细胞增殖与克隆形成评价
评估β-OHB对脂质剥夺或葡萄糖限制条件下癌细胞增殖的影响。
在脂质剥夺或高糖/低糖条件下,添加或不添加β-OHB,测定细胞增殖速率。
An alternative route for β-hydroxybutyrate metabolism supports cytosolic acetyl-CoA synthesis in cancer cells
体外细胞系模型、稳定同位素示踪、CRISPR基因敲除及回补实验,结合原位和皮下肿瘤模型及体内输注验证功能与机制。
AL1376小鼠胰腺导管腺癌细胞系 B16小鼠黑色素瘤细胞系 MIA PaCa-2人胰腺导管腺癌细胞系 雄性C57BL/6J小鼠皮下及原位移植瘤模型
5 mM β-OHB处理及脂质剥夺条件 [U-13C]-β-OHB或[U-13C]-葡萄糖标记48小时 Bdh1、Oxct1、Aacs基因敲除或双敲除 FASN抑制剂GSK2194069和辛伐他汀处理
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估β-OHB对脂质剥夺或葡萄糖限制条件下癌细胞增殖的影响。
在脂质剥夺或高糖/低糖条件下,添加或不添加β-OHB,测定细胞增殖速率。
标记β-OHB和葡萄糖,追踪碳流向脂肪酸和乙酰辅酶A。
用[U-13C]-β-OHB或[U-13C]-葡萄糖标记细胞48小时,提取代谢物并进行GC-MS分析。
验证BDH1、OXCT1和AACS在β-OHB代谢途径中的作用。
通过CRISPR-Cas9敲除Bdh1、Oxct1、Aacs或其组合,并回补表达相应基因,检测代谢物标记变化。
验证β-OHB代谢途径在体内肿瘤中的作用。
皮下或原位接种肿瘤细胞,进行禁食和[U-13C]-β-OHB输注,分析肿瘤代谢物标记和肿瘤生长。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Corning Life Sciences | 10-013-CV |
| 胎牛血清 | Corning Life Sciences | 35-010-CV | |
| β-羟基丁酸 | Millipore Sigma | 298360 | |
| GSK2194069 | Tocris | 5303 | |
| 辛伐他汀 | Cayman Chemical | 10010344 | |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668027 | |
| Hoechst染料 | Invitrogen | H1399 | |
| G418 | -- | -- | |
| 免疫印迹 | RIPA裂解液 | Thermo Scientific | 89900 |
| Halt蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | ThermoFisher | 78440 | |
| Pierce BCA蛋白测定试剂盒 | Thermo Scientific | 23225 | |
| 硝酸纤维素膜 | Bio-Rad | 1620112 | |
| SuperSignal West Femto最大灵敏度底物 | Thermo Scientific | 34096 | |
| BDH1抗体 | Proteintech | 67448-1-Ig | |
| OXCT1抗体 | Proteintech | 12175-1-AP | |
| AACS抗体 | Proteintech | 13815-1-AP | |
| Vinculin抗体 | Cell Signaling Technology | 137015 | |
| β-actin抗体 | Cell Signaling Technology | 3700 | |
| 抗小鼠IgG HRP标记二抗 | Cell Signaling Technology | 7076 | |
| 抗兔IgG HRP标记二抗 | Cell Signaling Technology | 7074 | |
| 稳定同位素标记 | [U-13C6]-葡萄糖 | Cambridge Isotope Laboratories | CLM-1396 |
| [U-13C4]-β-羟基丁酸 | Cambridge Isotope Laboratories | CLM-3853 | |
| 代谢物提取 | 丁羟甲苯 | Millipore Sigma | B1378 |
| 正缬氨酸 | -- | -- | |
| 顺式-10-十七碳烯酸 | -- | -- | |
| GC-MS | TRACE TR-FAME色谱柱 | ThermoFisher | 260M154P |
| TRACE 1600气相色谱仪 | Thermo Scientific | -- | |
| ISQ 7610质谱仪 | Thermo Scientific | -- | |
| 五氟苄基溴 | Sigma-Aldrich | 90257 | |
| MOX试剂 | Thermo Fisher | TS-45950 | |
| DB-5MS色谱柱 | Agilent Technologies | 122-3832 | |
| Agilent 7890B气相色谱仪 | Agilent Technologies | -- | |
| Agilent 5977B质谱仪 | Agilent Technologies | -- | |
| 盐酸羟胺 | Millipore Sigma | 255580 | |
| 吡啶 | Millipore Sigma | PX2012-7 | |
| 乙酸乙酯 | Millipore Sigma | 1.03649 | |
| 动物实验 | Matrigel基质胶 | Corning | 356234 |
| 对照饮食AIN-93G | Envigo | TD.97184 | |
| 卡路里限制饮食 | Envigo | TD.210722 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 细胞系、培养基、血清处理、β-OHB浓度、抑制剂量 阅读提示:Methods: Cell lines and culture, Inhibitors |
| 稳定同位素标记 | 标记物种类、浓度、标记时间、培养基脂质状态 阅读提示:Methods: Stable isotope labelling experiments and metabolite extraction |
| 基因敲除与回补 | sgRNA序列、敲除细胞系、回补表达载体 阅读提示:Methods: Generation of knockout cells by CRISPR–Cas9, Plasmids and generation of stable cDNA-expressing cells |
| 体内实验 | 小鼠品系、性别、年龄、细胞接种量、饮食方案、输注参数 阅读提示:Methods: Animal studies, Animal diets, In vivo [U-13C]-β-OHB infusions |
| 代谢物分析 | GC-MS方法、内标、衍生化试剂、数据处理软件 阅读提示:Methods: GC–MS analysis of fatty acids, GC–MS analysis of polar metabolites |