CDCP1表达分析
评估CDCP1在膀胱癌各分子亚型及临床样本中的表达水平。
分析4个转录组数据集(共1047例活检)及组织微阵列(80例活检)进行免疫组化评分;通过流式细胞术和免疫印迹检测细胞系和PDX样本中的CDCP1表达。
Theranostic Targeting of CUB Domain-Containing Protein 1 (CDCP1) in Multiple Subtypes of Bladder Cancer
包含CDCP1表达分析(转录组、IHC、流式、免疫印迹)、体外饱和结合实验、体内PET成像和177Lu-4A06治疗实验,以及RAS信号通路机制验证,多个独立证据层级。
UMUC3、TCCSUP、5637、HT1376、UMUC9等膀胱癌细胞系 UMUC3和HT1376皮下异种移植小鼠模型 膀胱癌患者来源异种移植(PDX)样本 膀胱癌患者活检组织微阵列(TMA)
细胞系中CDCP1受体密度(如UMUC3为1.49×10^6/细胞) CDCP1表达与NECTIN4和TROP2的相关性(不相关或负相关) 89Zr-4A06 PET成像时间和肿瘤摄取(72小时,UMUC3约20%ID/g) 177Lu-4A06治疗剂量(400 μCi/次,共2次)及给药途径(静脉注射) CDCP1表达受RAS信号调控,使用索托拉西布和曲美替尼处理后的表达变化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估CDCP1在膀胱癌各分子亚型及临床样本中的表达水平。
分析4个转录组数据集(共1047例活检)及组织微阵列(80例活检)进行免疫组化评分;通过流式细胞术和免疫印迹检测细胞系和PDX样本中的CDCP1表达。
量化膀胱癌细胞系表面CDCP1受体数量。
使用125I标记的4A06抗体进行饱和结合实验,计算Bmax和受体数/细胞。
评估89Zr-4A06 PET能否检测膀胱癌异种移植瘤。
对携带五种膀胱癌异种移植瘤的小鼠注射89Zr-4A06,进行PET/CT成像及生物分布分析。
评估177Lu-4A06对膀胱癌异种移植瘤的抗肿瘤效果。
对携带UMUC3(高表达)或HT1376(中等表达)的小鼠静脉注射177Lu-4A06或生理盐水,测量肿瘤体积和体重,比较生存期。
探索RAS信号通路是否调控膀胱癌细胞中CDCP1的表达。
使用KRAS G12C抑制剂索托拉西布和MEK抑制剂曲美替尼处理UMUC3细胞,通过免疫印迹和流式细胞术检测CDCP1表达变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | MEM培养基 | Life Technologies | -- |
| 胎牛血清 | Seradigm | -- | |
| MycoAlert试剂盒 | Lonza | -- | |
| 药物处理 | 索托拉西布 | MedChemExpress | -- |
| 曲美替尼 | MedChemExpress | -- | |
| 抗体标记 | p-SCN-Bn-去铁胺 | Macrocyclics | B-705 |
| p-SCN-Bn-DOTA | Macrocyclics | B-205 | |
| 放射性标记 | 89Zr-草酸盐 | 3D Imaging, LLC | -- |
| 177LuCl3 | Oak Ridge National Laboratory | -- | |
| 碘-125 | Perkin Elmer | -- | |
| 免疫组织化学 | CDCP1一抗 | Cell Signaling Technology | 4115S |
| 抗兔HQ和HQ-HRP二抗 | Ventana | -- | |
| 流式细胞术 | PE-抗CDCP1抗体 | Biolegend | 324017 |
| 荧光素偶联二抗 | Jackson ImmunoResearch | 109-546-097 | |
| 免疫印迹 | Pierce RIPA裂解液 | ThermoFisher Scientific | 89900 |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂 | ThermoFisher Scientific | 1861281 | |
| Bis Tris凝胶 | Invitrogen | NW04120BOX | |
| Immobilon-P膜 | Millipore | IPVH00010 | |
| 抗CDCP1抗体 | Cell Signaling | 4115 | |
| TROP2抗体 | Abcam | 214488 | |
| NECTIN4抗体 | Cell Signaling | 17402S | |
| 抗β-actin抗体 | Sigma-Aldrich | A5441 | |
| GAPDH抗体 | Cell Signaling | 5174 | |
| 山羊抗兔二抗 | Invitrogen | 65-6120 | |
| 山羊抗大鼠二抗 | Invitrogen | 62-6520 | |
| HRP-抗兔二抗 | Cell Signaling Technology | 7074 | |
| West Pico化学发光底物 | ThermoFisher Scientific | 34578 | |
| 胶片 | Blue Devil | 30-507 | |
| 饱和结合实验 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 动物实验 | 基质胶 | Corning | -- |
| Inveon小动物PET/CT扫描仪 | Siemens Healthcare | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源(UCSF Cell Culture Facility或赠予)及STR鉴定结果 阅读提示:Material and Methods: General Methods |
| CDCP1表达分析 | 转录组队列的基因表达数据预处理(标准化方法) 阅读提示:Material and Methods: Patient populations and transcriptome profiling |
| 免疫组化 | 组织微阵列来源、抗体稀释度(1:50)、抗原修复条件、H评分方法 阅读提示:Material and Methods: Histology and Immunohistochemistry |
| 流式细胞术 | 抗体克隆(PE-anti-CDCP1)、稀释度(1:100)、孵育时间(30分钟) 阅读提示:Material and Methods: Flow Cytometry |
| 免疫印迹 | 裂解液组成、蛋白上样量(15 μg)、凝胶类型、抗体及稀释度、检测底物 阅读提示:Material and Methods: Immunoblot |
| 饱和结合实验 | 125I-4A06放射化学纯度>99%、浓度系列、细胞数、孵育时间、非特异性结合确定方法 阅读提示:Material and Methods: Saturation binding assays |
| 动物模型建立 | 小鼠品系及周龄(6-8周龄雄性裸鼠)、接种细胞数(1.5×10^6)、基质胶比例(1:1) 阅读提示:Material and Methods: Animal studies |
| 放射性标记和成像 | 放射性标记方法(DFO或DOTA偶联)、注射剂量(~300 μCi 89Zr-4A06)、成像时间(72小时)、PET/CT采集参数 阅读提示:Material and Methods: Animal studies, Small animal PET/CT |
| 治疗实验 | 177Lu-4A06给药剂量(400 μCi/次)、给药时间(第0天和第7天)、给药途径(尾静脉)、观察指标(肿瘤体积、体重、生存期) 阅读提示:Material and Methods: Animal studies, Results: CDCP1 can be targeted... |
| RAS机制实验 | 抑制剂索托拉西布和曲美替尼的浓度范围及处理时间(48小时) 阅读提示:Material and Methods: General Methods, Results: Hyperactive RAS signaling... |