ABX处理与EAP模型建立
建立EAP模型并给予ABX以清除肠道菌群,观察其对前列腺炎的影响。
NOD小鼠皮下注射前列腺抗原(PAg)和完全弗氏佐剂(CFA),两周后加强免疫。EAP建立后14天,ABX组给予含氨苄青霉素、新霉素、甲硝唑和万古霉素的饮水,持续14天。
Antibiotic cocktail-induced changes in gut microbiota drive alteration of bile acid metabolism to restrain Th17 differentiation through the FXR-NLRP3 axis
包含16S rRNA测序、代谢组学、FMT、细胞分化、Western blot、ChIP-qPCR、双荧光素酶报告及临床样本分析,多层级证据链验证机制。
EAP小鼠模型 小鼠原代CD4+ T细胞 CP/CPPS患者样本
ABX处理:饮用水中添加氨苄青霉素、新霉素、甲硝唑、万古霉素(浓度分别为1g/L、1g/L、1g/L、500mg/L),持续2周 DCA处理:ABX饮食中添加0.2% DCA,持续14天 MCC950处理:NLRP3抑制剂,剂量按厂商说明 GW4064处理:FXR激动剂,剂量按厂商说明 FMT:ABX处理小鼠粪便1g/10mL PBS,每天灌胃,持续2周
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立EAP模型并给予ABX以清除肠道菌群,观察其对前列腺炎的影响。
NOD小鼠皮下注射前列腺抗原(PAg)和完全弗氏佐剂(CFA),两周后加强免疫。EAP建立后14天,ABX组给予含氨苄青霉素、新霉素、甲硝唑和万古霉素的饮水,持续14天。
评估ABX对肠道菌群组成和胆汁酸代谢的影响,并鉴定关键代谢物。
16S rRNA基因测序分析盲肠内容物,非靶向和靶向代谢组学分析粪便、血清和前列腺组织中的胆汁酸。
验证ABX处理后的菌群是否足以减轻EAP症状并改变胆汁酸代谢。
收集EAP和ABX小鼠粪便,制备菌液灌胃给EAP小鼠,持续2周。评估EAP小鼠的病理和免疫指标。
明确DCA对Th17细胞分化和前列腺炎的影响。
EAP小鼠在ABX饮食基础上添加DCA,评估前列腺病理、Th17细胞比例和炎症因子;体外分选naïve CD4+ T细胞,在Th17分化条件下加入DCA,检测Th17细胞比例和细胞因子。
验证DCA是否通过抑制FXR激活NLRP3-IL17A轴促进Th17分化。
使用MCC950(NLRP3抑制剂)和GW4064(FXR激动剂)处理EAP小鼠和体外T细胞,检测Th17细胞和相关蛋白表达;通过ChIP-qPCR和双荧光素酶报告实验验证FXR与NLRP3启动子的结合。
验证抗生素治疗对CP/CPPS患者肠道菌群和胆汁酸代谢的影响。
收集9名CP/CPPS患者在抗生素治疗前后(各20份)的粪便和血清样本,进行16S rRNA测序、代谢组学和Olink蛋白组学分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| EAP模型诱导 | 完全弗氏佐剂(CFA) | Sigma-Aldrich | F5881 |
| 不完全弗氏佐剂(IFA) | Sigma-Aldrich | F5506 | |
| 抗生素处理 | 硫酸新霉素 | Sigma | -- |
| 甲硝唑 | Sigma | -- | |
| 万古霉素 | Sigma | -- | |
| DCA处理 | 脱氧胆酸(DCA) | MCE | HY-N0593 |
| NLRP3抑制 | MCC950 | MCE | HY-12815 |
| FXR激动 | GW4064 | MCE | HY-50108 |
| FMT抗生素残留检测 | 新霉素ELISA试剂盒 | Jining Bio | JN39092 |
| 甲硝唑ELISA试剂盒 | Jining Bio | JN39120 | |
| 万古霉素ELISA试剂盒 | Jining Bio | JN39109 | |
| 免疫组化 | 抗IL-17A抗体 | Proteintech | 66148-1-lg |
| 抗FXR抗体 | Santa Cruz | sc-25309 | |
| 抗caspase-1β抗体 | Affinity | AF5418 | |
| 抗ASC抗体 | Affinity | DF6304 | |
| 抗NLRP3抗体 | Santa Cruz | sc-134306 | |
| 抗cleaved caspase-1抗体 | Affinity | AF4005 | |
| 抗IL-1β抗体 | Affinity | BF8021 | |
| 抗cleaved-IL-1β抗体 | Affinity | AF4006 | |
| 生物素化山羊抗兔/小鼠IgG | Servicebio | -- | |
| 流式细胞术 | FITC-抗CD4抗体 | BD | 553047 |
