从单细胞到临床前评估:Trem2、Folr2和Slc7a7作为动脉粥样硬化巨噬细胞相关生物标志物

Single-cell to pre-clinical evaluation of Trem2, Folr2, and Slc7a7 as macrophage-associated biomarkers for atherosclerosis

作者信息Tiit Örd, Senthil Palani, Judith Giroud Gerbetant, Susanna Bodoy, Tapio Lönnberg, Henri Niskanen, Aarthi Ravindran, Lari Holappa, Melody Chemaly, Mari Taipale, Kadri Õunap, Retu Haikonen, Husain Talukdar, Katyayani Sukhavasi, Heidi Liljenbäck, Jenni Virta, Anna-Kaisa Ruotsalainen, Clara Pierrot-Blanchet, Maxwell W G Miner, Olli Moisio, Noora Rajala, Xiang-Guo Li, Philip S Low, Antti Saraste, Merja Heinäniemi, Seppo Ylä-Herttuala, Johan L M Björkegren, Ulf Hedin, Ljubica Matic, Laurent Yvan-Charvet, Manuel Palacin, Anne Roivainen, Minna U Kaikkonen
PMID41206594
发布时间2025-11-07
DOI10.1093/cvr/cvaf210

实验完整度

包含TRAP-seq和scRNA-seq多组织转录组分析、PET/CT成像与体外放射自显影、ELISA检测sTREM2、BMDM功能实验及骨髓移植体内验证,多层级功能与机制验证。

主要模型

LDLR−/−ApoB100/100小鼠动脉粥样硬化模型 C57Bl/6J小鼠 Slc7a7LysM−/−小鼠骨髓来源巨噬细胞 BiKE和STARNET人类队列

重点核对

HFD喂养时间(1个月早期,3个月晚期)及年龄匹配(5-6个月起始HFD 1个月,3-4个月起始HFD 3个月) PET示踪剂剂量(18F-FDG 13.9±0.7 MBq,18F-FGln 14.2±0.8 MBq,68Ga-FOL 20.1±1.3 MBq)及动态采集60分钟 BMDM处理条件(氧化型LDL 100 μg/mL,乙酰化LDL 50 μg/mL,处理24小时) 骨髓移植模型(Ldlr−/−受体,4×10^6细胞,Western diet 11周) 统计分析(双尾非配对Student's t检验,Wilcoxon秩和检验)

摘要

目的:动脉粥样硬化是一个主要的全球健康挑战,诊断和治疗选择有限。巨噬细胞驱动疾病进展,但其组织特异性表型和功能仍不明确。本研究旨在通过表征关键代谢和血管组织中巨噬细胞的功能多样性来阐明巨噬细胞驱动的机制。方法和结果:我们使用单细胞RNA测序(scRNA-seq)和翻译核糖体亲和纯化测序(TRAP-seq)在小鼠动脉粥样硬化模型的主动脉、脂肪组织和肝脏中描绘巨噬细胞特异性基因程序。我们的数据突出了组织特异性巨噬细胞基因程序,并鉴定了小鼠和人斑块中共有的标志物。首先,我们确定了可溶性Trem2作为区分无症状和有症状个体的潜在循环生物标志物。其次,我们利用Folr2和Slc7a7的显著表达,通过体内PET成像探索叶酸和谷氨酰胺作为正电子发射断层扫描(PET)示踪剂用于疾病负担评估的潜力。最后,我们表明Slc7a7的敲除抑制乙酰化低密度脂蛋白摄取,并减弱与脂质相关巨噬细胞相关的基因特征。这表明谷氨酰胺信号可能在泡沫细胞形成中发挥关键作用,这是动脉粥样硬化的一个关键事件。结论:我们的发现为动脉粥样硬化进展过程中巨噬细胞特异性基因程序提供了新的见解,并确定了一组有前景的生物标志物,可作为未来研究的资源。这些发现可能对改善动脉粥样硬化的诊断、监测和治疗做出重要贡献。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
动脉粥样硬化进展中巨噬细胞在主动脉、脂肪和肝脏中的基因程序有何异同,哪些标志物可用于疾病监测和功能干预?
核心机制
Slc7a7参与巨噬细胞脂质摄取和泡沫细胞形成,其缺失削弱LAM基因特征,提示谷氨酰胺信号在泡沫细胞形成中的关键作用。
主要证据
TRAP-seq和scRNA-seq鉴定了388个跨物种巨噬细胞富集基因;sTREM2在症状性患者血浆中升高;PET成像显示68Ga-FOL和18F-FGln可反映斑块负荷;Slc7a7敲除BMDM中Ox-LDL摄取减少并减弱LAM特征。
研究意义
提供巨噬细胞特异性基因程序资源,sTREM2可能用于患者分层,叶酸和谷氨酰胺PET示踪剂有望用于无创监测疾病负担,Slc7a7作为潜在治疗靶点。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

