构建骨髓嵌合小鼠模型
在B细胞缺陷背景下研究TNFΔARE/+驱动的回肠炎,避免B细胞全身性缺失的影响。
将TNFΔARE/+或μMT-TNFΔARE/+骨髓移植到CD45.2受体小鼠中,16-17周后分析回肠炎症、肠系膜淋巴结构和全身表现。
Distinct roles for B cell-derived LTα3 and LTα1β2 in TNF-mediated ileitis
研究包含骨髓嵌合小鼠模型、遗传性B细胞特异性LTα/LTβ敲除、抗体中和实验、人体样本scRNA-seq等多层级证据,并进行功能验证和机制验证。
TNFΔARE/+骨髓嵌合小鼠 μMT-TNFΔARE/+骨髓嵌合小鼠 混合骨髓嵌合小鼠(WT、Lta−/−或Ltb−/−B细胞) Pigr−/−小鼠
B细胞缺失(μMT)和B细胞特异性LTα或LTβ缺失对回肠炎的影响 抗LTα3中和抗体(S5H3)对体重和细胞因子的影响 LTβR-Fc治疗对TLS形成的影响 pIgR缺失对分泌性IgA和肠道炎症的影响 B细胞中TNF缺失对体重和TLS的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
在B细胞缺陷背景下研究TNFΔARE/+驱动的回肠炎,避免B细胞全身性缺失的影响。
将TNFΔARE/+或μMT-TNFΔARE/+骨髓移植到CD45.2受体小鼠中,16-17周后分析回肠炎症、肠系膜淋巴结构和全身表现。
评估B细胞缺失对回肠炎和全身性表现的影响。
通过组织学评分、粪便脂质运载蛋白2、流式细胞术等分析回肠炎症、免疫细胞浸润;通过MRI、代谢笼、肌肉重量、骨密度等评估体重、身体组成和代谢。
探讨B细胞通过分泌IgA保护肠道的作用。
使用Pigr−/−和Pigr+/+受体小鼠移植TNFΔARE/+骨髓,比较回肠炎症、粪便IgA水平、体重和TLS形成。
区分B细胞来源的LTα和LTβ在回肠炎中的作用。
构建混合骨髓嵌合小鼠,其中90%骨髓来自μMT-TNFΔARE/+,10%来自WT、Lta−/−或Ltb−/−,以提供特定基因型的B细胞。评估TLS形成、体重变化、肠道通透性、IgA浆细胞数量。
评估阻断LTα3或LTβR信号对回肠炎和全身表现的影响。
对TNFΔARE/+骨髓嵌合小鼠给予抗LTα3单克隆抗体(S5H3)、抗TNF抗体、LTβR-Fc或对照,监测体重、细胞因子水平、TLS形成。
了解LTα3中和后免疫细胞(特别是B细胞)的转录变化。
对来自肠道的迁移到肠系膜淋巴结的细胞进行scRNA-seq,比较WT与TNFΔARE/+小鼠以及抗LTα3或对照处理后的变化。
确定B细胞自身表达的TNF对回肠炎和B细胞命运的影响。
构建混合骨髓嵌合小鼠,其中B细胞为CD19Cre×TNFfl/fl(TNF缺失)或CD19Cre(对照),评估TLS形成、体重变化和B细胞数量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 骨髓移植 | X射线辐照仪 | -- | -- |
| 抗体处理 | 抗LTα3抗体S5H3 | Genentech | -- |
| 小鼠IgG2a同型对照(克隆C1.18.4) | Leinco Technologies | -- | |
| 抗小鼠TNF(克隆TN3-19.12) | Leinco Technologies | -- | |
| 亚美尼亚仓鼠IgG同型对照(克隆PIP) | Leinco Technologies | -- | |
| LTβR-Fc融合蛋白 | Biogen or Genentech | -- | |
| 细胞处理 | RPMI-1640培养基 | GIBCO | -- |
| 胎牛血清 | ThermoFisher GIBCO | -- | |
| 胶原酶IV | Sigma-Aldrich | C5138 | |
| 脱氧核糖核酸酶I | Sigma-Aldrich | DN25 | |
| EDTA | Corning | 46-034-CI | |
| Percoll | GE Healthcare | 17-0891-01 | |
| BD Pharm Lyse红细胞裂解液 | BD Biosciences | 555899 | |
| 流式细胞术 | Live/Dead Aqua可固定细胞染色试剂盒 | Invitrogen | L34957 |
| DAPI | -- | -- | |
| Helix NP Green | Biolegend | 425303 | |
| 布雷菲德菌素A | Biolegend | 420601 | |
| 抗TNF抗体(TNF-PE) | Biolegend | MP6-XT22 | |
| FoxP3-FITC | Invitrogen | -- | |
| T-bet-eFluor 660 | Invitrogen | -- | |
| RORγt-BV421 | BD Biosciences | Q31-378 | |
| Fc受体阻断剂(CD16/CD32,克隆2.4G2) | BD Biosciences | -- | |
| 人FcR阻断剂 | Miltenyi Biotec | 130-059-901 | |
| LSR Fortessa X20流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| FACSymphony流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| Cytek Aurora流式细胞仪 | Cytek | -- | |
