培养的人婴儿巩膜成纤维细胞前后种群的不同转录组谱:包括多巴胺受体

Distinct Transcriptomic Profiles of Cultured Anterior and Posterior Populations of Human Infant Scleral Fibroblasts: Including Dopamine Receptors

作者信息Jiali Guan, Guangliang Hong, Zhong Liu, Yingfeng Zheng, Jiangping He, Dajiang Qin, He Li
PMID40402520
发布时间2025-05-01
DOI10.1167/iovs.66.5.29

实验完整度

包含scRNA-seq、qRT-PCR、Western blot、原位杂交、胶原凝胶收缩实验、药理干预和siRNA基因沉默等多种独立证据层级,并进行功能与机制验证。

主要模型

原代人婴儿巩膜成纤维细胞(前部、赤道部、后部) 人巩膜组织切片(成人供体)

重点核对

scRNA-seq:10x Genomics平台,每样本10,000细胞,P2代细胞 胶原凝胶收缩实验:3 mg/mL胶原蛋白I型基质,1×10^5细胞/mL,DA浓度50 µM DA受体药理调控:SCH23390(10 µM)、A68930(10 µM)、L741626(10 µM)等 siRNA敲低DRD2和DRD4,对照为非靶向siRNA

摘要

目的:巩膜成纤维细胞的转录组谱在很大程度上尚未被探索。为了阐明它们的异质性,我们对原代婴儿巩膜成纤维细胞进行了单细胞RNA测序(scRNA-seq)。方法:取自婴儿巩膜(3个月至2岁)前部、赤道部和后部区域的原代巩膜成纤维细胞(传代2次)使用10x Genomics平台进行scRNA-seq。深入分析揭示了前部和后部巩膜成纤维细胞之间不同的转录组谱,包括多巴胺(DA)受体的差异表达,随后在体外和原位进行了验证。此外,使用体外胶原凝胶收缩实验评估了DA在巩膜重塑中的调节作用,并通过药理学操作和基因沉默方法进一步探索了DA受体活性和表达在该过程中的参与。结果:婴儿巩膜成纤维细胞具有前部和后部亚群,每个亚群表现出不同的转录组谱。前部巩膜成纤维细胞显示D1样受体表达增加,但后部巩膜成纤维细胞显示D2样受体表达升高。D1样受体活性增强DA对前部巩膜重塑的抑制作用,而D2样受体活性,特别是后部巩膜中的DRD2,则抵消这种作用。DRD4的基因沉默显著增强DA介导的后部巩膜重塑抑制。结论:据我们所知,本研究首次对婴儿巩膜成纤维细胞进行了全面的转录组谱分析,揭示了它们的异质性。对DA受体活性和表达在DA介导的巩膜成纤维细胞收缩抑制中的调节作用的研究,为DA信号如何调节巩膜重塑提供了新的见解。关键词:巩膜成纤维细胞,单细胞转录组测序,多巴胺受体,巩膜重塑,DRD4

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
人婴儿巩膜成纤维细胞是否存在区域异质性,以及多巴胺及其受体是否参与调节巩膜重塑。
核心机制
多巴胺通过D1样受体活性增强对前部巩膜重塑的抑制,而D2样受体,特别是后部巩膜中的DRD2,抵消该抑制作用;DRD4表达则显著调节DA介导的收缩抑制。
主要证据
基于scRNA-seq鉴定前后亚群,通过qRT-PCR、Western blot和原位杂交验证DA受体差异表达;胶原凝胶收缩实验证明DA抑制收缩,且药理学和基因沉默实验揭示D1样和D2样受体的相反作用。
研究意义
首次提供婴儿巩膜成纤维细胞的转录组图谱,揭示其异质性;DA信号对巩膜重塑的调节作用为理解近视等巩膜变形相关疾病的治疗策略提供新思路。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

