib在HER2驱动肿瘤模型中的抗肿瘤活性。
在NCI-N87、PC-9 EGFRKO,HER2YVMA以及PDX模型中给予不同剂量的Zongertinib,监测肿瘤体积变化。
初步评估Zongertinib在HER2异常肿瘤患者中的安全性和疗效。
在I期临床试验(NCT04886804)中给予患者不同剂量的Zongertinib,评估客观缓解率和安全性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Sigma-Aldrich | D4629 |
| 胎牛血清 | Gibco | 26140079 | |
| 细胞增殖实验 | CellTiter-Glo发光细胞活力检测试剂 | Promega | G9243 |
| Western blot | PVDF膜 | Bio-Rad | 1704157 |
| HER2抗体 (#4290) | Cell Signaling Technology | 4290 | |
| pHER2抗体 (#6942) | Cell Signaling Technology | 6942 | |
| pHER2抗体 (#2247) | Cell Signaling Technology | 2247 | |
| HER3抗体 (#12708) | Cell Signaling Technology | 12708 | |
| HER4抗体 (#4795) | Cell Signaling Technology | 4795 | |
| pERK抗体 (#4370) | Cell Signaling Technology | 4370 | |
| ERK抗体 (#9102) | Cell Signaling Technology | 9102 | |
| pAKT抗体 (#4058) | Cell Signaling Technology | 4058 | |
| AKT抗体 (#9272) | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| beta-肌动蛋白抗体 (#4967) | Cell Signaling Technology | 4967 | |
| 山羊抗兔HRP标记抗体 | Dako | P0448 | |
| 增强化学发光试剂 | GE Healthcare | RPN2106 | |
| 增强化学发光试剂 | Merck | 64-202BP | |
| Simple Western | RIPA裂解液 | Sigma-Aldrich | R2078 |
| Halt蛋白酶抑制剂混合物 | Thermo Fisher Scientific | 78438 | |
| Benzonase核酸酶 | Millipore | 70746 | |
| 12-230 kDa分离模块 | ProteinSimple | SM-W004 | |
| EGFR抗体 (4267) | Cell Signaling Technology | 4267 | |
| pEGFR抗体 (3777) | Cell Signaling Technology | 3777 | |
| pERK抗体 (4370) | Cell Signaling Technology | 4370 | |
| pAKT抗体 (4060) | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| DUSP6抗体 (ab76310) | Abcam | ab76310 | |
| S6抗体 (2217) | Cell Signaling Technology | 2217 | |
| pS6抗体 (2211) | Cell Signaling Technology | 2211 | |
| GAPDH抗体 (ab9485) | Abcam | ab9485 | |
| 生物标志物分析 | 磷酸化/总ERK1/2试剂盒 | Meso Scale Diagnostics | K15107D |
| 磷酸化(Tyr1248)/总ErbB2试剂盒 | Meso Scale Diagnostics | K15125D | |
| 裂解缓冲液 | Meso Scale Discovery | R60TX-2 | |
| 磷酸酶抑制剂混合物#2 | Sigma-Aldrich | P5726 | |
| 磷酸酶抑制剂混合物#3 | Sigma-Aldrich | P0044 | |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | 11836170001 | |
| 十二烷基硫酸钠 | Sigma-Aldrich | 75746 | |
| ReadyPrep微型研磨器 | Bio-Rad | 163-2146 | |
| 树脂管 | Bio-Rad | 163-2146 | |
| 基因表达分析 | RNeasy mini试剂盒 | Qiagen | 73404 |
| QIAzol裂解试剂 | Qiagen | -- | |
| TissueLyser II组织研磨机 | Qiagen | -- | |
| QuantiGene单重检测试剂盒 | Invitrogen | QS0013 | |
| 单重RNA探针 | Invitrogen | QGS-200 | |
| RNA测序 | QuantSeq 3' mRNA-Seq V2文库制备试剂盒 | Lexogen GmbH | -- |
| Biomek i7自动化液体处理工作站 | Beckman Coulter GmbH | -- | |
| 高灵敏度D1000 ScreenTape | Agilent Technologies | -- | |
| 4200 TapeStation系统 | Agilent Technologies | -- | |
| NEBNext文库定量试剂盒 | New England BioLabs | E7630L | |
| NextSeq 2000测序仪 | Illumina | -- | |
| NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- | |
| MANO方法 | QIAamp DNA mini试剂盒 | Qiagen | -- |
| NEBNext Q5热启动高保真PCR预混液 | New England BioLabs | -- | |
| AMPure磁珠 | Beckman Coulter | -- | |
| Qubit 2.0荧光计 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Agilent 2200 TapeStation系统 | Agilent | -- | |
| Illumina MiSeq系统 | Illumina | -- | |
| 试剂盒V2(300循环) | Illumina | -- | |
| 细胞培养 | RPMI1640培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 小鼠IL3 | Merck | -- | |
| PRISM筛选中使用的仪器 | Luminex扫描仪 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞增殖实验 | 细胞系:Ba/F3、NCI-N87等;处理时间:5天;检测方法:CellTiter-Glo。 阅读提示:Methods - Proliferation Assay |
| 激酶选择性实验 | 激酶抑制测定:1 μmol/L单点抑制率及IC50值;检测方法:Thermo Fisher Scientific SelectScreen。 阅读提示:Methods - Kinase Panel |
| 体内异种移植瘤实验 | 动物品系、细胞接种量、给药剂量和方案(如每日一次或每日两次)。 阅读提示:Methods - In Vivo Experiments |
| 临床实验 | 患者入组标准、给药剂量和方案(如每日一次或每日两次)、疗效评估标准。 阅读提示:Results - Clinical trial 1479-0001 |
| 信号通路分析 | 细胞处理浓度和时间;抗体类型和稀释比例。 阅读提示:Methods - Immunoblots、Simple Western |