单细胞转录组学揭示小鼠角膜的细胞异质性和复杂的细胞-细胞通讯网络

目的：生成小鼠角膜的单细胞RNA测序（scRNA-seq）图谱，并构建细胞间的通讯网络。方法：将C57BL/6小鼠角膜解离为单细胞并进行scRNA-seq。使用R包“Seurat”对细胞群体进行聚类和注释以进行生物信息学分析。通过全组织免疫荧光染色验证差异表达模式并进行空间定位。使用CellChat构建全局细胞间信号网络。结果：对来自40个角膜的14,732个细胞进行无偏聚类，揭示了17个细胞簇，分为六种主要细胞类型：九个上皮细胞簇、三个角膜细胞簇、两个角膜内皮细胞簇，以及免疫细胞、血管内皮细胞和成纤维细胞各一个簇。九个上皮细胞亚型包括静止期角膜缘干细胞、瞬时扩增细胞和来自角膜的分化细胞，以及两个次要的结膜上皮细胞簇。CellChat分析提供了所有细胞类型之间复杂的细胞间信号通讯图谱。结论：我们构建了完整的角膜单细胞转录组图谱以及所有细胞类型之间的复杂信号串扰，可作为角膜进一步研究的基础图谱。这项研究也加深了对角膜内细胞异质性和异型细胞间相互作用的理解。