角膜基质干细胞来源的细胞外囊泡 microRNA 通过靶向 Notch 通路增强角膜缘上皮干细胞的干性

Extracellular Vesicle MicroRNAs From Corneal Stromal Stem Cell Enhance Stemness of Limbal Epithelial Stem Cells by Targeting the Notch Pathway

作者信息Leying Wang, Xizhan Xu, Qiankun Chen, Yuan Wei, Zhenyu Wei, Zi-Bing Jin, Qingfeng Liang
PMID37768272
发布时间2023-09-01
DOI10.1167/iovs.64.12.42

实验完整度

包含2D/3D共培养模型、EV分离鉴定与功能实验(GW4869抑制、EV添加)、miRNA测序及靶向验证(siRNA敲低Alix、miR-663b转染),涵盖体外模型、功能验证和机制验证。

主要模型

人角膜缘上皮干细胞(LESCs) 人角膜基质干细胞(CSSCs) 2D/3D共培养体系

重点核对

CSSC-EV浓度:1.65×10^6、3.3×10^6、6.6×10^6 particles/mL GW4869浓度:10 μM miR-663b转染及Notch1通路蛋白(Notch1、NICD、Hes1)检测 Alix siRNA敲低验证EV miRNA包装

摘要

目的:角膜缘微环境支持角膜缘上皮干细胞(LESCs)的自我更新。角膜基质干细胞(CSSCs)是微环境中调节 LESC 表型的重要成分。然而,LESCs 和 CSSCs 之间的细胞间通讯尚未阐明。方法:采用传统的二维(2D)系统、直接三维(3D)系统和间接 3D 共培养系统来阐明 CSSCs 对 LESCs 的旁分泌通路效应。为了揭示 CSSC 来源的细胞外囊泡(CSSC-EVs)对 LESCs 的影响,将 GW4869 和 CSSC-EVs 分别添加到 LESC 培养基中。比较了这些方法中的生长率、细胞密度、分化和干性维持。对 CSSC-EVs 中的 miRNA 进行了测序,并通过 RT-qPCR 和 Western blotting 进一步证实了靶向的 Notch 通路。结果:与 2D 培养相比,直接和间接 3D 共培养系统均产生了更高的 LESC 生长率和干细胞标志物表达。两种共培养方法培养的 LESCs 的表型也相当。然而,GW4869 抑制了 CSSCs 对 LESCs 的作用,而在 2D 培养系统中加入 CSSC-EVs 可以增加细胞密度和 p63αbright 细胞的比例,这表明 CSSC-EVs 在调节 LESCs 中至关重要。此外,miRNA 减少的 EV-AlixKD 部分失去了其调节功能。CSSC-EVs 中丰富的 miRNA,如 hsa-miR-663b、hsa-miR-16-5p 和 hsa-miR-1290,靶向 Notch 通路。转染 miR-663b 的 LESCs 通过下调 Notch 通路具有更高的 p63 表达。结论:CSSC-EV 通过 miRNA 靶向 Notch 信号传导,在促进 LESC 增殖和干性维持方面发挥重要作用,这将增加我们对角膜缘微环境的理解,并为 LESC 培养和角膜上皮疾病的治疗提供潜在的新方法。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
角膜基质干细胞(CSSCs)是否通过旁分泌机制(特别是细胞外囊泡及其miRNA)调控角膜缘上皮干细胞(LESCs)的增殖和干性维持?
核心机制
CSSC来源的细胞外囊泡(CSSC-EVs)通过其携带的miRNA(特别是hsa-miR-663b)靶向Notch1通路,下调Notch1、NICD和Hes1的表达,从而促进LESCs的增殖和干性维持。
主要证据
直接和间接3D共培养均提高LESCs的p63α和K14表达并降低K12;GW4869抑制CSSC-EVs分泌减弱CSSC作用;添加CSSC-EVs增加细胞密度和p63αbright细胞比例;Alix敲低减少EV miRNA并部分丧失功能;miR-663b转染上调p63表达并下调Notch通路成分。
研究意义
研究增进了对角膜缘微环境的理解,并为LESCs的培养和角膜上皮疾病的治疗提供了潜在的新方法(如将CSSC-EVs作为培养基补充剂)。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

培养体系比较

比较2D、直接3D和间接3D培养系统对LESCs生长和干性维持的影响,并评估旁分泌作用。

将人角膜缘外植体分别置于2D、直接3D和间接3D培养系统中培养,比较细胞形态、密度、p63α、K12、K14的表达。

2

CSSC-EV的分离与鉴定

从CSSC条件培养基中分离并鉴定细胞外囊泡,并验证其可被LESCs摄取。

通过超速离心法从CSSC培养上清中分离EVs,用透射电镜观察形态,NanoSight分析粒径,Western blot检测标志物(Alix、TSG101、CD81),并用PKH67标记EVs与LESCs共孵育观察摄取。

