验证bomedemstat在SCLC模型中的活性
评估bomedemstat对SCLC细胞系和PDX模型的生长抑制及分子效应
使用CellTiter-Glo检测细胞活力,免疫印迹和RNA测序分析NOTCH通路及ASCL1靶基因表达
Inhibition of LSD1 with Bomedemstat Sensitizes Small Cell Lung Cancer to Immune Checkpoint Blockade and T-Cell Killing
包含体外细胞系实验、基因敲除验证、同基因免疫活性小鼠模型、流式细胞术、RNA测序及T细胞杀伤实验等多个独立证据层级,并进行功能与机制验证。
RP-48OVA-LLO190同基因小鼠SCLC移植瘤模型 FHSC04患者来源异种移植瘤(PDX)模型 人SCLC细胞系NCI-H510和NCI-H146 鼠SCLC细胞系RP-48、RP-116、G8545和FH-B6RP1
Bomedemstat给药剂量:小鼠45 mg/kg/天(C57BL/6NJ),NSG小鼠25 mg/kg/天或40 mg/kg/天(周期内第1-5天) 抗PD1抗体给药:250 μg,每周两次,腹腔注射 肿瘤处理起始体积:约150 mm³ IFN-γ处理浓度和时间:10 ng/mL,最后24-48小时 T细胞杀伤实验效应细胞与靶细胞比例:2:1(T细胞:肿瘤细胞)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估bomedemstat对SCLC细胞系和PDX模型的生长抑制及分子效应
使用CellTiter-Glo检测细胞活力,免疫印迹和RNA测序分析NOTCH通路及ASCL1靶基因表达
测试LSD1抑制是否增强PD1阻断的抗肿瘤效果
在C57BL/6小鼠中建立RP-48OVA-LLO190皮下肿瘤,给予bomedemstat、抗PD1或联合治疗,监测肿瘤生长及免疫浸润
探究bomedemstat对肿瘤免疫浸润的影响
通过流式细胞术分析肿瘤中CD45+细胞亚群(CD8+、CD4+、巨噬细胞、NK细胞、中性粒细胞等)的频率
验证LSD1抑制是否上调肿瘤细胞表面MHC-I
通过流式细胞术检测体外培养的SCLC细胞和体内肿瘤细胞中H-2Kb或pan-MHC-I的表达水平
确认MHC-I上调是LSD1特异性的
使用CRISPR敲除LSD1,检测NOTCH通路蛋白表达和MHC-I表面水平
验证bomedemstat处理的SCLC细胞是否增强抗原特异性T细胞的细胞毒性
共培养bomedemstat预处理的RP-48OVA-LLO190细胞与OT-I或非特异性CD8+ T细胞,检测CD107a脱颗粒和靶细胞存活率
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | 11965092 |
| 胎牛血清 | Peak Serum | PS-FB2 | |
| β-巯基乙醇 | Fisher Scientific | 501147851 | |
| 青霉素-链霉素 | Thermo Fisher Scientific | 15140122 | |
| 重组人胰岛素锌溶液 | Thermo Fisher Scientific | 12585-014 | |
| DMEM/F-12培养基 | Thermo Fisher Scientific | 11320033 | |
| 胰岛素-转铁蛋白-硒 | Thermo Fisher Scientific | 41400045 | |
| 氢化可的松 | Sigma | H0135 | |
| β-雌二醇 | Sigma | E2257 | |
| RPMI 1640培养基 | Thermo Fisher Scientific | 11875093 | |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解液 | Cell Signaling | 9806 |
| Pierce BCA蛋白测定试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23227 | |
| 免疫印迹 | 抗REST抗体 | Fisher Scientific | 07-579 |
| 抗NOTCH1抗体 | Cell Signaling | 3608 | |
| 抗NOTCH2抗体 | Cell Signaling | 5732 | |
| 抗MASH1(ASCL1)抗体 | BD Pharmingen | 556604 | |
| 抗HES1抗体 | Cell Signaling | 11988 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-398103 | |
| 抗RIG-1抗体 | Proteintech | 20566-1-AP | |
| 抗PDL1(小鼠)抗体 | R&D Systems | MAB90781-SP | |
| 抗PDL1(人)抗体 | Cell Signaling | 13684 | |
| 抗β2-微球蛋白抗体 | Proteintech | 13511-1-AP | |
| 抗MDA5抗体 | Proteintech | 21775-1-AP | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | 66009-1-lg | |
| 抗LSD1抗体 | Cell Signaling | 2184 | |
