建立缺血皮瓣模型及剂量-效应评估
确定FFA的最佳治疗剂量并建立缺血皮瓣损伤模型。
在雄性C57BL/6J小鼠背部制作1.5×4.5 cm²的McFarlane皮瓣模型,术后给予不同剂量FFA(0, 3, 6, 12, 24, 48 mg/kg/天)处理7天,评估皮瓣存活率。
Flufenamic acid inhibits pyroptosis in ischemic flaps via the AMPK-TRPML1-Calcineurin signaling pathway
包含小鼠缺血皮瓣模型、细胞实验(HUVECs)、分子对接与SPR等体外验证,并通过AAV-shTFE3及多种抑制剂进行功能验证和机制验证。
小鼠缺血皮瓣模型(C57BL/6J小鼠,McFarlane皮瓣) 人脐静脉内皮细胞(HUVECs)
FFA给药剂量:12 mg/kg/天,腹腔注射 动物模型:雄性C57BL/6J小鼠,6-8周龄,体重20-30 g TFE3敲低:AAV-TFE3 shRNA尾静脉注射 信号通路抑制剂:CC(AMPK抑制剂)、ML-SI1(TRPML1抑制剂)、他克莫司(钙调磷酸酶抑制剂) 检测时间点:术后第7天评估皮瓣存活率与血流
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定FFA的最佳治疗剂量并建立缺血皮瓣损伤模型。
在雄性C57BL/6J小鼠背部制作1.5×4.5 cm²的McFarlane皮瓣模型,术后给予不同剂量FFA(0, 3, 6, 12, 24, 48 mg/kg/天)处理7天,评估皮瓣存活率。
验证FFA是否改善缺血皮瓣的存活和血供。
术后第7天,通过LDBF检测血流,计算皮瓣存活面积,并通过HE染色、CD31/EMCN免疫荧光、F-CHP染色评估血管密度和胶原降解。
明确FFA是否抑制缺血皮瓣中的细胞焦亡。
通过免疫荧光和Western blot检测焦亡相关蛋白(NLRP3、ASC、Caspase-1、GSDMD-N、IL-1β、IL-18)的表达水平。
探究FFA是否通过降低氧化应激来抑制细胞焦亡。
使用DHE染色检测ROS水平,并通过Western blot检测抗氧化酶SOD1、HO1、eNOS的表达。使用SOD1抑制剂ATN-224验证ROS在FFA作用中的部分作用。
验证FFA是否通过诱导自噬来保护缺血皮瓣。
通过免疫荧光和Western blot检测自噬相关蛋白LC3、Beclin1、VPS34、CTSD、p62,并使用自噬抑制剂3MA阻断自噬,观察对皮瓣存活和焦亡的影响。
确定FFA是否通过上调TFE3核水平来促进自噬和减少氧化应激。
使用AAV-TFE3 shRNA敲低TFE3表达,检测TFE3在细胞质和核内的蛋白水平,以及自噬、氧化应激和焦亡相关蛋白的变化。
证明FFA直接结合AMPK,为上游机制提供依据。
通过分子对接预测FFA与AMPK的结合模式,并通过CETSA和SPR实验验证FFA对AMPK热稳定性和结合动力学的影响。
证实FFA通过AMPK-TRPML1-钙调磷酸酶通路调节TFE3活性。
使用AMPK抑制剂CC、TRPML1抑制剂ML-SI1、钙调磷酸酶抑制剂他克莫司,检测通路蛋白(p-AMPK、p-mTOR、TRPML1、钙调磷酸酶)和TFE3核水平的变化,并评估对皮瓣存活的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型构建 | 4-0非吸收性丝线 | -- | -- |
| 药物处理 | 氟芬那酸 | MCE | HY-B1221 |
| 3-甲基腺嘌呤 | Sigma-Aldrich | M9281 | |
| 化合物C | Med Chem Express | 866405-64-3 | |
| ML-SI1 | MCE | HY-134818 | |
| 他克莫司 | MCE | HY-13756 | |
| ATN-224 | Med Chem Express | HY-16074 | |
| 免疫荧光 | 抗TFE3抗体 | Sigma-Aldrich | HPA023881 |
| 抗EMCN抗体 | Proteintech | ab106100 | |
| 抗Caspase-1抗体 | Abcam | 22915-1-AP | |
| 抗LC3抗体 | Cell Signaling Technology | 3868 | |
| 抗CD31抗体 | Servicebio | GB12063 | |
| DAPI | Abcam | ab104139 | |
| 山羊抗兔IgG H&L (Alexa Fluor 594) | Abcam | ab150113 | |
| 山羊抗兔IgG H&L (Alexa Fluor 488) | Abcam | ab150080 | |
| 二氢乙锭 | -- | -- | |
