患者和对照样本收集
获取IIM患者和对照的肌肉活检标本用于分析。
收集了129例满足2017年EULAR/ACR标准的IIM患者和73例对照(57例非IIM肌病和16例正常肌肉)的肌肉活检标本。另外收集了68例IIM患者和14例对照作为验证队列。
Expression of CD163 and major histocompatibility complex class I as diagnostic markers for idiopathic inflammatory myopathies
包含患者肌肉活检样本(IIM与对照)的免疫组化检测、CART算法开发及验证队列验证,涵盖体外模型和临床样本等多个证据层级。
患者肌肉活检样本 对照肌肉活检样本(非炎性肌病和正常肌肉)
CD163在肌纤维中的表达模式(尤其内膜或内膜/血管周围) MHC I类在肌纤维中的表达 组织病理学特征(如纤维大小变异、萎缩纤维、坏死等) 患者是否满足2017 EULAR/ACR标准
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取IIM患者和对照的肌肉活检标本用于分析。
收集了129例满足2017年EULAR/ACR标准的IIM患者和73例对照(57例非IIM肌病和16例正常肌肉)的肌肉活检标本。另外收集了68例IIM患者和14例对照作为验证队列。
评估肌活检标本的组织病理学特征以识别IIM相关特征。
使用H&E染色评估了肌纤维大小变异、萎缩纤维、坏死、内部核、虫蚀样纤维、中央核样区域、纤维分裂和束周萎缩等特征,并由神经病理学家分级判断。
评估炎症相关标志物的表达,以区分IIM和对照。
对IIM和对照组肌肉活检标本进行了CD3、CD4、CD8、CD20、CD68、CD163、MX1、MHC I类、MHC II类和HLA-DR的免疫组化染色。根据染色模式(内膜、血管周围/肌束膜)和表达程度(轻度<5%、中度5-50%、重度>50%)进行半定量分析。
基于免疫组化结果开发诊断算法,以区分IIM患者和对照。
使用CART分析对IIM患者和对照进行分类,确定最佳预测变量组合。开发了两种算法:算法1(CD163表达+CD163在内膜或内膜/血管周围区域表达+MHC I类在肌纤维上的表达)和算法2(IIM相关组织病理学特征+算法1)。
验证所提算法在独立验证队列中的诊断性能。
在验证队列中评估了算法1和算法2的敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值和准确率。此外,还将算法应用于未满足2017年EULAR/ACR标准但由专家诊断为IIM的患者,以评估其辅助诊断价值。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组织化学染色 | BenchMark XT自动染色仪 | Ventana Medical Systems, Inc. | -- |
| 免疫组织化学染色(CD3) | 抗CD3抗体 | DAKO | A0452 |
| 免疫组织化学染色(CD4) | 抗CD4抗体 | VENTANA | 790-4423 |
| 免疫组织化学染色(CD8) | 抗CD8抗体 | CELL MARQUE | M7103 |
| 免疫组织化学染色(CD20) | 抗CD20抗体 | DAKO | M0755 |
| 免疫组织化学染色(CD68) | 抗CD68抗体 | DAKO | M0814 |
| 免疫组织化学染色(CD163) | 抗CD163抗体 | CELL MARQUE | 163M-16 |
| 免疫组织化学染色(MX1) | 抗MX1抗体 | GENETEX | GTX110256 |
| 免疫组织化学染色(MHC I类) | 抗HLA I类ABC抗体 | Abcam | ab70328 |
| 免疫组织化学染色(MHC II类) | 抗HLA-DR+DP+DQ抗体 | Abcam | ab7856 |
| 免疫组织化学染色(HLA-DR) | 抗HLA-DR抗体 | Abcam | ab20181 |
| 免疫组织化学染色检测 | OptiView DAB免疫组化检测试剂盒 | Roche Tissue Diagnostics | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 样本采集 | 样本类型:肌肉活检;患者分组:IIM(符合2017 EULAR/ACR标准)和对照(非炎性肌病和正常肌肉);样本量:分析集129例IIM和73例对照,验证集68例IIM和14例对照。 阅读提示:Materials and methods中的Patients部分 |
| 组织病理学评估 | 评估的病理特征包括纤维大小变异、萎缩纤维、坏死、内部核、虫蚀样纤维、中央核样、纤维分裂、束周萎缩;评分标准:阴性、轻度、中度、重度;由单一神经病理学家盲法评估。 阅读提示:Materials and methods中的Histopathologic analysis部分 |
| 免疫组化染色 | 切片厚度4μm;一抗稀释比例:CD3 1:100, CD4 1:16, CD8 1:400, CD20 1:400, CD68 1:2000, CD163 1:400, MX1 1:500, MHC I类 1:10000, MHC II类 1:2500, HLA-DR 1:5000;使用BenchMark XT自动染色仪;检测试剂盒OptiView DAB;未使用阴性对照。 阅读提示:Materials and methods中的Immunohistochemical staining部分 |
| 算法开发 | CART分析使用R包rpart;预测变量包括免疫组化结果和组织病理学特征;算法1和算法2的具体组成需核对。 阅读提示:Materials and methods中的Statistical analysis部分和Results中的相应描述 |
| 验证 | 独立验证队列包括68例IIM和14例对照;额外验证组包括17例未满足标准但由专家诊断的IIM患者。 阅读提示:Materials and methods中的Patients部分和Results中的验证结果 |