OvaPrint——一种用于高级别浆液性卵巢癌风险评估的无细胞DNA甲基化液体活检技术

OvaPrint-A Cell-free DNA Methylation Liquid Biopsy for the Risk Assessment of High-grade Serous Ovarian Cancer

作者信息David N Buckley, Juan Pablo Lewinger, Gerald Gooden, Monique Spillman, Monica Neuman, X Mona Guo, Ben Yi Tew, Heather Miller, Varun U Khetan, Lee P Shulman, Lynda Roman, Bodour Salhia
PMID37812492
发布时间2023-12-15
DOI10.1158/1078-0432.CCR-23-1197

摘要

目的:高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)是最致命的卵巢上皮性癌(EOC),通常于晚期确诊。对于已知盆腔肿块的女性,手术联合病理评估是诊断EOC最可靠的方法,目前仍缺乏针对无症状女性的有效筛查工具。本研究开发了一种基于游离DNA(cfDNA)甲基化的液体活检技术,用于早期HGSOC的风险评估。实验设计:我们采用简化代表性亚硫酸氢盐测序技术,鉴定HGSOC与正常卵巢及输卵管组织间的差异甲基化区域(DMR)。随后,针对1,677个DMR进行杂交探针捕获,并在独立cfDNA样本集上构建分类器(OvaPrint),以区分HGSOC与良性肿块。我们还分析了一系列非HGSOC的EOC样本(包括低级别和交界性肿瘤),以评估OvaPrint的泛化能力。本研究共分析了372例样本(组织样本59例,血浆样本313例)。结果:OvaPrint在区分HGSOC与良性肿块方面,阳性预测值达95%,阴性预测值为88%,优于其他商业化检测方法。OvaPrint对非HGSOC的EOC敏感性较低,但在识别具有较高恶性潜能的低级别和交界性肿瘤方面可能具有潜在应用价值。结论:OvaPrint是一种高灵敏度、高特异性的检测方法,可用于有症状女性的HGSOC风险评估。有必要开展前瞻性研究,以验证OvaPrint在HGSOC中的应用价值,并进一步开发其在有症状和无症状附件肿块女性中对非HGSOC的EOC亚型的检测能力。

实验方法

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