| 组织学检测 | 5-FAM标记的胶原杂交肽 | 3Helix | FLU300, FLU60 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 抗AMPK抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗p-AMPK抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗mTOR抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗p-mTOR抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗Beclin1抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗eNOS抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗LC3抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗NLRP3抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗p-TFE3抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | -- | |
| 抗Caspase-1抗体 | Proteintech | 22915-1-AP | |
| 抗组织蛋白酶D抗体 | Proteintech | -- | |
| 抗HO-1抗体 | Proteintech | -- | |
| 抗组蛋白H3抗体 | Proteintech | -- | |
| 抗SOD1抗体 | Proteintech | -- | |
| 抗VEGFA抗体 | Abcam | -- | |
| 抗SQSTM1/p62抗体 | Abcam | -- | |
| 抗TRPML1抗体 | Abcam | -- | |
| 抗钙调磷酸酶抗体 | ABclonal | -- | |
| 抗IL-1β抗体 | ABclonal | -- | |
| 抗GSDMD-N抗体 | Affinity Biosciences | -- | |
| 抗IL-18抗体 | Affinity Biosciences | -- | |
| 抗TFE3抗体 | Sigma-Aldrich | HPA023881 | |
| 抗VE-钙粘蛋白抗体 | HuaBio | -- | |
| 抗MMP9抗体 | HuaBio | -- | |
| HRP标记的IgG二抗 | Bioworld Technology | -- | |
| Omni-ECL Femto轻度化学发光试剂盒 | Epizyme Biomedical Technology | -- | |
| ChemiDoc XRS+成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 分子对接 | AutoDock Vina | -- | -- |
| PyMOL | -- | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | C11995500BT |
| 胎牛血清 | Gibco | 10099141C | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 1719675 | |
| CETSA | PCR仪 | -- | -- |
| SPR | Biacore 8K | GE Healthcare | -- |
| 传感芯片 | GE Healthcare | -- | |
| 二甲基亚砜 | Cytiva | BR100672 | |
| 组织学检测 | TUNEL检测试剂盒 | Millipore Sigma | -- |
| 碘化丙啶 | Servicebio | -- | |
| 蛋白提取 | NE-PER核和细胞质提取试剂 | Thermo Fisher Scientific | 78835 |
| AAV注射 | AAV-TFE3 shRNA | GeneChem | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 缺血皮瓣模型构建 | 小鼠品系、性别、年龄、体重;麻醉方式;皮瓣尺寸;术后处理 阅读提示:Methods: Ischemic flaps model |
| 药物处理 | FFA剂量、给药方式、给药时间;抑制剂(ATN-224、3MA、CC、ML-SI1、Tacrolimus)剂量、给药顺序 阅读提示:Methods: Animal treatment |
| 皮瓣存活率评估 | 评估时间点、方法、计算公式 阅读提示:Methods: Determination of flaps survival area |
| 免疫荧光检测 | 抗体信息、稀释比例、孵育条件、拍照和分析软件 阅读提示:Methods: Immunofluorescence staining; IF quantification |
| Western blot | 组织样本量、裂解缓冲液、蛋白上样量、一抗信息、二抗信息、检测试剂和设备 阅读提示:Methods: WB |
| 分子结合验证 | 分子对接的PDB ID、软件;CETSA的实验条件(细胞、温度);SPR的固定蛋白、浓度、Kd值 阅读提示:Methods: Molecular docking study; Cellular thermal shift assay; Surface plasmon resonance |