细胞分离与培养

获取人婴儿巩膜前部、赤道部和后部区域的成纤维细胞。

从4名婴儿供体(3个月、4个月、1岁、2岁)获取巩膜组织,解剖为前部、赤道部和后部区域,通过组织块培养法分离原代巩膜成纤维细胞,传代至P2。

2

单细胞RNA测序与分析

揭示前后巩膜成纤维细胞的转录组异质性。

对P2代细胞进行scRNA-seq,分析细胞聚类、差异表达基因和富集通路。

3

DA受体表达验证

验证scRNA-seq发现的DA受体差异表达。

通过qRT-PCR检测mRNA水平,Western blot检测蛋白水平,原位杂交(ISH)检测组织定位。

4

胶原凝胶收缩实验评估DA作用

评估DA对巩膜成纤维细胞介导的ECM重塑(收缩)的影响。

将细胞包埋于3 mg/mL胶原基质中,加入DA(1-100 µM)处理,监测7天凝胶收缩率。

5

药理学调节DA受体活性

探究不同DA受体亚型在DA抑制收缩中的作用。

在DA处理前1小时加入选择性受体激动剂或拮抗剂,测量24小时收缩率。

6

siRNA基因沉默验证DRD2/DRD4功能

验证DRD2和DRD4表达在DA介导收缩抑制中的作用。

用siRNA敲低DRD2或DRD4,检测7天收缩曲线及DA的影响。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
DMEM培养基Thermo Fisher Scientific--
胎牛血清Thermo Fisher Scientific--
青霉素-链霉素Gibco--
胶原酶DRoche--
Chromium Next GEM单细胞3'试剂盒v310x Genomics--
Chromium芯片G单细胞试剂盒10x Genomics--
HiSeq2500测序仪Illumina--
I型胶原Biocoat--
盐酸多巴胺Sigma-Aldrich--
SCH23390盐酸盐MedChemExpress--
A68930盐酸盐MedChemExpress--
左旋舒必利MedChemExpress--
甲磺酸溴隐亭MedChemExpress--
L-741626MedChemExpress--
PNU-95666EMedChemExpress--
L-745870MedChemExpress--
A-412997APExBIO Technology--
RNeasy Mini试剂盒QIAGEN--
HiScript III逆转录预混液Vazyme--
ChamQ通用SYBR qPCR预混液Vazyme--
QuantStudio 3实时荧光定量PCR系统Thermo Fisher Scientific--
RNASweAMI原位杂交DAB检测试剂盒ServicebioGF001
Tissue FAXS Plus ST系统TissueGnostics--
RIPA裂解液Thermo Fisher Scientific--
cOmplete蛋白酶抑制剂混合物Roche--
Mini-Protean Tetra电泳系统Bio-Rad--
SurePAGE Bis-Tris凝胶GenScript--
Tris-MOPS-SDS电泳缓冲液GenScript--
PVDF膜Merck Millipore--
转膜缓冲液GenScript--
高灵敏度ECL发光液Zen-Bioscience--
FluorChem E成像系统Bio-Techne--
多巴胺受体D1兔单克隆抗体Zen-Bioscience381747
DRD2多克隆抗体Proteintech55084-1-AP
多巴胺受体D3兔单克隆抗体Zen-Bioscience382983
DRD4兔多克隆抗体Proteintech28094-1-AP
多巴胺受体D5兔多克隆抗体Zen-Bioscience820522
GAPDH (7E4)小鼠单克隆抗体Zen-Bioscience200306-7E4
β-微管蛋白多克隆抗体Proteintech10094-1-AP
山羊抗兔IgG (H&L) (HRP偶联)Zen-Bioscience511203
山羊抗小鼠IgG (H&L) (HRP偶联)Zen-Bioscience511103
Lipofectamine RNAiMAX转染试剂Thermo Fisher Scientific--
Gibco Opti-MEM培养基Gibco--
ImageJ图像分析软件----
Prism 9统计分析软件GraphPad--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞培养
供体年龄、巩膜区域划分、传代次数
阅读提示:Methods: Primary Human Scleral Fibroblast Culture
scRNA-seq
细胞数量、平台版本、测序深度、数据处理参数
阅读提示:Methods: Single-Cell RNA Sequencing 和 Data Processing and Analysis
胶原凝胶收缩实验
胶原浓度、细胞密度、DA浓度、处理时间、凝胶面积测量方法
阅读提示:Methods: Collagen Gel Contraction Assay 和 Figure 4 图注
药理学干预
药物浓度、处理时间、DA浓度
阅读提示:Figure 5 图注和表3
siRNA敲低实验
siRNA序列、转染试剂、转染时间、敲低效率验证
阅读提示:Methods: Small Interfering RNA Transfection 和 Figure 6 图注