PERK调控晶状体上皮细胞通过自噬和脂质代谢进行的上皮-间质转化

PERK Regulates Epithelial-Mesenchymal Transition Through Autophagy and Lipid Metabolism in Lens Epithelial Cells

作者信息Xiaoran Wang, Baoxin Chen, Jieping Chen, Mi Huang, Shan Huang
PMID40408092
发布时间2025-05-01
DOI10.1167/iovs.66.5.35

实验完整度

包含体外细胞实验、体内小鼠模型、患者样本RNA-seq、脂质组学、多种分子检测,并进行功能验证与机制验证。

主要模型

兔原代晶状体上皮细胞 人晶状体外植体 小鼠损伤诱导囊膜纤维化模型 ASC患者晶状体囊膜样本

重点核对

TGFβ2浓度:5 ng/mL,处理48小时 PERK抑制剂ISRIB浓度:4 µM(体外)或5 µM(体内注射2 µL) 小鼠模型:6-8周龄C57BL/6小鼠,26号针头穿刺前囊膜,深度约300 µm ATF4 siRNA转染浓度:50 nM 雷帕霉素浓度:250 nM,氯喹浓度:50 µM

摘要

目的:病理性上皮-间质转化(EMT)在晶状体纤维化形成中起关键作用,尤其是在纤维性后发性白内障和前囊下白内障(ASC)中。本文探讨了内质网(ER)应激在晶状体纤维化发展中的潜在作用。方法:对ASC患者以及TGFβ2诱导的人晶状体外植体和兔原代晶状体上皮细胞进行RNA测序以检测全局基因表达变化。兔晶状体上皮细胞在有无ER应激调节剂PERK抑制剂ISRIB和自噬诱导剂的情况下用TGFβ2处理进行体外研究。体内研究使用损伤诱导的囊膜纤维化小鼠模型,并给予ISRIB。为了揭示潜在机制,我们进行了脂质组学分析、透射电子显微镜、免疫染色、定量PCR、Western blot和毛细血管Western免疫分析。结果:在ASC患者、TGFβ2刺激的人外植体和原代晶状体上皮细胞中ER应激基因上调。药理学ER应激诱导促进EMT,而其抑制降低TGFβ2诱导的间充质基因水平。用ISRIB阻断ER应激的PERK轴或靶向下游因子ATF4抑制EMT,而IRE1轴无影响。与这些体外观察一致,前房注射ISRIB也通过抑制SMAD2/3激活减少了小鼠晶状体纤维化模型中的囊下斑块形成。机制上,ISRIB抑制LC3-II转化和P62降解,表明自噬抑制。脂质组学揭示磷脂酰乙醇胺(PE)在TGFβ2处理的LECs中下调,ISRIB共处理上调。用雷帕霉素诱导自噬显著逆转了ISRIB对间充质基因的抑制,而自噬抑制剂CQ产生相反效果。结论:ER应激,特别是PERK轴,通过自噬和PE代谢促进LECs的EMT,为晶状体纤维化的治疗提供了潜在靶点。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
内质网应激在晶状体纤维化发展中的作用及其潜在机制。
核心机制
TGFβ2诱导的内质网应激通过PERK/ATF4轴激活自噬,调节磷脂酰乙醇胺代谢,促进晶状体上皮细胞上皮-间质转化。
主要证据
ASC患者、TGFβ2诱导的人晶状体外植体和兔原代LECs中ER应激基因上调;ISRIB或ATF4 siRNA抑制EMT;ISRIB抑制小鼠模型囊下斑块形成并抑制SMAD2/3激活;ISRIB抑制自噬及PE代谢改变。
研究意义
PERK抑制可能是减少EMT和改善纤维化疾病的潜在治疗策略。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

