培养体系比较
比较2D、直接3D和间接3D培养系统对LESCs生长和干性维持的影响,并评估旁分泌作用。
将人角膜缘外植体分别置于2D、直接3D和间接3D培养系统中培养,比较细胞形态、密度、p63α、K12、K14的表达。
Extracellular Vesicle MicroRNAs From Corneal Stromal Stem Cell Enhance Stemness of Limbal Epithelial Stem Cells by Targeting the Notch Pathway
包含2D/3D共培养模型、EV分离鉴定与功能实验(GW4869抑制、EV添加)、miRNA测序及靶向验证(siRNA敲低Alix、miR-663b转染),涵盖体外模型、功能验证和机制验证。
人角膜缘上皮干细胞(LESCs) 人角膜基质干细胞(CSSCs) 2D/3D共培养体系
CSSC-EV浓度:1.65×10^6、3.3×10^6、6.6×10^6 particles/mL GW4869浓度:10 μM miR-663b转染及Notch1通路蛋白(Notch1、NICD、Hes1)检测 Alix siRNA敲低验证EV miRNA包装
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较2D、直接3D和间接3D培养系统对LESCs生长和干性维持的影响,并评估旁分泌作用。
将人角膜缘外植体分别置于2D、直接3D和间接3D培养系统中培养,比较细胞形态、密度、p63α、K12、K14的表达。
从CSSC条件培养基中分离并鉴定细胞外囊泡,并验证其可被LESCs摄取。
通过超速离心法从CSSC培养上清中分离EVs,用透射电镜观察形态,NanoSight分析粒径,Western blot检测标志物(Alix、TSG101、CD81),并用PKH67标记EVs与LESCs共孵育观察摄取。
通过GW4869抑制CSSC-EV分泌,验证CSSC-EVs在CSSC介导的LESCs表型调控中的作用。
在间接3D共培养系统中加入GW4869或溶剂DMSO,比较LESCs的形态、细胞密度及p63α、K12、K14的表达。
评估不同浓度CSSC-EVs对2D培养LESCs的干性和增殖的影响。
在2D培养的LESCs培养基中分别添加不同浓度的CSSC-EVs,比较细胞密度、p63α、K12、K14的表达和阳性细胞比例。
鉴定CSSC-EVs中miRNA谱,并验证其中miRNA(尤其是miR-663b)对LESCs表型和Notch通路的调控作用。
对CSSC-EVs进行小RNA测序,利用siRNA敲低CSSC中Alix表达以降低EV miRNA包装,比较EV-Ctrl和EV-AlixKD对LESCs的影响;另将miR-663b转染至LESCs,检测p63α、K12、Notch1、NICD、Hes1的表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | MEMA Alpha基础培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 非必需氨基酸 | -- | -- | |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| DMEM/F12培养基 | -- | -- | |
| 表皮生长因子 | -- | -- | |
| 胰岛素 | -- | -- | |
| 霍乱毒素 | -- | -- | |
| 氢化可的松 | -- | -- | |
| 3,3,5-三碘-L-甲状腺原氨酸 | -- | -- | |
| Optisol | -- | -- | |
| EV分离 | 无EV胎牛血清 | SBI | EXO-FBS-50A-1 |
| EV鉴定 | PKH67 | Umibio | UR52303 |
| DAPI | Beyotime | C1006 | |
| EV抑制 | GW4869 | -- | -- |
| CCK8试剂盒 | -- | -- | |
| CD81 ELISA试剂盒 | -- | -- | |
| 二甲基亚砜 | -- | -- | |
| siRNA转染 | Lipo6000转染试剂 | Beyotime Biotechnology | -- |
| RNA提取与qPCR | RNAprep纯细胞试剂盒 | Tiangen | DP430 |
| HiScript III一步法反转录预混液 | Vazyme | R333 | |
| Taq Pro通用SYBR qPCR预混液 | Vazyme | Q712 | |
| miRNA检测 | MiPure细胞/组织miRNA试剂盒 | Vazyme | RC201 |
| miRNA第一链cDNA合成试剂盒 | Vazyme | MR101 | |
| miRNA通用SYBR qPCR预混液 | Vazyme | MQ101 | |
| Western blot | 抗TSG101抗体 | Abcam | ab125011 |
| 抗CD81抗体 | Abcam | ab109201 | |
| Alix抗体 | Protein Tech | 12422-1-AP | |
| Notch1抗体 | Abcam | ab52627 | |
| NICD抗体 | Cell Signaling | D3B8 | |
| Hes1抗体 | Abcam | ab108937 | |
| GAPDH抗体 | Protein Tech | 1E6D9 | |
| 免疫荧光 | 抗p63α抗体 | Abcam | ab124762 |
| 抗K12抗体 | Santa Cruz | sc-515882 | |
| 抗K14抗体 | Abcam | ab7800 | |
| EV形态观察 | JEM-2100透射电子显微镜 | JEOL | -- |
| EV粒径分析 | NanoSight系统 | Malvern | -- |
| 显微镜观察 | 荧光显微镜CX53 | Olympus | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | CSSC培养条件:MEM Alpha基础培养基、10% FBS、1%青霉素/链霉素、1%非必需氨基酸;LESC培养基成分:DMEM/DMEM-F12(1:1)、10% FBS、10 ng/mL EGF、5 μg/mL胰岛素、10^-10 M霍乱毒素、0.4 μg/mL氢化可的松、2×10^-9 M三碘甲状腺原氨酸;培养温度37°C、5% CO2 阅读提示:参见Methods: Corneal Stromal Stem Cell Culture, Limbal Epithelial Stem Cell Culture |
| 共培养体系 | CSSC预处理:30 μg/mL丝裂霉素C处理2小时;CSSC接种密度:2000 cells/cm²;聚酯膜孔径0.4 μm,面积4.67 cm² 阅读提示:参见Methods: Limbal Epithelial Stem Cell Culture, Figure 1A |
| EV分离与添加 | EV分离方法:超速离心(2000×g 10分钟,10000×g 30分钟,100000×g 70分钟两次);EV添加浓度:1.65×10^6、3.3×10^6、6.6×10^6 particles/mL;添加时间:第1、3、5天 阅读提示:参见Methods: Extracellular Vesicles Collection and Identification |
| EV抑制实验 | GW4869浓度:10 μM(基于CCK8毒性和CD81 ELISA确定);对照组加入等体积DMSO 阅读提示:参见Methods: Exosome Inhibition Assay |
| siRNA敲低 | Alix siRNA浓度:50 nM;转染试剂:Lipo6000;转染时间:6小时;培养时间:48小时(EV-free培养基) 阅读提示:参见Methods: siRNA Knockdown of Alix Expression |