细胞筛选与验证
鉴定MPXV感染中炎症小体激活所需的胞质先天免疫传感器,并验证其关键性。
使用CRISPR-Cas9敲除iBMDMs中多种胞质传感器基因,感染MPXV后检测IL-1β释放和细胞死亡;随后在Aim2缺陷的BMDMs、MEFs和HEK001细胞中验证AIM2的功能。
AIM2 drives inflammatory cell death and monkeypox pathogenesis
包含CRISPR筛选、原代细胞和基因敲除小鼠模型、免疫印迹和免疫荧光、体内感染和AIM2抑制剂治疗,涵盖体外功能验证和体内机制验证。
小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)及永生化BMDMs(iBMDMs) 小鼠耳成纤维细胞(MEFs) 人角质形成细胞(HEK001) C57BL/6J小鼠和CAST/EiJ小鼠MPXV感染模型
MPXV感染剂量和感染时间(MOI 0.1, 24小时) AIM2、ASC、CASP1、GSDMD等基因敲除细胞或小鼠的使用 AIM2抑制剂ODN TTAGGG sodium的给药剂量和方式(0.3 mg, 腹腔注射,感染后6小时及第1、2、3天) MPXV感染剂量(5×10^4 PFU或1×10^5 PFU)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定MPXV感染中炎症小体激活所需的胞质先天免疫传感器,并验证其关键性。
使用CRISPR-Cas9敲除iBMDMs中多种胞质传感器基因,感染MPXV后检测IL-1β释放和细胞死亡;随后在Aim2缺陷的BMDMs、MEFs和HEK001细胞中验证AIM2的功能。
明确MPXV感染诱导的细胞死亡类型以及AIM2在其中的作用。
用免疫印迹检测焦亡(CASP1、GSDMD)、凋亡(CASP3、CASP7、CASP8)和坏死性凋亡(pMLKL、pRIPK3)标志物;用免疫荧光检测ASC斑点、cleaved CASP3和pMLKL与MPXV共定位;利用基因敲除iBMDMs比较细胞死亡差异。
探究AIM2表达和细胞死亡的上游调控因子。
分析Ifnar1-/- BMDMs中STAT1磷酸化和IRF1表达;分析公开转录组数据中MPXV感染细胞IRF家族和GBP家族表达;比较Irf1-/- iBMDMs与WT的细胞死亡。
评估AIM2在MPXV感染小鼠中的病理作用及AIM2抑制剂的治疗潜力。
用MPXV感染WT和Aim2-/-小鼠,检测病毒载量、炎症因子水平和组织病理;用CAST/EiJ小鼠进行高剂量和低剂量感染,给予AIM2抑制剂或对照,评估生存率和炎症指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | IMDM培养基 | -- | 12440061 |
| 胎牛血清 | -- | 16000044 | |
| 非必需氨基酸 | Thermo Fisher Scientific | 11140-050 | |
| 青霉素-链霉素溶液 | Thermo Fisher Scientific | 15070-063 | |
| DMEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | 11995081 | |
| 角质形成细胞无血清培养基 | GIBCO-BRL | 17005-042 | |
| 人重组表皮生长因子 | -- | -- | |
| L-谷氨酰胺 | -- | -- | |
| L929细胞 | ATCC | CCL-1 | |
| Vero细胞 | American Type Culture Collection | CCL-81 | |
| MDCK细胞 | -- | -- | |
| 细胞刺激和感染 | poly(dA:dT) | InvivoGen | tlrl-patn |
| DOTAP转染试剂 | Roche | 11202375001 | |
| 超纯脂多糖 | InvivoGen | tlrl-3pels | |
| 尼日利亚霉素 | SIGMA | N7143 | |
| 鞭毛蛋白 | InvivoGen | tlrl-epstfla-5 | |
| TcdB毒素 | R&D systems | 6246-GT | |
| 高糖DMEM | Gibco | 11995-065 | |
| 高糖DMEM | WElGene | LM001-03 | |
| 细胞死亡成像和分析 | SYTOX Green染料 | Thermo Fisher Scientific | S7020 |
| 细胞因子分析 | IL-1β ELISA试剂盒 | Invitrogen | BMS6002TEN |
| IL-18 ELISA试剂盒 | R&D Systems | DY7625-05 | |
| TNF-β ELISA试剂盒 | R&D Systems | MTA00B | |
