FH变异致病性促进肾癌中嘌呤补救途径依赖性

FH Variant Pathogenicity Promotes Purine Salvage Pathway Dependence in Kidney Cancer

作者信息Blake R Wilde, Nishma Chakraborty, Nedas Matulionis, Stephanie Hernandez, Daiki Ueno, Michayla E Gee, Edward D Esplin, Karen Ouyang, Keith Nykamp, Brian Shuch, Heather R Christofk
PMID37255402
发布时间2023-09-06
DOI10.1158/2159-8290.CD-22-0874

实验完整度

包含体外酶活测定、细胞系代谢组学、稳定同位素示踪、体内异种移植瘤模型及药物抑制实验,涉及多个独立验证层级。

主要模型

NCCFH1 HLRCC细胞系 UOK-262 HLRCC细胞系 xp-152-cl患者来源异种移植瘤细胞系 NSG小鼠皮下异种移植瘤模型

重点核对

FH变异体的催化效率(通过体外酶活测定) 延胡索酸/苹果酸比值与代谢物水平的相关性 嘌呤补救途径酶APRT和HPRT1的表达及功能 6-MP处理对细胞增殖和肿瘤生长的抑制作用

摘要

由于延胡索酸水合酶(FH)缺失导致的延胡索酸积累驱动细胞转化。FH种系改变导致遗传性平滑肌瘤病和肾细胞癌(HLRCC),该病患者易患一种侵袭性肾癌。目前对FH变异按癌症相关风险进行分类的需求尚未满足。我们量化了74个意义不确定变异的催化效率。其中超过一半的变异在酶学上无活性,这是致病性的有力证据。接下来,我们构建了一组表达具有一系列催化活性的FH变异的HLRCC细胞系,然后将延胡索酸水平与代谢特征相关联。我们发现延胡索酸积累阻断从头嘌呤生物合成,使FH缺陷细胞增殖依赖于嘌呤补救途径。遗传或药理学抑制嘌呤补救途径可减少体内HLRCC肿瘤生长。这些发现表明患者相关的FH变异的致病性,并揭示嘌呤补救途径是FH缺陷肿瘤的一个可靶向的脆弱性。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
FH变异是否具有致病性,以及延胡索酸积累如何影响HLRCC细胞的代谢和增殖?
核心机制
延胡索酸积累驱动ADSL催化反应逆转,促进SAICAR和腺苷酸琥珀酸的生成,阻断从头嘌呤生物合成,使FH缺陷细胞依赖嘌呤补救途径维持核苷酸库和增殖。
主要证据
在HLRCC细胞系中通过稳定同位素示踪显示延胡索酸促进ADSL逆转,导致AICAR积累减少和SAICAR增加;CRISPR敲除APRT/HPRT1或6-MP处理抑制细胞增殖和异种移植瘤生长。
研究意义
该研究为FH变异致病性分类提供了功能证据,并揭示嘌呤补救途径是FH缺陷肿瘤的潜在治疗靶点,支持重新利用6-MP等临床药物。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

FH变异的生化分类

评估FH变异的催化活性和多聚化状态,以推断其致病性

从大肠杆菌中表达并纯化重组FH蛋白,通过分光光度法测定催化效率,并利用非变性凝胶电泳分析多聚化状态。

2

构建不同FH活性水平的细胞系

研究不同延胡索酸积累水平对HLRCC细胞代谢的影响

在NCCFH1细胞中表达GFP、野生型FH或不同催化效率的FH变异体,通过LC-MS分析代谢物。

3

延胡索酸积累对代谢途径的影响

确定延胡索酸积累如何影响TCA循环、谷胱甘肽合成和嘌呤生物合成

通过稳定同位素标记(U-13C-谷氨酰胺、U-13C-葡萄糖、3,3,3',3'-2H-胱氨酸)结合LC-MS追踪代谢通量,并进行代谢物集富集分析。

4

验证嘌呤补救途径依赖性

验证FH缺陷细胞是否依赖嘌呤补救途径,并测试抑制该途径的影响

通过CRISPR敲除APRT和HPRT1,或在人血浆样培养基中补充腺嘌呤和鸟嘌呤,观察细胞增殖变化;使用6-MP处理细胞和异种移植瘤模型。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
HisPur钴离心柱Thermo Fisher--
RPMI培养基----
DMEM培养基----
胎牛血清----
青霉素/链霉素----
聚凝胺----
杀稻瘟菌素----
SeQuant ZIC-pHILIC聚合物色谱柱EMD Millipore--
Q-Exactive质谱仪Thermo Scientific--
Vanquish超高效液相色谱系统Thermo Scientific--
抗2SC抗体Cambridge Research Biochemicalscrb2005017
GFP抗体Cell Signaling Technology2956
FH抗体Cell Signaling Technology4567
V5-HRP抗体Thermo Fisher ScientificR961-25
α-微管蛋白抗体Sigma-AldrichT6074
6-巯基嘌呤----
U-13C-葡萄糖Cambridge Isotope Laboratories--
U-13C-谷氨酰胺Cambridge Isotope Laboratories--
3,3,3',3'-2H-胱氨酸Cambridge Isotope Laboratories--
酰胺-15N-谷氨酰胺Cambridge Isotope Laboratories--
8-13C-腺嘌呤Cambridge Isotope Laboratories--
8-13C-鸟嘌呤Cambridge Isotope Laboratories--
Vybrant DyeCycle Green染料Thermo Fisher--
Annexin V, Alexa Fluor 647偶联物Thermo Fisher--
QuikChange II试剂盒Agilent--
Gibson克隆NEB--
BL21-STAR大肠杆菌----
异丙基硫代半乳糖苷----
卡那霉素----
溶菌酶----
Bradford试剂----
Agilent BioTek Synergy H1酶标仪Agilent--
Mini-PROTEAN TGX凝胶BioRad--
NativeMark非染色蛋白标准品Thermo Fisher--
BD LSRFortessa流式细胞仪BD--
基质胶----
NSG小鼠----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
FH变异体的表达与纯化
FH重组蛋白在大肠杆菌中的表达条件(IPTG浓度、诱导时间)、纯化方法(HisPur柱)
阅读提示:Methods: Bacteria-expression plasmid cloning, Recombinant FH and cell-free assays
细胞培养与处理
细胞系来源、培养基组成、传代条件、转导方法(lentivirus)、筛选药物(blasticidin)
阅读提示:Methods: Cell lines, cell culture and reagents; Lentivirus production and transduction
代谢组学分析
LC-MS参数(色谱柱、流动相、梯度)、数据处理流程(MZmine、AccuCor)、内标使用
阅读提示:Methods: LC-MS and analysis
嘌呤补救途径抑制实验
6-MP浓度和给药方式、细胞培养条件、肿瘤异种移植模型建立
阅读提示:Results: Targeting purine salvage reduces HLRCC tumor growth; Methods: Mouse cell line xenografts