建立纤维化模型并分析分子特征

探究晶状体纤维化及TGFβ2刺激的LECs中的分子特征。

对ASC患者、人晶状体外植体、兔原代LECs进行RNA-seq,分析差异表达基因和相关通路;建立小鼠损伤诱导囊膜纤维化模型。

2

检测ER应激在EMT过程中的激活

验证ER应激是否在晶状体纤维化和TGFβ2诱导的LECs EMT中被诱导。

检测BiP表达、ER应激传感器表达、ER形态(电镜)。

3

验证ER应激与EMT的相互调节

确定ER应激是否促进EMT进展,以及抑制ER应激是否抑制EMT。

使用ER应激诱导剂(thapsigargin、tunicamycin)和抑制剂4-PBA处理LECs,检测间充质基因和上皮标志物表达。

4

评估PERK/ATF4分支对EMT的必要性

确定PERK/ATF4或IRE1/XBP1分支是否特异性地调控TGFβ2诱导的EMT。

使用ISRIB、4µ8C、其他IRE1α抑制剂、ATF4 siRNA处理LECs,检测间充质基因表达。

5

验证ISRIB在体内的抗纤维化效果

验证ISRIB能否抑制小鼠损伤诱导的晶状体纤维化。

建立小鼠模型并前房注射ISRIB,通过裂隙灯和免疫荧光评估囊下斑块形成和α-SMA表达。

6

探究ISRIB对SMAD2/3信号的影响

确定ISRIB是否通过调节SMAD2/3信号抑制EMT。

检测TGFβ2和ISRIB处理后SMAD2/3磷酸化、核转位。

7

脂质组学分析ISRIB对磷脂酰乙醇胺代谢的作用

探究ISRIB是否通过调节脂质代谢(尤其PE)影响EMT。

对对照、TGFβ2、TGFβ2+ISRIB组LECs进行脂质组学分析,鉴定差异脂质,进行通路富集。

8

验证ISRIB对自噬的抑制作用

确定ISRIB是否通过抑制自噬来发挥抗纤维化作用。

通过透射电镜、mRFP-GFP-LC3探针、免疫荧光、Western blot检测自噬标志物LC3-II和P62。

9

验证自噬在ISRIB抗纤维化中的作用

确认自噬是否介导ISRIB的抗纤维化效果。

使用自噬诱导剂雷帕霉素和抑制剂CQ处理LECs,检测间充质基因表达。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
ISRIBSelleckchemS0706
最低必需培养基Thermo Fisher Scientific11095080
胎牛血清Gibco10099141C
非必需氨基酸Thermo Fisher Scientific11140050
抗生素Thermo Fisher Scientific15140122
转化生长因子β2R&D Systems302-B2-010
4µ8CSelleckchemS7272
脂质体转染试剂3000Thermo Fisher Scientificl3000015
Smad2/3抗体Cell Signaling Technology8685
p-Smad2/3抗体Affinity BiosciencesAF3367
α-SMA抗体Abcamab7817
FN抗体Abcamab2413
BiP抗体Cell Signaling Technology3177
P62抗体Abcamab56416
RIPA裂解液BeyotimeP0013C
蛋白酶抑制剂混合物Roche04906837001
BCA蛋白定量试剂盒BeyotimeP0012
GAPDH抗体Cell Signaling Technology2118
ACTIN抗体Cell Signaling Technology3700
p-eIF2α抗体Cell Signaling Technology9721
eIF2α抗体Cell Signaling Technology9722
IRE1α抗体Cell Signaling Technology3294
波形蛋白抗体Cell Signaling Technology5741
β-连环蛋白抗体Cell Signaling Technology8480
LC3抗体Cell Signaling Technology12741
p-SMAD2/3抗体Cell Signaling Technology8828
SMAD2/3抗体Cell Signaling Technology8685
FN抗体Abcamab137720
α-SMA抗体Abcamab7817
P62抗体Abcamab56416
Wes系统ProteinSimple--
RNA提取试剂盒Qiagen74104
PrimeScript逆转录预混液Takara BioRR036A
ChamQ SYBR Color qPCR预混液VazymeQ431-02
StepOnePlus实时荧光定量PCR仪Applied Biosystems--
NEBNext Ultra RNA文库制备试剂盒New England Biolabs--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
动物模型
小鼠品系:C57BL/6;周龄:6-8周;损伤方式:26号针头垂直插入前囊膜,深度约300 µm;ISRIB注射剂量:2 µL(5 µM);对照组注射等量PBS。
阅读提示:详见 Methods 中 Animal Experiments 部分。
细胞培养与处理
细胞类型:兔原代晶状体上皮细胞(传代3-5次);培养基:MEM添加10% FBS、NEAA、抗生素;TGFβ2浓度:5 ng/mL;ISRIB浓度:4 µM(体外);处理时间:72小时(EMT检测)。
阅读提示:详见 Methods 中 Cell Culture and Treatment 部分。
RNA-seq
样本类型:ASC患者和正常供体晶状体囊膜、人晶状体外植体、兔原代LECs;TGFβ2处理:5 ng/mL,48小时;每个样本合并3个囊膜;测序平台:Illumina HiSeq;差异基因筛选标准:P<0.05,log2|FC|>1。
阅读提示:详见 Methods 中 Lens Collection and RNA Sequencing 部分及图例1。
ER应激检测
检测BiP表达:免疫荧光、Wes;检测ER应激传感器:RT-qPCR、Western blot;检测ER形态:透射电镜;TGFβ2时间和剂量梯度。
阅读提示:详见 Methods 中相关部分及图2图例。
EMT诱导与抑制
ER应激诱导剂:thapsigargin(1 µM,6小时或梯度剂量40小时)、tunicamycin(5 µg/mL,6小时);ER应激抑制剂:4-PBA;PERK抑制剂:ISRIB;IRE1抑制剂:4µ8C(25 µM)及其他IRE1抑制剂。
阅读提示:详见 Results 中相应结果及图3、图4图例。
ATF4敲低
siRNA浓度:50 nM;转染试剂:Lipofectamine 3000;转染时间:48小时;对照:非靶向siRNA。
阅读提示:详见 Methods 中 Transfection With Small Interfering RNA 部分。
体内给药
给药方式:前房注射;ISRIB体积:2 µL,浓度5 µM;对照组注射PBS;观察时间:损伤后7天。
阅读提示:详见 Methods 中 Animal Experiments 部分及图5图例。
SMAD2/3检测
检测磷酸化SMAD2/3和总SMAD2/3;核转位检测;体内免疫荧光。
阅读提示:详见 Results 中 ISRIB Partially Blocks SMAD2/3 Activation 部分及图6图例。
自噬检测
透射电镜观察自噬泡;mRFP-GFP-LC3探针检测自噬流;Western blot检测LC3-II和P62;ISRIB处理时间和剂量依赖性。
阅读提示:详见 Methods 中相关部分及图8图例。
脂质组学
细胞样品:对照、TGFβ2、TGFβ2+ISRIB;提取方法:MTBE/MeOH;质谱:ESI-QTRAP-MS/MS;数据分析:PCA、PLS-DA、KEGG富集。
阅读提示:详见 Methods 中 Lipidomics Analysis 部分。