BCAT1激活重编程支链氨基酸代谢并表观遗传学促进糖尿病视网膜病变中的炎症

BCAT1 Activation Reprograms Branched-Chain Amino Acid Metabolism and Epigenetically Promotes Inflammation in Diabetic Retinopathy

作者信息Jingyi Wang, Zihan Yin, Jingxiao Yang, Sijun Sun, Xiaofang Tang, Shengjie Zhang, Yi-Ping Wang, Haiyan Wang
PMID40530920
发布时间2025-06
DOI10.1167/iovs.66.6.59

实验完整度

包含单细胞测序、代谢组学、ChIP、RNA测序、激酶筛选、体内动物模型及抑制剂处理,体外和体内功能验证与机制验证完整。

主要模型

rMC-1大鼠视网膜Müller细胞系 db/db糖尿病小鼠模型 WT C57BL/6J小鼠模型 糖尿病视网膜病变患者玻璃体液样本

重点核对

Bcat1在Müller细胞中的表达及活性变化 高糖处理Müller细胞中Bcat1对BCAA代谢和炎症基因表达的影响 Bcat1抑制剂(BAY-069和ERG240)对糖尿病小鼠视网膜炎症和血管渗漏的作用 Plk4介导的Bcat1 T333磷酸化对Bcat1活性的调控

摘要

目的:研究支链氨基酸(BCAA)代谢如何被重塑,并确定其在糖尿病视网膜病变进展中的作用。方法:我们使用单细胞测序数据和免疫荧光分析了视网膜中Bcat1和Bcat2的表达。通过Müller细胞中的靶向代谢组学评估了Bcat1介导的BCAA代谢重塑。我们进行了染色质免疫沉淀(ChIP)以检测炎症基因启动子处的组蛋白甲基化。此外,我们利用RNA测序和激酶筛选试验来描绘Bcat1活性的磷酸化调控。在体内,我们建立了糖尿病小鼠模型,并用Bcat1特异性抑制剂处理以评估视网膜炎症和血管渗漏。结果:Bcat1主要在Müller细胞中表达,并在糖尿病条件下活性增加,导致BCAA分解代谢重塑和炎症基因(白细胞介素6 [Il6]和肿瘤坏死因子-α [Tnf-α])上调。Bcat1活性受polo样激酶4(Plk4)介导的苏氨酸333磷酸化负调控。在高糖处理的Müller细胞中,Bcat1活性升高降低了α-酮戊二酸(α-KG),这是组蛋白去甲基化反应的关键底物,导致炎症基因启动子处组蛋白H3赖氨酸4三甲基化(H3K4me3)水平升高,并进一步加剧视网膜炎症。化学Bcat1抑制剂(BAY-069和ERG240)处理显著降低了糖尿病视网膜中炎症基因表达和血管渗漏。结论:Bcat1激活介导Müller细胞中BCAA代谢重塑并表观遗传学诱导视网膜炎症,这为糖尿病视网膜病变提供了潜在的治疗靶点。糖尿病和糖尿病视网膜病变可能不仅由高血糖驱动,还由氨基酸代谢紊乱驱动。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
糖尿病视网膜病变中支链氨基酸代谢如何被重塑,以及这种重塑是否通过表观遗传机制促进视网膜炎症。
核心机制
在糖尿病条件下,Müller细胞中Bcat1活性增加,促进BCAA分解代谢,降低α-KG水平,导致组蛋白H3K4me3水平在炎症基因启动子处升高,从而上调炎症因子(Il6、Tnf-α、Gfap、Cxcl10),加剧视网膜炎症和血管渗漏。
主要证据
通过单细胞测序和免疫荧光确定Bcat1在Müller细胞中高表达;在rMC-1细胞中,高糖处理升高Bcat1活性并上调炎症基因,Bcat1敲低或抑制剂处理降低炎症基因和H3K4me3水平;ChIP实验显示Bcat1敲低降低炎症基因启动子H3K4me3;糖尿病小鼠模型中,Bcat1抑制剂(BAY-069和ERG240)显著降低炎症基因表达和血管渗漏。
研究意义
揭示BCAT1通过代谢-表观遗传轴促进糖尿病视网膜病变炎症,提出BCAT1作为治疗糖尿病视网膜病变的潜在靶点,并支持糖尿病及其并发症不仅由高血糖驱动,还由氨基酸代谢紊乱驱动。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

临床样本代谢分析

检测糖尿病视网膜病变患者玻璃体中BCAA水平,确定BCAA代谢与疾病关联。

收集35例PDR患者和22例非糖尿病黄斑裂孔患者的玻璃体液,采用质谱法检测BCAA(亮氨酸、异亮氨酸、缬氨酸)水平。

2

Bcat1和Bcat2在视网膜中的表达和定位

确定Bcat1和Bcat2在视网膜不同细胞类型中的表达及亚细胞定位。

利用公开的单细胞RNA测序数据分析Bcat1和Bcat2在视网膜细胞中的表达;通过免疫荧光共染色检测Bcat1与Müller细胞标志物Gs、Bcat2与线粒体标志物Tom20的共定位。

3

验证Bcat1对Müller细胞BCAA代谢的调控

验证高糖条件下Bcat1表达或活性变化对BCAA代谢产物的影响。

在rMC-1细胞中敲低Bcat1(siRNA),并在高糖(30 mM)或正常糖(5.5 mM+甘露醇)条件下培养,检测α-KG、BCAA(Leu、Ile、Val)和Glu水平。

