患者皮肤样本分析
观察SLE患者与健康对照及炎症性皮肤病中PPARγ在角质形成细胞中的表达差异。
对SLE患者、健康对照、特应性皮炎和银屑病患者的皮肤样本进行免疫组化染色,检测PPARγ蛋白表达。
Dysregulation in keratinocytes drives systemic lupus erythematosus onset
研究包含患者皮肤样本、转录组数据分析、角质形成细胞条件性敲除小鼠模型、细胞功能实验、机制验证(Co-IP、ChIP、分子对接)及体内抗体阻断等独立证据层级,并进行功能与机制验证。
HaCaT细胞系 原代人角质形成细胞 Pparg条件性敲除小鼠(Ppargfl/fl;Krt5creERT2/+) SLE患者皮肤样本
小鼠模型:Ppargfl/fl;Krt5creERT2/+,局部涂抹4-羟基他莫昔芬诱导角质形成细胞Pparg敲除 4-OHT浓度及给药方案:5 mg/ml,5天连续涂抹 UVB照射剂量:50 mJ/cm2(细胞实验),430 mJ/cm2(小鼠实验) IFNAR中和抗体给药:40 μl 2 mg/ml 皮内注射,第3、7天 DC耗竭:白喉毒素(5 ng/g体重)皮内注射,每隔一天
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
观察SLE患者与健康对照及炎症性皮肤病中PPARγ在角质形成细胞中的表达差异。
对SLE患者、健康对照、特应性皮炎和银屑病患者的皮肤样本进行免疫组化染色,检测PPARγ蛋白表达。
在体内验证角质形成细胞特异性PPARγ减少是否足以驱动SLE样表型。
构建Ppargfl/fl;Krt5creERT2/+小鼠,局部涂抹4-OHT诱导角质形成细胞Pparg敲除,观察皮肤病变、蛋白尿、自身抗体、免疫细胞变化等。
确认PPARγ减少对角质形成细胞增殖和I型干扰素反应的影响。
使用CRISPR或shRNA敲低PPARγ,过表达PPARγ,检测细胞增殖速率、I型干扰素(IFNB1)及干扰素刺激基因表达、培养基中IFN-β蛋白水平。
阐明PPARγ减少如何增强I型干扰素反应。
通过ChIP检测IRF3与IFNB1启动子结合,免疫共沉淀检测PPARγ-IRF3相互作用,分子对接预测结合位点,构建突变体验证关键氨基酸残基。
验证IRF3和I型干扰素在角质形成细胞PPARγ减少诱导的SLE样表型中的作用。
构建Pparg/Irf3双敲低小鼠;给予IFNAR中和抗体;评估疾病表型变化。
验证角质形成细胞分泌的I型干扰素对树突状细胞活化及T细胞分化的影响。
将角质形成细胞与未成熟DC共培养,检测DC活化标志物;分离皮肤浸润DC与初始CD4+T细胞共培养,评估T细胞分化;利用Itgax-DTR小鼠耗竭DC,观察对SLE表型的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | #C11995500CP |
| 胎牛血清 | Invitrogen | #10099141C | |
| 青霉素/链霉素/谷氨酰胺 | Life Sciences | #10378016 | |
| RPMI 1640培养基 | Thermo Fisher | #11875093 | |
| 粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子 | R&D Systems | #215-GM-050 | |
| 白细胞介素-4 | R&D Systems | #204-IL-010 | |
| CD14磁珠 | Miltenyi Biotec | #130-050-201 | |
| HaCaT细胞系 | China Center for Type Culture Collection | -- | |
| 原代人角质形成细胞 | Lifeline Cell Technology | FC-0007 | |
| DermalLife基础培养基 | Lifeline Cell Technology | LM-0004 | |
| DermalLife K因子试剂盒 | Lifeline Cell Technology | LS-1030 | |
| 细胞处理 | 4-羟基他莫昔芬 | Sigma-Aldrich | H6278 |
| 他莫昔芬 | Sigma-Aldrich | T5648 | |
| 二甲基亚砜 | Sigma-Aldrich | D8418 | |
| 玉米油 | Beyotime | ST1177 | |
| UVB照射 | Tyler Industries | -- | |
| 基因敲除/敲低 | LentiCRISPRv2-GFP载体 | Addgene | 82416 |
| 基因敲低 | pGLVH1/GFP+Puro质粒 | GenePharma | C06003 |
| 过表达 | PPARγ人源标签ORF克隆 | Origene | RC212181L2 |
| 免疫印迹 | PPARγ抗体 | Cell Signaling Technology | 2443S |
| IRF3抗体 | Cell Signaling Technology | 11904S | |
| GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 5174S | |
| IgG抗体 | Cell Signaling Technology | 2729S | |
| 免疫共沉淀 | 免疫共沉淀试剂盒 | Thermo Fisher | 26149 |