| IFN-β ELISA试剂盒 | R&D Systems | SMIF00 | |
| LDH细胞毒性检测试剂盒 | Promega | G1780 | |
| 免疫印迹分析 | 抗caspase-1抗体 | AdipoGen | AG-20B-0042 |
| 抗caspase-3抗体 | CST | 9662 | |
| 抗活化caspase-3抗体 | CST | 9661 | |
| 抗caspase-7抗体 | CST | 9492 | |
| 抗活化caspase-7抗体 | CST | 9491 | |
| 抗caspase-8抗体 | CST | 4927 | |
| 抗活化caspase-8抗体 | CST | 8592 | |
| 抗磷酸化MLKL抗体 | CST | 37333 | |
| 抗MLKL抗体 | Abgent | AP14272b | |
| 抗GSDMD抗体 | Abcam | ab209845 | |
| 抗磷酸化RIPK3抗体 | CST | 91702 | |
| 抗RIPK3抗体 | ProSci | 2283 | |
| 抗IRF1抗体 | CST | 8478 | |
| 抗磷酸化STAT1抗体 | CST | 7649 | |
| 抗总STAT1抗体 | CST | -- | |
| HRP标记二抗 | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 111-035-047, | |
| Luminata Forte Western HRP底物 | Millipore | WBLUF0500 | |
| PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 | |
| 免疫荧光染色 | 抗ASC抗体 | Millipore | 04-147 |
| 抗痘苗病毒抗体(检测MPXV) | Santa Cruz | sc-58210 | |
| Alexa Fluor 488标记抗小鼠二抗 | Life Technologies | A21202 | |
| Alexa Fluor 568标记抗兔二抗 | Life Technologies | A10042 | |
| 抗痘苗病毒抗体(MPXV) | Abcam | ab35219 | |
| 抗磷酸化MLKL抗体 | Abcam | ab196436 | |
| DAPI封片剂 | Invitrogen | P36931 | |
| 激光共聚焦显微镜LSM900 | Carl Zeiss | -- | |
| 免疫沉淀 | IgG对照抗体 | CST | 3900 |
| 抗ASC抗体 | AdipoGen | AG-25B-006-C100 | |
| 蛋白A/G PLUS-琼脂糖 | Santa Cruz Biotechnology | sc-2003 | |
| 定量PCR | DNeasy血液和组织试剂盒 | Qiagen | 69504 |
| iTaq通用SYBR Green预混液 | Bio-Rad | 1725120 | |
| CFX Duet实时PCR系统 | Bio-Rad | -- | |
| 体内实验 | AIM2抑制剂(ODN TTAGGG钠盐) | MCE | HY-150751C |
| 组织学分析 | MPXV抗体(ab35219) | Abcam | ab35219 |
| DMi8倒置显微镜 | Leica | -- | |
| 细胞死亡成像和分析 | IncuCyte S3成像系统 | Sartorius | 4647 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞感染 | MPXV感染复数(MOI)和感染时间,是否采用MOI 0.1感染24小时 阅读提示:方法部分:Cell stimulation and infection |
| 基因敲除细胞系 | iBMDMs中目标基因敲除的验证方式,以及使用的CRISPR-Cas9或siRNA方法 阅读提示:方法部分:Generation of knockout clonal cells和Gene silencing mediated by siRNA |
| 体内感染模型 | 小鼠品系、性别、年龄、MPXV株(西非株或中非株)及剂量,感染途径(鼻内) 阅读提示:方法部分:In vivo infection |
| AIM2抑制剂治疗 | AIM2抑制剂ODN TTAGGG sodium的给药剂量(0.3mg/剂)、给药方式(腹腔注射)及时间点(感染后6小时及第1、2、3天) 阅读提示:方法部分:In vivo infection |
| 细胞死亡检测 | 细胞死亡成像系统(IncuCyte S3)、SYTOX Green浓度及处理时间 阅读提示:方法部分:Cell death imaging and analysis |