| 抗NOTCH1胞内域抗体 | Cell Signaling | 4147 | |
| 抗STING抗体 | Cell Signaling | 13647 | |
| 药物处理 | Bomedemstat | Imago Biosciences | -- |
| 吐温-80 | -- | -- | |
| 羧甲基纤维素钠盐 | -- | -- | |
| 抗PD1抗体 | Bio X Cell | BE0146 | |
| 细胞系构建 | Lipofectamine 2000转染试剂 | ThermoFisher | 11668019 |
| pUMVC质粒 | Addgene | #8449 | |
| pCMV-VSV-G质粒 | Addgene | #8454 | |
| lentiCRISPRv2载体 | Addgene | #52961 | |
| psPAX2包装质粒 | Addgene | #12260 | |
| pMD2.G包装质粒 | Addgene | #12259 | |
| 嘌呤霉素 | InvivoGen | ANTPR1 | |
| 流式细胞术 | 可固定活力染料 | eBioscience | 65-0865-14 |
| 脱氧核糖核酸酶 | Worthington | LS00206 | |
| I型胶原酶 | Worthington | CLS-1 | |
| ACK裂解缓冲液 | Gibco | -- | |
| 抗CD45抗体 | BioLegend | 30-F11 | |
| 抗CD3抗体 | BioLegend | 145-2C11 | |
| 抗CD4抗体 | BioLegend | RM4-5 | |
| 抗CD8抗体 | BD Biosciences | 53-6.7 | |
| 抗CD19抗体 | BioLegend | 6D5 | |
| 抗CD11b抗体 | BD Biosciences | M1/70 | |
| 抗CD11c抗体 | BioLegend | N418 | |
| 抗Ly6C抗体 | BioLegend | HK1.4 | |
| 抗Ly6G抗体 | BD Biosciences | 1A8 | |
| 抗F4/80抗体 | BioLegend | BM8 | |
| 抗NK1.1抗体 | BD Biosciences | PK136 | |
| 抗H-2Kb抗体 | BioLegend | AF6-88.5 | |
| Live/Dead可固定水色死细胞染色试剂盒 | Invitrogen | -- | |
| Foxp3/转录因子染色缓冲液套装 | eBioscience | -- | |
| RNA测序 | TRIzol试剂 | -- | -- |
| NEBNext Ultra RNA文库制备试剂盒(Illumina) | New England Biolabs | E7530L | |
| 流式细胞术 | 重组小鼠IFN-γ | Peprotech | 315-05 |
| 重组人IFN-γ | Sigma | I17001 | |
| 药物处理 | 二苯并氮杂䓬(DBZ) | Selleckchem | S2711 |
| RO4929097 (RO4) | Selleckchem | S1575 | |
| T细胞分离 | 小鼠CD8+ T细胞负选分离试剂盒 | Stemcell | 19853 |
| T细胞刺激 | 抗CD3抗体 | Biolegend | 145-2C11 |
| 抗CD28抗体 | Biolegend | 37.51 | |
| 重组小鼠IL-2 | Peprotech | 212-12 | |
| 流式细胞术 | 计数微球 | Polybead | 18328-5 |
| 抗CD107a抗体 | Biolegend | 1D4B |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基成分、培养条件(37°C,5% CO2) 阅读提示:参见Materials and Methods中的Cell culture |
| 药物处理 | bomedemstat浓度(体外1 μM,体内25-45 mg/kg),抗PD1剂量(250 μg),给药途径(口服,腹腔),给药方案(每日或每周两次) 阅读提示:参见Materials and Methods中的Drug preparation和In vivo drug treatments |
| 肿瘤模型建立 | 细胞接种数量、Matrigel比例、接种部位(左 flank)、起始治疗体积(~150 mm³) 阅读提示:参见Materials and Methods中的Flank tumor generation and measurement |
| 流式细胞术分析 | 肿瘤消化时间(45分钟)、酶浓度(DNase 80 U/mL,胶原酶I 300 U/mL)、抗体克隆和稀释倍数 阅读提示:参见Materials and Methods中的Flow cytometry of RP-48OVA-LLO190 flank tumors |
| T细胞杀伤实验 | T细胞分离方法(负选)、刺激条件(抗CD3/CD28,IL-2 50 U/mL)、共培养比例(2:1)、时间(24小时) 阅读提示:参见Materials and Methods中的RP-48OVA-LLO190 and cytotoxic T cell co-culture |