一种修饰核苷6-硫代-2'-脱氧鸟苷在胶质瘤中表现出抗肿瘤活性

A Modified Nucleoside 6-Thio-2'-Deoxyguanosine Exhibits Antitumor Activity in Gliomas

作者信息Shengnan Yu, Shiyou Wei, Milan Savani, Xiang Lin, Kuang Du, Ilgen Mender, Silvia Siteni, Themistoklis Vasilopoulos, Zachary J Reitman, Yin Ku, Di Wu, Hao Liu, Meng Tian, Yaohui Chen, Marilyne Labrie, Casey M Charbonneau, Eric Sugarman, Michelle Bowie, Seethalakshmi Hariharan, Matthew Waitkus, Wen Jiang, Roger E McLendon, Edward Pan, Mustafa Khasraw, Kyle M Walsh, Yiling Lu, Meenhard Herlyn, Gordon Mills, Utz Herbig, Zhi Wei, Stephen T Keir, Keith Flaherty, Lunxu Liu, Kongming Wu, Jerry W Shay, Kalil Abdullah, Gao Zhang, David M Ashley
PMID34593527
发布时间2021-12-15
DOI10.1158/1078-0432.CCR-21-0374

实验完整度

包含体外细胞系、神经球、PDO、异种移植及PDX模型,涵盖细胞活力、凋亡、DNA损伤检测及转录组和蛋白质组分析。

主要模型

人类胶质瘤细胞系 小鼠胶质瘤细胞系 患者来源的异种移植瘤模型 患者来源的类器官模型

重点核对

THIO处理浓度(0.01-100μM)和处理时间(4天等) 细胞活力检测方法(CCK-8)及IC50计算 凋亡和细胞死亡检测(PSVue 643和PI染色) DNA损伤检测(γH2AX免疫荧光和免疫印迹) 体内给药剂量(3mg/kg)和给药方案(隔日一次)

摘要

目的:探讨一种新型端粒靶向抑制剂6-硫代-2'-脱氧鸟苷(THIO)在胶质瘤体内外的治疗作用。实验设计:使用一组人和小鼠胶质瘤细胞系,通过细胞活力测定、流式细胞术分析和免疫荧光检测THIO的治疗效果。整合分析RNA测序和反相蛋白阵列数据,揭示THIO的潜在抗肿瘤机制。使用四个患者来源的异种移植瘤(PDX)、两个患者来源的类器官(PDO)和两个人胶质瘤细胞系异种移植瘤进一步研究THIO的治疗效果。结果:THIO对大多数人和小鼠胶质瘤细胞系有效,对正常星形胶质细胞无明显毒性。THIO单药治疗在三个获得性TMZ耐药的胶质瘤细胞系中表现出疗效。此外,THIO通过诱导凋亡性细胞死亡,在四个人胶质瘤细胞系神经球中显示出疗效。机制上,THIO不仅在胶质瘤细胞系中诱导端粒DNA损伤,而且在PDX肿瘤标本中也诱导端粒DNA损伤。转录组和蛋白质组数据的整合计算分析表明,THIO显著抑制细胞侵袭、干细胞和增殖通路,同时触发DNA损伤和凋亡。重要的是,THIO在两个PDO模型中显著降低肿瘤增殖,并减小了GBM异种移植瘤和PDX模型中的肿瘤大小。结论:本研究确立了THIO在原发性和复发性胶质瘤中的治疗作用,并揭示急性诱导端粒DNA损伤是THIO在胶质瘤中的主要抗肿瘤机制。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
探讨端粒靶向抑制剂THIO在胶质瘤中的治疗作用及其潜在机制。
核心机制
THIO通过诱导端粒DNA损伤,抑制细胞增殖、侵袭和干性相关信号通路,从而发挥抗肿瘤作用。
主要证据
体外细胞系和神经球实验表明THIO诱导凋亡和DNA损伤;PDO和异种移植模型显示肿瘤生长抑制;转录组和蛋白质组分析揭示了相关通路变化。
研究意义
THIO为原发性和复发性胶质瘤提供新的治疗策略,并支持其进入临床试验。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

