胸腺退化表型观察
比较CD147T-KO与野生型小鼠在不同年龄的胸腺大小、重量、细胞数和结构差异
在6、12、36周龄小鼠中检测胸腺大小、重量、总胸腺细胞数,并进行HE染色、TUNEL凋亡检测、naive T细胞分析、油红O染色和UCP-1免疫组化。
CD147 deficiency in T cells prevents thymic involution by inhibiting the EMT process in TECs in the presence of TGFβ
包含基因敲除小鼠模型、体外共培养、Co-IP/质谱、Western blot、免疫荧光等,并进行了功能验证和机制验证
CD147T-KO小鼠 野生型小鼠 TECs与CD4+ T细胞共培养体系 TECs
小鼠基因型:CD147T-KO与野生型 小鼠周龄:6、12、36周 体外共培养中TGFβ处理浓度 CD147+CD4+ T细胞与TECs共培养时间 信号通路抑制剂处理(TGFβ抑制剂、Src抑制剂)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较CD147T-KO与野生型小鼠在不同年龄的胸腺大小、重量、细胞数和结构差异
在6、12、36周龄小鼠中检测胸腺大小、重量、总胸腺细胞数,并进行HE染色、TUNEL凋亡检测、naive T细胞分析、油红O染色和UCP-1免疫组化。
评估CD147缺失对TEC增殖、分化及EMT标志物表达的影响
通过流式检测Epcam和MHCII表达,BrdU掺入实验检测增殖,real-time PCR检测Foxn1、IL-7、KGF、FoxC2和Fsp-1表达,Western blot和免疫荧光检测PPARγ和E-cadherin。
验证活化CD4+ T细胞上CD147是否诱导TECs发生EMT
从CD45.1+小鼠分选初始CD4+ T细胞,用anti-CD3/CD28刺激活化后注射到12周龄野生型和CD147T-KO小鼠,2个月后检测胸腺中CD45.1+细胞比例、胸腺重量、T细胞亚群和TEC E-cadherin表达。
确定TGFβ和CD147在TEC EMT中的作用
从6周龄C57BL/6小鼠胸腺分选Epcam+ TECs,与CD147+CD4+或CD147-CD4+ T细胞共培养,加入或不加入TGFβ,检测E-cadherin表达、p-Smad2和FoxC2水平,并使用TGFβ抑制剂处理。
验证CD147与Annexin A2的相互作用及其对EMT的影响
进行Co-IP和质谱鉴定相互作用蛋白,免疫荧光观察Annexin A2和E-cadherin分布,加入Annexin A2抗体或Src抑制剂验证其对E-cadherin表达的影响,检测p-Src和p-E-cadherin。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞裂解 | 蛋白酶抑制剂 | Roche | -- |
| 磷酸酶抑制剂 | Roche | -- | |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 免疫共沉淀 | Pierce免疫共沉淀试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 26149 |
| Pierce蛋白A/G琼脂糖 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Western blot | ECL化学发光试剂 | Amersham Bioscience | -- |
| 流式细胞术 | FACSCalibur流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 细胞分选 | FACS Aria细胞分选仪 | BD Biosciences | -- |
| 实时定量PCR | ABI PRISM 7000序列检测系统 | Applied Biosystems | -- |
| 质谱分析 | LTQ质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RNA提取 | 总RNA提取试剂盒II | Omega Bio-tek | -- |
| 逆转录 | RNA逆转录试剂盒 | TaKaRa | -- |
| 实时定量PCR | SYBR Premix Ex Taq II试剂盒 | TaKaRa | -- |
| 细胞培养 | 红细胞裂解液 | TIANGEN | -- |
| 凋亡检测 | FragEL DNA片段化检测试剂盒 | Merck Millipore | QIA39 |
| 流式细胞术 | 抗CD3e抗体 | BD | 553067 |
| 抗CD4抗体 | BioLegend | 100405 | |
| 抗CD8a抗体 | BD | 553033 | |
| 抗CD62L抗体 | BD | 553151 | |
| 抗CD44抗体 | BD | 560569 | |
| 抗CD147抗体 | BD | 562676 | |
| 抗CD45.1抗体 | BioLegend | 110728 | |
| 免疫荧光 | 抗P63抗体 | Abcam | ab110038 |
| 流式细胞术/免疫荧光 | 抗Epcam抗体 | Abcam | ab71916 |
| 增殖检测 | 抗BrdU抗体 | Abcam | ab6326 |
| 免疫组化 | 抗UCP-1抗体 | Santa Cruz | sc-518024 |
| 免疫组化/免疫荧光 | 抗PPARγ抗体 | Proteintech | 16643-1-AP |
| 免疫荧光/Western blot | 抗E-钙粘蛋白抗体 | HuaBio | EM0502 |
| 免疫荧光 | 抗膜联蛋白A2抗体 | Proteintech | 11256-1-AP |
| Western blot | 抗Smad2抗体 | Cell Signaling Technology | 5339s |
| 抗p-Smad2抗体 | HuaBio | ET1612-32 | |
| 抗p-Src抗体 | Biorbyt | orb99267 | |
| E-cadherin磷酸化检测 | 抗E-钙粘蛋白抗体(用于免疫沉淀) | Proteintech | 20874-1-AP |
| 泛抗磷酸酪氨酸抗体 | Abcam | ab10321 | |
| 免疫共沉淀 | CD147抗体 | Proteintech | 11989-1-AP |
| IgG抗体 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | CD147T-KO小鼠基因型、遗传背景 阅读提示:Materials and methods, Animals |
| 胸腺退化观察 | 小鼠周龄(6,12,36周)、胸腺测量时间点 阅读提示:Results, 图1图例 |
| 体外共培养 | TGFβ浓度、共培养时间、T细胞与TEC比例 阅读提示:Materials and methods, TECs cocultured with T cells in vitro |
| 信号通路抑制 | TGFβ抑制剂和Src抑制剂的种类、浓度、处理时间 阅读提示:Results, 图4和图5图例 |
| Co-IP/质谱 | CD147抗体克隆号、细胞裂解条件、质谱参数 阅读提示:Materials and methods, Co-IP and mass spectrometry |