体内疗效评估
评估ADT、PI3Ki及aPD-1单药或联合对PTEN/p53缺陷小鼠前列腺肿瘤生长的抑制作用。
对携带前列腺肿瘤的PTEN/p53缺陷GEM进行药物治疗,通过MRI监测肿瘤体积变化,计算ORR。
Reversal of Lactate and PD-1-mediated Macrophage Immunosuppression Controls Growth of PTEN/p53-deficient Prostate Cancer
包含体内GEM模型、离体共培养、体外细胞实验、单细胞RNA测序等多个独立证据层级,并进行功能验证和机制验证。
Pb-Cre; PTENfl/fl Trp53fl/fl 基因工程小鼠(GEM) PTEN/p53缺陷前列腺肿瘤细胞系(AC1和SC1) 人骨/淋巴结转移性前列腺癌患者样本
PTEN/p53缺陷GEM中肿瘤大小、治疗分组及给药方案 TAM亚群(MHC-IIhi/PD-1lo等)的流式分选和共培养条件 用于吞噬实验的肿瘤细胞系和TAM亚群 单细胞RNA测序平台及数据分析方法
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估ADT、PI3Ki及aPD-1单药或联合对PTEN/p53缺陷小鼠前列腺肿瘤生长的抑制作用。
对携带前列腺肿瘤的PTEN/p53缺陷GEM进行药物治疗,通过MRI监测肿瘤体积变化,计算ORR。
分析治疗后肿瘤微环境中免疫细胞组成和TAM活化状态。
通过流式细胞术分析肿瘤免疫细胞,包括TAM、T细胞等,检测MHC-II、PD-1等标志物。
验证ADT、PI3Ki和aPD-1对TAM吞噬肿瘤细胞能力的影响。
FACS分选TAM亚群,与荧光标记的肿瘤细胞共培养,检测吞噬活性。
探究PI3Ki通过改变肿瘤细胞分泌组对TAM功能的影响。
收集处理后的肿瘤单细胞悬液条件培养基,处理TAM,检测吞噬和组蛋白乳酰化。
验证PI3Ki处理对肿瘤细胞乳酸产生和TAM组蛋白乳酰化的影响。
利用比色法检测条件培养基中乳酸水平,Western blot检测H3K18lac。
验证巨噬细胞在联合治疗疗效中的必要性。
使用氯膦酸盐脂质体耗竭巨噬细胞,观察联合治疗抗肿瘤效果的变化。
分析人转移性前列腺癌样本中肿瘤细胞糖酵解与TAM吞噬/极化状态的相关性。
对骨和淋巴结转移样本进行scRNA-seq,计算基因签名得分。
识别耐药的分子通路。
对治疗后的肿瘤进行RNA-seq,进行通路富集分析,并用Western blot验证关键蛋白。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 地加瑞克 | MedchemExpress | HY16168A |
| 库潘尼西 | Selleckchem | BAY 80-6946 | |
| PD-1抗体 | Bristol Myers Squibb | mPD-1-D265A | |
| 细胞培养 | 前列腺上皮生长培养基 | Lonza | CC-3166 |
| 胎牛血清 | Gemini | 100500 | |
| 活性炭剥离胎牛血清 | Gibco | 12676029 | |
| 蛋白提取 | T-PER裂解缓冲液 | ThermoFisher | 78510 |
| RIPA裂解缓冲液 | ThermoFisher | 89900 | |
| Western blot | pAKT-S473抗体 | Cell Signaling Technology | 4060S |
| pAKT-T308抗体 | Cell Signaling Technology | 2965S | |
| 总AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4691S | |
| 活化β-连环蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 8814S | |
| H3K18乳酰化抗体 | PTM biolabs | PTM-1406RM | |
| GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 2118S | |
| 流式细胞术 | 抗CD45抗体 | Biolegend | 103138 |
| 抗CD11b抗体 | Biolegend | 101257 | |
| 抗CD11c抗体 | Biolegend | 117339 | |
| 抗Ly6c抗体 | Biolegend | 128006 | |
| 抗Ly6g抗体 | Tonbo Biosciences | 80-5931-U100 | |
| 抗MHC-II抗体 | Biolegend | 107631 | |
| 抗F4/80抗体 | Biolegend | 123147 | |
| 抗CD206抗体 | Biolegend | 141708 | |
| 抗PD-1抗体 | Biolegend | 135228 | |
| 抗PD-L1抗体 | Invitrogen | 25-5982-82 | |
| Ghost活性染料 | Tonbo Biosciences | 13-0870-T100 | |
| 抗CD3抗体 | Biolegend | 100216 | |
| 抗CD4抗体 | Biolegend | 100451 | |
| 抗CD8抗体 | Biolegend | 100748 | |
| 抗CD19抗体 | Biolegend | 115541 | |
| 固定/透化缓冲液 | Biolegend | 421401 | |
| 透化缓冲液 | Biolegend | 421402 | |
| 抗FoxP3抗体 | Biolegend | 126408 | |
| 抗Ki67抗体 | Biolegend | 652404 | |
| 凋亡检测 | Annexin V/PI凋亡检测试剂盒 | BD Biosciences | 556547 |
| TAM分选 | Liberase消化酶 | Sigma | 5401020001 |
| BMDM生成 | 巨噬细胞集落刺激因子 | PeproTech | 315-02 |
| DMEM培养基 | Corning | 17-205-CV | |
| 吞噬实验 | CellTrace紫染料 | ThermoFisher | C34571 |
| 乳酸 | Sigma | L7022 | |
| 乳酸检测 | 乳酸比色试剂盒 | Biovision | K627-100 |
| 单细胞测序 | Chromium控制器 | 10x Genomics | -- |
| 细胞因子分析 | 小鼠XL细胞因子阵列 | R&D systems | ARY028 |
| RNA-seq | RNeasy Plus Micro试剂盒 | Qiagen | 74034 |
| NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- | |
| 体内成像 | 9.4特斯拉小动物MRI扫描仪 | Bruker | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体内治疗 | 小鼠品系、肿瘤体积标准、给药剂量和方式、治疗周期 阅读提示:Methods:In vivo murine treatment and prostate tumor growth kinetic studies |
| 流式分析 | 抗体克隆号、用量、孵育条件、固定透化方案 阅读提示:Methods:Flow cytometric analysis |
| 吞噬实验 | TAM分选标记、共培养比例、处理浓度和时间、靶细胞染色 阅读提示:Methods:Ex vivo phagocytosis assay |
| 乳酸和组蛋白乳酰化 | 乳酸检测试剂盒、H3K18lac抗体、处理条件 阅读提示:Methods:Lactate determination, Western blot |
| 单细胞测序 | 样本类型、平台、数据分析流程、基因签名 阅读提示:Methods:Single cell RNA sequencing and bioinformatic analysis |