| 染色质免疫沉淀 | 酶法染色质免疫沉淀试剂盒 | Cell Signaling Technology | 9003S |
| ELISA | 抗双链DNA ELISA试剂盒 | CUSABIO | CSB-E11194m |
| 抗核抗体ELISA试剂盒 | CUSABIO | CSB-E12912m | |
| 尿液分析 | 尿蛋白检测试剂盒 | Jiancheng Bioengineering Institute | C035 |
| 尿试纸 | URIT | -- | |
| 组织处理 | 分散酶II | Sigma | D4693 |
| 胶原酶IV | Sigma | V900893 | |
| 脱氧核糖核酸酶I | Sigma | DN25 | |
| 分散酶 | Sigma | 04942078001 | |
| 细胞增殖 | 细胞增殖检测试剂盒(MTT) | Beyotime | C0009S |
| 电子显微镜 | 透射电子显微镜 | Hitachi | HT7800 |
| 流式细胞术 | LSR2流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| FACS Canto II流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| NL-3000流式细胞仪 | CYTEK Biosciences | -- | |
| 抗体 | CD11c-APC抗体 | BioLegend | clone Bu15 |
| CD83-PE抗体 | BioLegend | clone HB15e | |
| CD86-FITC抗体 | BioLegend | clone BU63 | |
| CD64抗体 | BioLegend | clone S18017D | |
| Ly6C抗体 | BioLegend | clone HK1.4 | |
| CD207抗体 | BioLegend | clone 4C7 | |
| Ly6G抗体 | BioLegend | clone 1A8 | |
| CD3抗体 | BioLegend | clone 17A2 | |
| NK1.1抗体 | BioLegend | clone S17016D | |
| CD19抗体 | BioLegend | clone 1D3 | |
| 免疫磁珠 | CD11c磁珠 | Miltenyi Biotec | #130-125-835 |
| T细胞共培养 | 抗CD3抗体 | Invitrogen | 16-0031-86 |
| 抗CD28抗体 | Invitrogen | 16-0281-85 | |
| 体内中和抗体 | IFNAR中和抗体(克隆MAR1-5A3) | MCE | HY-P99137 |
| 抗小鼠IgG1同型对照(克隆MOPC-21) | MCE | HY-P99977 | |
| 体内DC迁移 | FITC溶液 | -- | -- |
| 组织固定 | 中性缓冲福尔马林 | -- | -- |
| 免疫组化二抗 | HRP标记的亲和纯化山羊抗兔IgG | Proteintech | SA00001-2 |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 488标记的山羊抗小鼠IgG | Abmart | M21011 |
| DAPI染料 | Thermo Fisher | 62248 | |
| MX1多克隆抗体 | Proteintech | 13750-1-AP | |
| 免疫荧光二抗 | Alexa Fluor 488标记的山羊抗兔IgG | Invitrogen | A-11008 |
| 封片 | 抗淬灭封片剂 | Beyotime | P0126 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型诱导 | 小鼠品系(Ppargfl/fl;Krt5creERT2/+、Ppargfl/+;IRF3fl/+;Krt5creERT2/+等),4-OHT浓度(5 mg/ml),给药方式(局部涂抹双耳),给药时长(5天),小鼠年龄(5-8周) 阅读提示:Materials and methods: Mice, Murine models and drug treatment |
| 细胞实验:UVB照射 | UVB剂量(50 mJ/cm2),照射后培养时间(12小时),细胞融合度(80%) 阅读提示:Materials and methods: UVB irradiation |
| DC共培养 | 角质形成细胞接种密度(150,000/孔),DC接种密度(1,000,000/孔),共培养时间,UVB处理,检测标志物(CD83、CD86) 阅读提示:Materials and methods: Keratinocyte and dendritic cell coculture |
| T细胞分化共培养 | DC与T细胞比例(1:2?),抗CD3(5 μg/ml),抗CD28(2 μg/ml),共培养时间(5天),MHC II中和抗体浓度(10 μg/ml) 阅读提示:Materials and methods: Dendritic cell and CD4+ naive T-cell coculture |
| 体内抗体阻断 | IFNAR中和抗体剂量(40 μl 2 mg/ml),给药途径(皮内注射),给药时间(第3和第7天),同型对照 阅读提示:Materials and methods: In vivo IFNAR blockade |