| Aria II分选仪 | BD Biosciences | -- | |
| Sony Synergy HAPS细胞分选仪 | Sony | -- | |
| 组织学 | 伊红 | -- | -- |
| 免疫荧光 | B220抗体 | eBioscience | 14-0452-05 |
| Lyve-1抗体 | Abcam | ab14917 | |
| CSF1R抗体 | R&D | AF3818 | |
| SYLGARD 184硅橡胶 | Ellsworth | 4019862 | |
| 水杨酸甲酯 | Sigma-Aldrich | M6752 | |
| Leica M205FA体视显微镜 | Leica | -- | |
| Leica SP8共聚焦显微镜 | Leica | -- | |
| ADAPT-3D试剂盒 | Leinco Technologies | A630 | |
| 抗小鼠IgA(未偶联兔) | NSJ Bioreagents | R20169 | |
| 平滑肌肌动蛋白–Cy3 | Sigma-Aldrich | C6198 | |
| Alexa Fluor 488偶联抗小鼠CD3ε | BioLegend | 152322 | |
| Alexa Fluor 647抗小鼠IgD | BioLegend | 405708 | |
| 大鼠抗小鼠CD21/CD35 | BD Pharmingen | 553817 | |
| Mix-n-Stain CF568标记试剂 | Biotium | 92255 | |
| DAPI | -- | -- | |
| Imaris v.10.1.1软件 | Bitplane | -- | |
| 体内淋巴示踪 | FITC-葡聚糖(2000 kDa) | Sigma-Aldrich or Invitrogen | FD2000S or D7137 |
| 代谢分析 | EchoMRI-100H | EchoMRI | -- |
| CLAMS代谢笼 | Columbus Instruments | -- | |
| 肠道通透性 | 4-kDa FITC-葡聚糖 | Chondrex | 4013 |
| ELISA | Lipocalin-2/NGAL DuoSet ELISA试剂盒 | R&D Systems | DY1857 |
| 大鼠抗小鼠IgA | SouthernBiotech | 1165-01 | |
| 山羊抗小鼠IgA-HRP | SouthernBiotech | 1040-05 | |
| 小鼠IgA-UNLB标准品 | SouthernBiotech | 0106-01 | |
| 细胞因子检测 | M-PER哺乳动物蛋白提取试剂 | ThermoScientific | 78501 |
| Milliplex小鼠Th17预混25重磁珠 | Millipore | MT17MAG47K-PX25 | |
| FlexMAP 3D | Luminex | -- | |
| 双辛可宁酸法 | -- | -- | |
| scRNA-seq | Chromium Next GEM单细胞5'试剂盒v.2 | 10x Genomics | -- |
| Chromium单细胞5'文库试剂盒 | 10x Genomics | -- | |
| Chromium Next GEM芯片K单细胞试剂盒 | 10x Genomics | PN-1000286 | |
| Dual Index试剂盒TT Set A | 10x Genomics | PN-1000215 | |
| KAPA文库定量试剂盒 | KAPA Biosystems/Roche | -- | |
| NovaSeq X Plus测序仪 | Illumina | -- | |
| NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- | |
| Bioanalyzer生物分析仪 | Agilent | -- | |
| 营养吸收 | 弹式量热法 | -- | -- |
| 泊洛沙姆 | -- | -- | |
| 橄榄油 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 骨髓嵌合小鼠 | 受体小鼠品系、周龄、照射剂量、供体骨髓细胞数量、混合比例(90%:10%)、分析时间点(16-17周或30-32周) 阅读提示:Methods:BM chimeras;图1a、图5f |
| B细胞特异性LTα或LTβ缺失 | B细胞选择性敲除策略(混合骨髓法)、基因型(Lta−/−或Ltb−/−)、TLS计数和面积、IgA+浆细胞数量 阅读提示:Methods:Mice, BM chimeras;图5a-d, j-l |
| 抗LTα3中和抗体处理 | 抗体克隆(S5H3)、剂量(6 mg/kg)、给药途径(腹腔注射)、频率(每2天)、处理时长(2天或8周) 阅读提示:Methods:Anti-LTα3, anti-TNF treatment;图6a-f |
| LTβR-Fc处理 | 融合蛋白来源、剂量(200 μg)、频率(每周)、处理时长(8周) 阅读提示:Methods:Anti-LTα3, anti-TNF treatment;图5e |
| 肠道通透性测定 | 禁食时间(4小时)、FITC-dextran分子量(4 kDa)、剂量(167 mg/kg)、给药方式(灌胃)、采血时间(2小时) 阅读提示:Methods:Assessment of intestinal permeability;图5g |