体外细胞系药物敏感性筛选

评估THIO对胶质瘤细胞系增殖和凋亡的影响

使用17种人胶质瘤细胞系和3种小鼠细胞系,CCK-8测定细胞活力并计算IC50,FACS分析凋亡和细胞死亡,CellTrace Violet追踪细胞分裂。

2

长期处理和3D神经球实验

评估THIO对细胞增殖和神经球生长的影响

17种细胞系经THIO处理8-14天后进行结晶紫染色;神经球经THIO处理后监测生长和细胞死亡。

3

DNA损伤和端粒功能检测

验证THIO诱导的DNA损伤及其定位

Western blot和免疫荧光检测γH2AX表达;TIF实验检测端粒区域DNA损伤;PDX肿瘤组织γH2AX免疫组化。

4

转录组和蛋白质组分析

揭示THIO的分子机制

RNAseq分析M059K、H4、D2224MG和DBTRG-05MG细胞;RPPA分析M059K、LN229和U87MG细胞。

5

体内药效评估

评估THIO在体内对肿瘤生长的抑制效果

使用U87MG和U251MG异种移植模型及GBM PDX模型,THIO治疗并测量肿瘤体积和Ki-67表达。

6

患者来源类器官(PDO)实验

评估THIO在PDO模型中的抗增殖作用

UTSW128和UTSW96 PDO经THIO单药或联合放疗处理,检测Ki-67表达。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
DMEM培养基ThermoFisher11995073
胎牛血清HycloneSH30071.03
星形胶质细胞生长培养基Sigma821-500
干细胞培养基Stemcell Technologies5751
人表皮生长因子Stemcell Technologies78006
人碱性成纤维细胞生长因子Stemcell Technologies78003
肝素Stemcell Technologies7980
6-硫代-2'-脱氧鸟苷----
替莫唑胺Sigma-Aldrich14163
BIBR1532Cayman Chemical16608
PSVue 643MTTIP-1006
碘化丙啶Alfa Aesar25535-16-4
CellTrace VioletInvitrogenC34557
CCK-8试剂盒APEBIOK1018
DAPICell Signaling Technologies8961
抗Ki-67抗体Cell Signaling Technologies11882
RIPA裂解液ThermoFisher89900
蛋白酶抑制剂ThermoFisher78440
NuPage Bis-Tris凝胶ThermoFisherNP0336
PVDF膜BioRad1620264
牛血清白蛋白Sigma-AldrichA7906-100G
ECL化学发光底物ThermoFisher34080
抗cleaved-PARP抗体Cell Signaling Technologies5625
抗p21抗体Cell Signaling Technologies2947
抗p27kip1抗体Cell Signaling Technologies3686
抗Rb抗体Cell Signaling Technologies9309
抗磷酸化Rb抗体Cell Signaling Technologies8516
抗AXL抗体Proteintech13196-1-AP
抗ATRX抗体Novus BiologicalsNBP1-32851
抗PDGFRβ抗体Proteintech13449-1-AP
抗HSP70抗体Proteintech10995-1-AP
抗γH2AX抗体Cell Signaling Technologies9718T
抗β-actin抗体Cell Signaling Technologies12620S
抗兔IgG-HRP抗体Cell Signaling Technologies7074S
抗小鼠IgG-HRP抗体Cell Signaling Technologies7076S
miRNeasy微型试剂盒Qiagen217004
cDNA合成试剂盒ThermoFisherK1651
Fast SYBR Green预混液ThermoFisher4385610
实时荧光定量PCR检测系统BioRad--
DNA微型试剂盒Qiagen51304
AccutaseVWR490007-741
ECHO Revolve显微镜ECHO--
活/死细胞活力检测试剂盒Sigma-AldrichCBA415
衰老β-半乳糖苷酶染色试剂盒Cell Signaling Technologies9860
TRAPeze RT端粒酶检测试剂盒--S7710
DC蛋白定量试剂盒BioRad5000111
γH2AX抗体Millipore--
Alexafluor 488偶联的山羊抗小鼠二抗Invitrogen--
Cy5标记的PNA Tel-C探针Panagene--
Vectashield/DAPI封片剂Vector Laboratories--
Axio Imager Z2显微镜Carl Zeiss--
无胸腺裸鼠----
NCG小鼠----
DMSO-PBS溶液----
Triton X-100ThermoFisher9002-93-1
正常山羊血清Cell Signaling Technologies5425
Alexaflour 568偶联的山羊抗兔二抗----
Wizard基因组DNA纯化试剂盒Promega--
Gentra Puregene试剂盒Qiagen--
Agilent SureSelect人类全外显子V6试剂盒Agilent--
HiSeq PE150测序平台Illumina--
HiSeq 2500测序平台Illumina--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞系来源与培养
细胞系身份认证(STR)和支原体检测;培养基类型和补充因子
阅读提示:Materials and Methods - Cell lines
药物处理
THIO、TMZ、BIBR1532的溶剂和浓度;处理时间
阅读提示:Materials and Methods - Drug preparation; Results - Figure 1 and 2
细胞活力检测
细胞接种密度,CCK-8试剂的使用和检测时间
阅读提示:Materials and Methods - Cell viability assay; Results - Figure 1A
凋亡和细胞死亡分析
PSVue 643和PI染色浓度;流式细胞仪设置
阅读提示:Materials and Methods - FACS analysis of apoptosis
DNA损伤检测
γH2AX抗体使用条件;TIF实验的处理浓度和时间
阅读提示:Materials and Methods - DNA damage detection, TIF assay; Results - Figure 3
体内实验
小鼠品系和性别;THIO剂量、给药途径和频率;肿瘤体积测量方法
阅读提示:Materials and Methods - In vivo study; Results - Figure 6
转录组和蛋白质组分析
RNA-seq和RPPA的处理条件;差异表达和GSEA分析的参数
阅读提示:Materials and Methods - RNAseq, RPPA; Results - Figure 4 and 5