| PE-IL-17A抗体 | BD | 559502 | |
| RORγt抗体 | BD | 562607 | |
| RPMI 1640培养基 | Gibco | -- | |
| PMA | MultiSciences | CS0001 | |
| 莫能菌素 | MultiSciences | CS0004 | |
| 离子霉素 | MultiSciences | CS0002-500 | |
| 固定/破膜试剂盒 | Invitrogen | 00-5523-00 | |
| 细菌计数 | Syto BC | ThermoFisher | B7277 |
| CD4+ T细胞分选 | CD4+ T细胞分选试剂盒 | Miltenyi | 130-104-454 |
| LS分选柱 | Miltenyi | 130-042-401 | |
| T细胞分化 | 抗CD3抗体 | Bio X Cell | BE0001-1 |
| 抗CD28抗体 | Bio X Cell | BE0015-1 | |
| IL-6 | Novoprotein | CG39 | |
| TGF-β1 | Novoprotein | CA59 | |
| 抗IL-4抗体 | Bio X Cell | BE0045 | |
| 抗IFN-γ抗体 | Bio X Cell | BE0055 | |
| FXR敲低 | AAV-shFXR | Shanghai Han Heng Biotechnology | HH20230721WY-LV02 |
| ELISA | IL-17A ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0047c |
| GM-CSF ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0032c | |
| IFN-γ ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0048c | |
| 胰岛素ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M1382c | |
| 16S rRNA测序 | QIAamp 96 PowerFecal QIAcube HT试剂盒 | QIAGEN | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013 |
| 蛋白酶抑制剂 | Beyotime | ST506-2 | |
| ECL化学发光试剂 | Advansta | K-12043 | |
| RT-PCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596026 |
| PrimeScript逆转录试剂盒 | Takara | RR047A | |
| TB Green Premix Ex Taq试剂盒 | Takara | RR820A | |
| ABI 7500仪器 | Applied Biosystems | -- | |
| IPGTT | Accu-Chek Guide血糖仪 | Accu-Chek | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| EAP模型诱导 | NOD小鼠周龄、体重、免疫剂量、佐剂类型 阅读提示:Materials and methods: Animals |
| ABX处理 | 抗生素种类、浓度、给药方式、持续时间 阅读提示:Materials and methods: Animal antibiotics and drug treatment |
| FMT | 供体小鼠处理、粪便收集、灌胃剂量、频率、持续时间、抗生素残留检测 阅读提示:Materials and methods: Fecal microbiota transplantation (FMT) |
| DCA补充 | DCA剂量、给药方式 阅读提示:Materials and methods: Animal antibiotics and drug treatment |
| Th17细胞体外分化 | CD4+ T细胞分离方法、刺激条件、细胞因子浓度、分化时间 阅读提示:Materials and methods: Naïve CD4+ T-cell isolation and in vitro differentiation |
| NLRP3抑制 | MCC950剂量、给药方式 阅读提示:Materials and methods: Animal antibiotics and drug treatment |
| FXR激动/抑制 | GW4064剂量、AAV-shFXR使用 阅读提示:Materials and methods: Animal antibiotics and drug treatment; FXR Suppression |