3

EV分泌抑制实验

通过GW4869抑制CSSC-EV分泌,验证CSSC-EVs在CSSC介导的LESCs表型调控中的作用。

在间接3D共培养系统中加入GW4869或溶剂DMSO,比较LESCs的形态、细胞密度及p63α、K12、K14的表达。

4

CSSC-EV补充实验

评估不同浓度CSSC-EVs对2D培养LESCs的干性和增殖的影响。

在2D培养的LESCs培养基中分别添加不同浓度的CSSC-EVs,比较细胞密度、p63α、K12、K14的表达和阳性细胞比例。

5

EV miRNA谱分析及功能验证

鉴定CSSC-EVs中miRNA谱,并验证其中miRNA(尤其是miR-663b)对LESCs表型和Notch通路的调控作用。

对CSSC-EVs进行小RNA测序,利用siRNA敲低CSSC中Alix表达以降低EV miRNA包装,比较EV-Ctrl和EV-AlixKD对LESCs的影响;另将miR-663b转染至LESCs,检测p63α、K12、Notch1、NICD、Hes1的表达。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
MEMA Alpha基础培养基----
胎牛血清----
青霉素/链霉素----
非必需氨基酸----
DMEM培养基----
DMEM/F12培养基----
表皮生长因子----
胰岛素----
霍乱毒素----
氢化可的松----
3,3,5-三碘-L-甲状腺原氨酸----
Optisol----
无EV胎牛血清SBIEXO-FBS-50A-1
PKH67UmibioUR52303
DAPIBeyotimeC1006
GW4869----
CCK8试剂盒----
CD81 ELISA试剂盒----
二甲基亚砜----
Lipo6000转染试剂Beyotime Biotechnology--
RNAprep纯细胞试剂盒TiangenDP430
HiScript III一步法反转录预混液VazymeR333
Taq Pro通用SYBR qPCR预混液VazymeQ712
MiPure细胞/组织miRNA试剂盒VazymeRC201
miRNA第一链cDNA合成试剂盒VazymeMR101
miRNA通用SYBR qPCR预混液VazymeMQ101
抗TSG101抗体Abcamab125011
抗CD81抗体Abcamab109201
Alix抗体Protein Tech12422-1-AP
Notch1抗体Abcamab52627
NICD抗体Cell SignalingD3B8
Hes1抗体Abcamab108937
GAPDH抗体Protein Tech1E6D9
抗p63α抗体Abcamab124762
抗K12抗体Santa Cruzsc-515882
抗K14抗体Abcamab7800
JEM-2100透射电子显微镜JEOL--
NanoSight系统Malvern--
荧光显微镜CX53Olympus--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞培养
CSSC培养条件:MEM Alpha基础培养基、10% FBS、1%青霉素/链霉素、1%非必需氨基酸;LESC培养基成分:DMEM/DMEM-F12(1:1)、10% FBS、10 ng/mL EGF、5 μg/mL胰岛素、10^-10 M霍乱毒素、0.4 μg/mL氢化可的松、2×10^-9 M三碘甲状腺原氨酸;培养温度37°C、5% CO2
阅读提示:参见Methods: Corneal Stromal Stem Cell Culture, Limbal Epithelial Stem Cell Culture
共培养体系
CSSC预处理:30 μg/mL丝裂霉素C处理2小时;CSSC接种密度:2000 cells/cm²;聚酯膜孔径0.4 μm,面积4.67 cm²
阅读提示:参见Methods: Limbal Epithelial Stem Cell Culture, Figure 1A
EV分离与添加
EV分离方法:超速离心(2000×g 10分钟,10000×g 30分钟,100000×g 70分钟两次);EV添加浓度:1.65×10^6、3.3×10^6、6.6×10^6 particles/mL;添加时间:第1、3、5天
阅读提示:参见Methods: Extracellular Vesicles Collection and Identification
EV抑制实验
GW4869浓度:10 μM(基于CCK8毒性和CD81 ELISA确定);对照组加入等体积DMSO
阅读提示:参见Methods: Exosome Inhibition Assay
siRNA敲低
Alix siRNA浓度:50 nM;转染试剂:Lipo6000;转染时间:6小时;培养时间:48小时(EV-free培养基)
阅读提示:参见Methods: siRNA Knockdown of Alix Expression