临床样本病理评估
确认 PDR 患者 FVM 中纤维化与新生血管共存的组织学特征
对4例 PDR 患者的 FVM 进行石蜡包埋切片,行 H&E 和 Masson 三色染色,以及多重免疫组化检测 PRRX1、CD31、α-SMA、NG2 表达。
PRRX1 Orchestrates Pericyte-Myofibroblast Transition in Pathological Retinal Fibrosis
整合人 FVM 与 OIR 转录组、scRNA-seq、体外低氧周细胞敲低功能验证及体内 CNV 模型验证,多证据层级支持。
人纤维血管膜样本 小鼠氧诱导视网膜病变模型 原代小鼠视网膜周细胞 小鼠激光诱导脉络膜新生血管模型
人 FVM 样本来源:来自4例 PDR 患者,25G 玻璃体切除术获取 scRNA-seq 数据集:GSE150703(OIR 小鼠视网膜)和 GSE165784(人 FVM) 低氧处理:原代周细胞在1% O2 下培养24小时 siRNA 敲低:使用 si-Prrx1(序列 5′-GCAGGAAUGAGCGAGCCAU-3′)或 si-NC 转染,浓度20 µM CNV 模型:C57BL/6J 小鼠(雄性,6-8周龄),每眼4个激光斑(532 nm,160 mW,0.2秒),玻璃体注射 si-Prrx1(1 µL,50 µM)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认 PDR 患者 FVM 中纤维化与新生血管共存的组织学特征
对4例 PDR 患者的 FVM 进行石蜡包埋切片,行 H&E 和 Masson 三色染色,以及多重免疫组化检测 PRRX1、CD31、α-SMA、NG2 表达。
评估 PRRX1 在病理视网膜纤维化中的表达及其与纤维化相关基因的关联
分析多个公开 bulk RNA-seq 数据集(GSE194176, GSE123945, GSE101398, GSE102485, GSE158799)和 scRNA-seq 数据集(GSE150703, GSE165784),进行差异表达、相关性、聚类和轨迹分析。
验证 PRRX1 在低氧诱导的周细胞-肌成纤维细胞转变中的作用
原代小鼠视网膜周细胞在低氧(1% O2)下培养,并通过 siRNA 敲低 Prrx1,检测纤维化基因表达、迁移能力及蛋白水平变化。
评估 PRRX1 沉默对激光诱导脉络膜新生血管模型中视网膜下纤维化的影响
C57BL/6J 小鼠行激光诱导 CNV,随后玻璃体腔注射 si-Prrx1 或 si-NC,第7天取材,通过 Western blot 和脉络膜铺片免疫荧光检测 Prrx1、Col1a1、IB4 表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 组织学染色 | 伊红 | Beyotime | C0105M-2 |
| Masson 三色染色试剂盒 | Servicebio | G1006-20ML | |
| 免疫组化 | 酪胺信号放大试剂盒 | AiFang Biological | AFIHC025 |
| 柠檬酸盐缓冲液 | Servicebio | G1202 | |
| 正常山羊血清 | Beyotime | C0265 | |
| PRRX1 抗体 | Abmart | TD4274S | |
| CD31 抗体 | Abcam | ab182981 | |
| α-SMA 抗体 | Abcam | ab7817 | |
| NG2 抗体 | Proteintech | 55027-1-AP | |
| HRP 标记二抗 | AiFang Biological | AFIHC001 | |
| DAPI | Beyotime | C1006 | |
| 显微镜成像 | 光学显微镜 | Olympus | BX53 |
| 共聚焦显微镜 | Zeiss | LSM | |
| 细胞培养 | DMEM 培养基 | Gibco | 11960044 |
| 胎牛血清 | Biological Industries | 04-001-1A | |
| GlutaMax 添加剂 | Gibco | 35050061 | |
| 青霉素-链霉素 | Beyotime | C0222 | |
| siRNA 转染 | 小干扰 RNA | GENCEFE Biotech | -- |
| RNAi 转染试剂 | D-Nano Therapeutics | DN001-10 | |
| 细胞迁移实验 | Transwell 小室 | BIOFIL | TCS003006 |
| 结晶紫 | Beyotime | C0121 | |
| 细胞免疫荧光 | Triton X-100 | Beyotime | P0096 |
| 山羊血清 | Beyotime | C0265 | |
| PRRX1 抗体 | Abmart | TD4274S | |
| NG2 抗体 | Proteintech | 55027-1-AP | |
| α-SMA 抗体 | Abcam | ab7817 | |
| 荧光二抗 | Invitrogen | A-11034 | |
| 荧光二抗 | Invitrogen | A-11030 | |
| RNA 提取 | TRIzol 试剂 | Invitrogen | 10296010 |
| RNA 建库 | VAHTS Universal V6 RNA 测序文库制备试剂盒 | Vazyme | NR604 |
| 蛋白质印迹 | RIPA 裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂 | Beyotime | P1045 | |
| 5× 上样缓冲液 | Beyotime | P0015 | |
| PVDF 膜 | Beyotime | FFP22 | |
| 无蛋白快速封闭液 | EpiZyme | PS108P | |
| PRRX1 抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-293386 | |
| β-actin 抗体 | Beyotime | AF5003 | |
| 二抗 | Beyotime | A0208 | |
| 二抗 | Beyotime | A0216 | |
| qRT-PCR | SPARKeasy 细胞 RNA 提取试剂盒 | parkjade Biotechnology | AC0205 |
| PrimeScript RT 预混液 | Takara Bio | RR036A | |
| ChamQ SYBR Color qPCR 预混液 | Vazyme | Q431-02 | |
| 实时荧光定量 PCR 仪 | Applied Biosystems | StepOnePlus | |
| 动物实验 | 激光系统 | Phoenix MICRON | -- |
| 30G 针头 | Hamilton | -- | |
| 脉络膜铺片 | Triton X-100 | Biosharp | BL935B |
| 异凝集素 GS-IB4 | Invitrogen | 121413 | |
| Col1a1 抗体 | Cell Signaling Technology | 72026S |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本采集 | 样本来源:PDR 患者 FVM;样本量:4例;手术方式:25G 玻璃体切除术 阅读提示:Methods: Clinical Samples |
| 组织学与免疫组化 | 固定:4% PFA 24小时;切片厚度:5 µm;抗体稀释比例:PRRX1 1:200, CD31 1:500, α-SMA 1:100, NG2 1:100 阅读提示:Methods: Histopathological Assessment, Multiplex Immunohistochemistry |
| 转录组数据分析 | 数据集标识:GSE194176, GSE123945, GSE101398, GSE102485, GSE158799, GSE150703, GSE165784;差异表达阈值:FDR < 0.05, |LogFC| > 1 阅读提示:Methods: Bulk RNA-seq Analysis, Single-cell RNA sequencing Analysis |
| 体外低氧周细胞模型 | 细胞:原代小鼠视网膜周细胞(Pricella CP-M315);低氧条件:1% O2, 24小时;siRNA 浓度:20 µM 阅读提示:Methods: Cell Culture and Hypoxia Induction, Small Interfering RNA Transfection |
| CNV 动物模型 | 动物品系:C57BL/6J,雄性,6-8周龄;激光参数:532 nm, 160 mW, 0.2秒/斑,每眼4个斑;siRNA 剂量:1 µL, 50 µM;处理时间:第7天取材 阅读提示:Methods: Choroidal Neovascularization Model |