临床样本和动物模型中的铜死亡相关分析
评估人类CAP组织和动物模型中铜死亡标志物的表达及其与骨丢失的相关性。
收集人类CAP组织和健康口腔黏膜组织,进行免疫荧光和相关性分析;建立小鼠根尖周炎和颅骨骨溶解模型,检测SLC31A1、DLAT表达和骨丢失。
Cuproptosis promotes inflammatory osteolysis via GYS1-mediated glycogen metabolism
包含人样本分析、小鼠模型、细胞实验(代谢组学、13C示踪、western blot、ChIP-qPCR等)、功能验证和机制验证
人慢性根尖周炎组织 小鼠根尖周炎模型 小鼠颅骨骨溶解模型 骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)
ES-Cu浓度(150 nmol/L, 1:1)处理BMDMs MZ-101(GYS1抑制剂)浓度1 μmol/L预处理30分钟 TTM(铜螯合剂)浓度4 mmol/kg用于体内 siRNA敲低GYS1 GYS1过表达
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估人类CAP组织和动物模型中铜死亡标志物的表达及其与骨丢失的相关性。
收集人类CAP组织和健康口腔黏膜组织,进行免疫荧光和相关性分析;建立小鼠根尖周炎和颅骨骨溶解模型,检测SLC31A1、DLAT表达和骨丢失。
探究铜死亡时巨噬细胞的代谢重编程,尤其是糖原代谢的变化。
用ES-Cu处理BMDMs,进行非靶向代谢组学分析,并通过qPCR和Western blot筛选糖原代谢相关酶的表达。
验证GYS1介导的糖原合成抑制是否导致G6P流入PPP减少。
使用13C6-葡萄糖示踪实验,检测G1P、R5P、pyruvate等代谢物;使用GYS1抑制剂MZ-101或siRNA敲低GYS1,过表达GYS1,检测糖原水平、NADPH/NADP+、GSH/GSSG、ROS和细胞活力。
评估铜死亡条件下糖原代谢抑制是否影响巨噬细胞向破骨细胞分化。
收集ES-Cu处理后的巨噬细胞条件培养基,加入M-CSF和RANKL诱导破骨细胞分化,进行TRAP染色,检测破骨细胞相关基因表达。
探索铜是否通过结合H3K27me3影响GYS1转录。
检测ES-Cu处理后H3K27me3水平,进行共定位实验,通过ChIP-qPCR验证H3K27me3在GYS1启动子的结合,并用GSK-J4抑制H3K27me3去甲基化酶观察对GYS1和破骨细胞生成的影响。
验证糖原代谢紊乱是否会加剧铜死亡和炎性骨丢失。
在ES-Cu诱导的颅骨骨溶解和根尖周炎模型中,通过腹腔注射MZ-101或TTM,进行micro-CT、组织学染色(TRAP、DLAT、F4/80)和血清细胞因子检测。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | Elesclomol(ES) | MedChemExpress | HY-12040 |
| 四硫钼酸盐(TTM) | -- | -- | |
| MZ-101 | -- | -- | |
| 细胞培养 | 巨噬细胞集落刺激因子 | PeproTech | 315-02 |
| 核因子κB受体活化因子配体 | R&D Systems | 462-TEC-010 | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 破骨细胞分化 | 酸性磷酸酶白细胞试剂盒 | Sigma-Aldrich | 387A |
| 细胞死亡检测 | 碘化丙啶染色 | Beyotime | C2015M |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Biosharp | BS350C |
| 酶标仪 | Biotek | Synergy H1 | |
| 代谢物检测 | 13C6标记的葡萄糖 | Sigma | 310808 |
| 超高效液相色谱 | Thermo | -- | |
| Orbitrap Exploris 120质谱仪 | Thermo | -- | |
| 蛋白检测 | RIPA裂解液 | MedChemExpress | HY-K0010 |
| PVDF膜 | Roche | 66898400 | |
| 抗SLC31A1抗体 | Abmart | T510261 | |
| 抗DLAT抗体 | Proteintech | 68303-1-lg | |
| 抗H3K27me3抗体 | Abcam | ab6002 | |
| 抗GYS1抗体 | Cell Signaling Technology | 3886 | |
| 抗PGM1抗体 | Abcam | ab192876 | |
| 抗UGP2抗体 | Abcam | ab154817 | |
| 抗PYGL抗体 | Proteintech | 15851-1-AP | |
| 组蛋白H3抗体 | Proteintech | 17168-1-AP | |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 488偶联二抗 | Abbkine | -- |
| Alexa Fluor cy3偶联二抗 | Abbkine | -- | |
| 免疫组化 | DAB底物 | Dako | K3468 |
| 凋亡检测 | TUNEL细胞凋亡检测试剂盒 | Beyotime | C1089 |
| 糖原检测 | 糖原测定试剂盒 | Abcam | ab65620 |
| PAS染色试剂盒 | Servicebio | G1008 | |
| RNA提取 | RNA小提试剂盒 | Axygen | AP-MN-MS-RNA-250 |
| HiScript II逆转录酶 | Vazyme | R223-01 | |
| RT-qPCR | ChamQ SYBR qPCR预混液 | Vazyme | Q311 |
| QuantStudio 6 Flex实时荧光定量PCR系统 | Life Technologies | -- | |
| ELISA | IL-6和TNF-α ELISA试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 代谢物检测 | NADP/NADPH定量比色试剂盒 | Abcam | ab65349 |
| ROS检测 | ROS检测试剂盒 | Beyotime | S0033S |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | L3000-015 |
| siRNA转染 | 小干扰RNA | Genepharma | -- |
| ChIP | 染色质免疫沉淀试剂盒 | Active Motif | 53009 |
| 兔IgG | Abcam | ab172730 | |
| 组织处理 | Leica Peloris自动组织处理机 | Leica | -- |
| 组织成像 | Aperio ScanScope CS扫描仪 | Leica | -- |
| 显微镜 | 共聚焦显微镜 | Olympus | -- |
| 荧光显微镜 | Olympus | -- | |
| 光学显微镜 | Leica | -- | |
| 流式分析 | 流式细胞仪 | Beckman | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 铜死亡诱导 | ES-Cu浓度和比例(150 nmol/L, 1:1),处理时间 阅读提示:图2、图4及相应方法部分 |
| 糖原代谢抑制 | MZ-101浓度(1 μmol/L),预处理时间(30分钟) 阅读提示:图4和图5及相应方法部分 |
| 破骨细胞分化 | M-CSF和RANKL浓度,培养时间,条件培养基的收集方法 阅读提示:图5及细胞培养和破骨细胞分化方法 |
| 表观遗传分析 | ChIP实验条件,H3K27me3抗体,GSK-J4浓度 阅读提示:图6及ChIP-qPCR方法 |
| 体内动物模型 | ES-Cu剂量和给药方式,TTM和MZ-101剂量和给药频率 阅读提示:图7及动物模型建立方法 |