检测TWIST1在瘢痕疙瘩组织和细胞中的表达
明确TWIST1在瘢痕疙瘩发病中的表达水平变化。
通过免疫组化、RT-PCR和Western blot检测瘢痕疙瘩组织及配对正常皮肤组织中TWIST1的表达,并在原代KFBs和NFBs中验证。
Twist-related protein 1 promotes transforming growth factor β receptor 1 in keloid fibroblasts via regulating the stability of myocyte enhancer factor 2A
包含患者组织样本、原代细胞体外实验、功能验证(增殖/侵袭/活化)、机制验证(Co-IP、质谱、泛素化、ChIP、双荧光素酶)等,但缺乏体内动物模型验证。
患者瘢痕疙瘩组织及配对正常皮肤组织(10例) 原代瘢痕疙瘩来源成纤维细胞(KFBs) 原代正常皮肤来源成纤维细胞(NFBs)
TWIST1在KFBs中的敲低(si-TWIST1-001)和过表达(慢病毒)处理; TGF-β1(5、10 ng/ml)诱导实验; MG132(10 μmol/l)处理; CHX(10 μg/ml)追踪实验; MEF2A敲低(si-MEF2A)及TWIST1过表达联合处理
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确TWIST1在瘢痕疙瘩发病中的表达水平变化。
通过免疫组化、RT-PCR和Western blot检测瘢痕疙瘩组织及配对正常皮肤组织中TWIST1的表达,并在原代KFBs和NFBs中验证。
验证TWIST1对KFB恶性表型的调控作用。
通过siRNA敲低和慢病毒过表达TWIST1,采用CCK-8和Transwell实验检测KFB增殖和侵袭能力,并通过免疫荧光检测α-SMA表达。
明确TWIST1下游信号通路的改变。
通过RT-PCR和Western blot检测TWIST1敲低或过表达后TβR1、Smad2、Smad3、α-SMA、COL1、COL3的表达。
探索TWIST1调控MEF2A的机制。
通过Co-IP和质谱鉴定TWIST1相互作用蛋白,验证TWIST1与MEF2A结合;通过Western blot检测TWIST1对MEF2A蛋白表达的影响;通过CHX追踪和MG132处理及泛素化实验评估MEF2A的稳定性。
确认MEF2A作为TWIST1下游效应的关键分子。
在TWIST1过表达的KFBs中敲低MEF2A,检测细胞增殖、侵袭和α-SMA表达及TβR1、Smad3等蛋白水平。
确定MEF2A在TβR1转录调控中的作用。
通过ChIP-qPCR和双荧光素酶报告基因实验验证MEF2A与TβR1启动子的结合及转录激活。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 组织染色与免疫组化 | TWIST1抗体 | CST | 69366 |
| MEF2A抗体 | Santa Cruz | sc-17785 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | HyClone | -- |
| 胎牛血清 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 青霉素/链霉素 | HyClone | -- | |
| 转化生长因子-β1 | HZbscience | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Scientific | -- |
| RT-PCR | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RevertAid第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| PowerUp SYBR Green预混液 | Thermo Scientific | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0012 | |
| 化学发光检测试剂盒 | Beyotime | P0018S | |
| 免疫荧光 | α-SMA抗体 | Proteintech | 14395-1-AP |
| Alexa Fluor 488荧光二抗 | Beyotime | A0423 | |
| DAPI染色液 | Beyotime | C1006 | |
| 细胞增殖 | CCK-8试剂盒 | Dojindo Laboratories | -- |
| 细胞侵袭 | 基质胶 | BD Biosciences | -- |
| 结晶紫 | Olympus | -- | |
| Co-IP | 蛋白A/G琼脂糖 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 泛素化实验 | MG132蛋白酶体抑制剂 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | -- | |
| ChIP | 免疫球蛋白G | Thermo Scientific | 26157 |
| 双荧光素酶报告 | 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Yeasen Biotechnology | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 标本收集 | 患者数量及配对的正常皮肤和瘢痕疙瘩组织来源 阅读提示:Methods - Specimen collection |
| 细胞培养 | 细胞培养基、血清浓度、细胞代数(4-7代) 阅读提示:Methods - Cell isolation and culture |
| TGF-β1处理 | TGF-β1浓度(5和10 ng/ml)及处理时间 阅读提示:Methods - Cell isolation and culture |
| 基因敲低与过表达 | siRNA序列(si-TWIST1-001)、质粒/慢病毒、感染复数(MOI=10)、筛选条件(2 mg/l嘌呤霉素) 阅读提示:Methods - Transfection and grouping of fibroblasts |
| 细胞增殖检测 | 细胞接种密度(5000细胞/孔)、检测时间点(0, 24, 48, 72, 96h)、CCK-8试剂添加量(10μl) 阅读提示:Methods - Cell counting kit-8 assay |
| 细胞侵袭检测 | Transwell孔径(8μm)、Matrigel稀释比例(1:9)、细胞数(5000细胞/孔)、染色方法(0.5%结晶紫) 阅读提示:Methods - Matrigel invasion assays |
| 泛素化检测 | MG132浓度(10 μmol/l)及处理时间(12h) 阅读提示:Methods - Ubiquitination assays |
| CHX追踪 | CHX浓度(10 μg/ml)及时间点 阅读提示:Figure 5 legend |