TRAP-seq和scRNA-seq图谱构建

表征不同疾病阶段巨噬细胞在主动脉、脂肪和肝脏中的基因表达程序

使用TRAP-seq和scRNA-seq分析LDLR−/−ApoB100/100小鼠(HFD 0、1、3个月)及对照,鉴定巨噬细胞富集基因和细胞亚型。

2

sTREM2生物标志物验证

评估血浆sTREM2作为区分症状性和无症状性动脉粥样硬化的循环生物标志物

ELISA检测小鼠血浆sTREM2,并在BiKE和STARNET队列中分析组织及血浆TREM2水平。

3

PET成像评估疾病负担

评估68Ga-FOL和18F-FGln作为PET示踪剂监测动脉粥样硬化斑块负荷的潜力

对LDLR−/−ApoB100/100小鼠进行PET/CT成像,计算主动脉弓TBR,并通过离体放射自显影和组织学染色验证示踪剂定位。

4

Slc7a7功能验证

验证Slc7a7在巨噬细胞脂质摄取和泡沫细胞形成中的作用

从Slc7a7LysM−/−小鼠分离BMDM,进行ox-LDL/ac-LDL处理,Oil Red O染色和RNA-seq分析LAM基因特征;骨髓移植实验评估体内谷氨酰胺摄取。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
杜氏改良伊格尔培养基文中未明确说明--
重组巨噬细胞集落刺激因子Peprotech--
乙酰化低密度脂蛋白文中未明确说明--
氧化型低密度脂蛋白文中未明确说明--
18F-氟代脱氧葡萄糖GE Healthcare--
18F-氟代谷氨酰胺MSKCC Organic Synthesis Core Facility--
68Ga标记叶酸NOTA-folate precursor provided by Prof. Philip Low--
eXIA160XL造影剂Binitio Biomedical--
抗Mac-3抗体BD Biosciences550292
抗SLC7A7抗体Thermo Fisher ScientificPA5-113527
抗FR-β抗体Biorbyt--
抗TREM2抗体Thermo Fisher ScientificPA5-87933
抗TREM2捕获抗体R&D SystemsMAB17291-100
生物素化抗TREM2抗体R&D SystemsBAF1729
重组小鼠TREM2Sino Biological50149-M08H
链霉亲和素多聚HRP40偶联物Fitzgerald65R-S104PHRP
TMB底物Sigma-AldrichT5569
CLARIOstar酶标仪BMG Labtech--
Dynabeads MyOne链霉亲和素T1磁珠Invitrogen65602
生物素化蛋白LPierce29997
SMARTer链特异性总RNA-seq试剂盒v2TaKaRa Bio634411, 634412
Chromium单细胞3'试剂盒(v2化学)10x Genomics--
RNeasy试剂盒Qiagen74104
Absolutely RNA Nanoprep试剂盒Agilent Technologies#400753
RNeasy Micro Plus试剂盒Qiagen--
Cellcrusher冷冻压碎器Cellcrusher--
HEPESFisher10041703
氯化镁InvitrogenAM9530G
二硫苏糖醇Sigma10197777001
cOmplete Mini无EDTA蛋白酶抑制剂Roche11836170001
鼠源RNase抑制剂NEBM0314L
Superasin RNase抑制剂Thermo ScientificAM2696
IGEPAL CA630SigmaI8896
1,2-二庚酰基-sn-甘油-3-磷酸胆碱Avanti Polar Lipids850306P
二甲基亚砜SigmaC1988-1G
68Ge/68Ga发生器Eckert & Ziegler--
FASTlab放射性合成装置文中未明确说明--
RIPA裂解液SigmaR0278
Bradford试剂ThermoFisher--
Inveon多模态PET/CT扫描仪Siemens Medical Solutions--
Fuji成像板BAS-TR2025Fuji--
Fuji分析仪BAS-5000Fuji--
Pannoramic 250 Flash玻片扫描仪3DHISTECH--
γ计数器(Triathler 3英寸)Hidex--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
动脉粥样硬化小鼠模型
小鼠品系(LDLR−/−ApoB100/100)、HFD起始月龄和喂养时长(早期:5-6月龄起1个月;晚期:3-4月龄起3个月)、对照组(chow diet)
阅读提示:Methods 2.1
TRAP-seq
Csf1r启动子驱动的EGFP-RPL10a转基因、组织类型(主动脉、脂肪、肝脏)、每组小鼠数量(6只)、裂解缓冲液组成、抗体及磁珠用量
阅读提示:Methods 2.2, 补充方法
scRNA-seq
组织来源(主动脉、脂肪)、10× Genomics Chromium平台及试剂盒版本、分析流程(Seurat版本、细胞过滤条件)
阅读提示:Methods 2.3
PET/CT成像
示踪剂种类和剂量、禁食时间、麻醉方案、动态采集时长、TBR计算方法(SUVmax主动脉弓/SUVmean血液,40-60分钟)
阅读提示:Methods 2.8, 图4图注
BMDM功能实验
Slc7a7LysM−/−小鼠来源、BMDM分化条件(M-CSF 50 ng/mL或30% L-Cell条件培养基)、处理条件(ox-LDL 100 μg/mL或ac-LDL 50 μg/mL,24小时)、Oil Red O染色和RNA-seq样本量
阅读提示:Methods 2.12, 图5图注
骨髓移植和谷氨酰胺摄取
受体基因型(Ldlr−/−)、移植细胞数(4×10^6)、放疗方案(16小时前)、恢复期5周、致动脉粥样硬化饮食(Western diet)11周、14C-谷氨酰胺剂量(2 μCi)和注射后时间(15分钟)
阅读提示:Methods 2.13