单细胞分析揭示三种具有不同异构体表达谱的内皮-造血转化

生血内皮（HE）被认为是所有终末血细胞（包括造血干细胞，HSCs）的起源；然而，在HE内部调控造血祖细胞与HSC命运选择的机制仍不明确。本研究结合了分化实验与胚胎外卵黄囊（YS）及胚胎内主动脉-性腺-中肾（AGM）区HE群体的全长单细胞转录组数据。我们鉴定并定位了三个分化轨迹，每个轨迹包含一个独特的HE亚群：YS丛中的红髓系祖细胞启动型HE、大YS动脉中的淋巴髓系祖细胞启动型HE，以及AGM中的造血干细胞与祖细胞启动型HE。染色质修饰因子与剪接体成分在AGM HE中富集。这与AGM HE转录组更高的异构体复杂性相关。在包括Runx1等干细胞相关因子在内的广泛基因中，观察到了独特的AGM HE特异性异构体表达模式。我们的数据为研究不同HE群体的细胞命运决定提供了独特的资源。