4

验证Bcat1对Müller细胞炎症反应的影响

确定Bcat1是否调控高糖诱导的Müller细胞炎症基因表达。

在rMC-1细胞中敲低Bcat1或用化学抑制剂(BAY-069、ERG240)处理,高糖刺激后检测炎症基因(Gfap、Il6、Tnf-α、Cxcl10、Ccl7)的mRNA表达。

5

体内验证Bcat1抑制对糖尿病小鼠视网膜炎症的作用

评估Bcat1抑制剂对糖尿病小鼠视网膜炎症和功能的影响。

对db/db小鼠和WT小鼠进行玻璃体腔注射BAY-069(1 mM)或ERG240(100或200 µM),分别处理2或4周,检测视网膜中炎症基因(Gfap、Il6)表达和GFAP免疫荧光。

6

验证Bcat1通过降低α-KG上调H3K4me3促进炎症

阐明Bcat1调控炎症的表观遗传机制,即α-KG水平变化对组蛋白甲基化的影响。

在rMC-1细胞中敲低Bcat1或过表达Flag-BCAT1,并在有无外源α-KG(1 mM)条件下,进行ChIP-qPCR检测炎症基因启动子处H3K4me3和H3K9me3水平,同时检测炎症基因表达。

7

验证Plk4介导的Bcat1磷酸化调控Bcat1活性

确定Bcat1活性是否受Plk4介导的T333磷酸化负调控,并阐明糖尿病条件下该调控的变化。

在rMC-1细胞中共表达Flag-BCAT1与HA-PLK4、MASTL或BMPR1B,检测Bcat1磷酸化水平和酶活性;比较正常和高糖条件下Bcat1 T333磷酸化水平;检测db/db小鼠视网膜中Plk4表达和Bcat1 T333磷酸化。

8

Bcat1抑制剂对糖尿病小鼠视网膜血管渗漏的影响

评估Bcat1抑制对糖尿病视网膜血管功能损伤的改善作用。

对db/db小鼠玻璃体腔注射BAY-069,使用Evans Blue染色评估视网膜血管渗漏。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

表观遗传学分析
蛋白质相互作用与修饰分析
激酶筛选

产品清单

实验环节名称品牌货号
杜尔贝科改良伊格尔培养基Thermo Fisher Scientific--
胎牛血清ExCell Bio--
青霉素-链霉素----
Lipofectamine 3000转染试剂Thermo Fisher Scientific--
靶向Bcat1的小干扰RNA----
BAY-069MedChemExpressHY-148242
ERG240MedChemExpressHY-W193545A
抗BCAT1抗体Cell Signaling Technology88785
抗BCAT2抗体Cell Signaling Technology79764
抗GFAP抗体Cell Signaling Technology#12389
抗GS抗体Abcamab64613
抗PLK4抗体Proteintech28750-1-AP
抗Flag抗体Sigma-AldrichF1804
抗HA抗体Santa Cruz Biotechnologysc-7392
抗H3K4me3抗体Cell Signaling Technology9751
抗H3K9me3抗体Cell Signaling Technology13969
抗CRALBP抗体ABclonalA9094
抗TOM20抗体Proteintech66777-1-Ig
抗β-肌动蛋白抗体Cell Signaling Technology3700
抗FLAG M2琼脂糖珠Sigma-Aldrich--
SuperSignal West Pico PLUS化学发光底物Thermo Fisher Scientific34580
Pierce免稀释快速金BCA蛋白定量试剂盒Thermo Fisher ScientificA55860
Bcat酶活性检测试剂盒JONLNBIOJL-T1334
BCAA检测试剂盒BeyotimeS0535S
TRIzol试剂Thermo Fisher Scientific--
PrimeScript逆转录试剂盒Takara--
TB Green Premix Ex TaqTakara--
SYBR Green----
DAPIYeasen Biotechnology--
徕卡SP8激光扫描共聚焦显微镜Leica--
Agilent 4150生物分析仪Agilent Technologies--
ABclonal mRNA测序文库制备试剂盒ABclonal--
NovaSeq 6000测序系统Illumina--
MGISEQ-T7测序仪MGI Tech--
质谱法----
托吡卡胺滴眼液----
伊文思蓝----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
临床样本
PDR患者和对照组样本量、纳入排除标准、玻璃体采集方法
阅读提示:见Materials and Methods中Human Tissue部分
细胞培养与处理
rMC-1细胞培养条件、高糖浓度(30 mM)、渗透压对照(甘露醇24.5 mM)、处理时间(48小时)、siRNA转染条件
阅读提示:见Materials and Methods中Cell Culture部分
动物模型与注射
db/db小鼠周龄、性别、遗传背景、注射剂量(BAY-069 1 mM、ERG240 100或200 µM)、注射体积(1 µL)、处理时长(2或4周)
阅读提示:见Materials and Methods中Animal Models和Intravitreal Injection of Compounds部分
Bcat1活性测定
细胞或视网膜裂解物制备、蛋白定量方法、Bcat活性检测试剂盒型号及操作步骤
阅读提示:见Materials and Methods中Bcat Enzymatic Activity Assay部分
表观遗传学分析
细胞交联条件、染色质断裂方法、ChIP抗体(H3K4me3、H3K9me3)、qPCR引物、富集计算方法
阅读提示:见Materials and Methods中Chromatin Immunoprecipitation and Quantitative PCR部分及补充表S1
体内药效评估
Evans Blue注射剂量(50 mg/kg)、循环时间(2小时)、视网膜分离与成像条件
阅读提示:见Materials and Methods中Evans Blue Assay部分