损伤模型建立与表型分析
确定不同形式的急性胸腺损伤是否均诱导caspase-1激活及IL-18释放,并观察其对胸腺细胞数的影响。
对小鼠实施SL-TBI、地塞米松、环磷酰胺或LPS处理,在不同时间点检测胸腺细胞数、caspase-1裂解及IL-18和IL-1β水平。
Damage-induced IL-18 stimulates thymic NK cells limiting endogenous tissue regeneration
包含多种损伤模型的体内表型分析、细胞来源鉴定、NK细胞功能与机制验证、条件性基因敲除、过继移植、体外杀伤实验和单细胞转录组分析等多层级证据。
亚致死性全身照射(SL-TBI)小鼠模型 造血细胞移植(HCT)小鼠模型 骨髓嵌合体小鼠模型 OP9-DLL1体外共培养系统
SL-TBI剂量(550 cGy)及时间点(0-7天) IL-18或IL-18R1基因敲除小鼠及条件性敲除系 抗NK1.1或抗IL-18单克隆抗体给药方案(剂量、时间) NK细胞杀伤实验中的效靶比、共培养时间及靶细胞系 单细胞RNA测序数据集的来源和GEO编号
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定不同形式的急性胸腺损伤是否均诱导caspase-1激活及IL-18释放,并观察其对胸腺细胞数的影响。
对小鼠实施SL-TBI、地塞米松、环磷酰胺或LPS处理,在不同时间点检测胸腺细胞数、caspase-1裂解及IL-18和IL-1β水平。
阐明IL-18信号在调节内源性胸腺再生中的作用。
使用Il18-/-、Il18r1-/-、Il1r1-/-和Cas1Δ10小鼠分析胸腺再生;给予重组IL-18;在HCT模型中使用抗IL-18单抗进行治疗。
鉴定损伤后胸腺内产生IL-18的细胞类型。
通过单细胞RNA测序、流式细胞术和条件性敲除小鼠,分析损伤前后不同细胞亚群中Il18表达和caspase-1活性。
确定IL-18作用于何种细胞,并表征其在损伤后的功能变化。
分析IL-18R表达模式;通过基因敲除小鼠(Il18r1ΔTEC, Il18r1ΔNK/ILC1, Il18r1ΔT/NKT)、抗体介导的NK1.1+细胞耗竭和过继移植实验,评估NK、NKT和ILC1细胞在胸腺再生中的作用;检测NK细胞效应分子表达和细胞毒性。
确定被激活的NK细胞靶向的胸腺内细胞类型,并验证其杀伤效应。
通过单细胞转录组分析损伤后胸腺上皮细胞MHC-I和NKG2D配体表达变化;通过体外共培养实验和成像分析,检测NK细胞对胸腺上皮细胞的杀伤。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞分离 | 胶原酶D | Sigma | 11088882001 |
| 脱氧核糖核酸酶I | Sigma | 10104159001 | |
| Z2库尔特颗粒计数及粒度分析仪 | Beckman Coulter | -- | |
| 免疫荧光染色 | 抗NK1.1单克隆抗体 | BioXCell | BE0036 |
| 体内治疗 | 抗IL-18单克隆抗体 | BioXCell | BE0237 |
| 细胞因子检测 | IL-18 ELISA试剂盒 | Thermo Fisher | BMS618-3 |
| IFNγ ELISA试剂盒 | Thermo Fisher | KMC4021 | |
| 成熟Caspase-1 ELISA试剂盒 | Adipogen | AG-45B-0002-KI01 | |
| 细胞培养 | Flt3配体 | Peprotech | 250-31L |
| 白细胞介素-7 | Peprotech | 217-17 | |
| 重组IL-18 | BioLegend | 767008 | |
| 重组IL-15 | BioLegend | 566302 | |
| 细胞染色 | 膜联蛋白V | BioLegend | 640920 |
| CellTrace黄 | Thermo Fisher | C34573 | |
| CellTrace紫 | Thermo Fisher | C34571 | |
| 刺激物 | 聚肌胞苷酸 | InvivoGen | tlrl-picw |
| 细胞分离 | NK细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-115-818 |
| 成像 | Vectra Polaris定量病理成像系统 | Akoya Biosciences | -- |
| HALO图像分析软件 | Indica Labs | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 损伤模型 | SL-TBI剂量(550 cGy)、地塞米松(20 mg/kg)、环磷酰胺(200 mg/kg)、LPS(1.5 mg/kg)的给药途径和时间点 阅读提示:Methods: In vivo acute damage models |
| IL-18或IL-18R1基因操作 | 基因敲除小鼠品系(Il18-/-, Il18r1-/-, Il18r1fl/fl条件性敲除)及Cre驱动子(Foxn1-Cre, Ncr1-Cre, Lck-Cre) 阅读提示:Methods: Mice |
| NK细胞功能实验 | 抗NK1.1 mAb(200 μg/只,i.p.,-1、1、3天)、杀伤实验效靶比(2:1或5:1)、共培养时间(5小时)、靶细胞(RMA-S) 阅读提示:Methods: In vivo depletion and transplantation studies, Cytotoxicity assays |
| HCT实验 | 致死性照射剂量(1100 cGy,分次)、移植细胞数量(5×10^6至10×10^6)、抗IL-18 mAb给药方案 阅读提示:Methods: In vivo depletion and transplantation studies |
| 单细胞RNA测序数据分析 | 数据集GSE240016和GSE244673、CellChat分析参数(默认)、簇注释 阅读提示:Methods: scRNAseq and qPCR |