体外细胞系药物敏感性及协同效应评估
评估氮芥、罗米地辛单药及联合对CTCL细胞系活力的影响,并确定联合是否具有协同作用。
使用CTCL细胞系(SeAx、HH、HuT78)进行剂量反应实验,用MTT法检测活力,并通过Chou-Talalay方法计算联合指数(CI)。
Jak-STAT Inhibition Mediates Romidepsin and Mechlorethamine Synergism in Cutaneous T-Cell Lymphoma
包含体外细胞系和原代样本实验、体内异种移植模型、RNA-seq转录组分析及功能验证(凋亡、信号通路检测),多个证据层级相互支持。
CTCL细胞系(SeAx、HH、HuT78、MyLa、HuT102) 原发性SS患者CD4+ T细胞 免疫缺陷小鼠(NRG)HuT78异种移植模型
细胞系:SeAx、HH、HuT78、MyLa、HuT102;原代样本:SS患者CD4+ T细胞 药物:罗米地辛、氮芥、莫洛替尼、鲁索替尼,浓度范围需核实 处理时间:体外24-96小时,体内7-20天 动物模型:NRG小鼠皮下注射2×10^6荧光素酶标记HuT78细胞,每组10只(协同实验)或3只(机制实验) 关键通路:STAT5磷酸化,需检测IL-2刺激后的变化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估氮芥、罗米地辛单药及联合对CTCL细胞系活力的影响,并确定联合是否具有协同作用。
使用CTCL细胞系(SeAx、HH、HuT78)进行剂量反应实验,用MTT法检测活力,并通过Chou-Talalay方法计算联合指数(CI)。
在非永生化原发性CTCL细胞中验证联合治疗的抗肿瘤效应。
从SS患者PBMC中分离CD4+ T细胞,在含IL-2的培养基中培养,用药物处理,通过硫代唑橙和碘化丙啶染色流式细胞术检测细胞活力。
在SS小鼠模型中评估氮芥、罗米地辛单药及联合的抗肿瘤效果。
将荧光素酶标记的HuT78细胞皮下注射到NRG小鼠,监测肿瘤生长后分组治疗,通过生物发光成像测量肿瘤负荷。
探究联合治疗诱导的基因表达变化及涉及的信号通路。
对CTCL细胞系和原代样本进行RNA-seq,差异表达分析、KEGG通路和GO分析、GSEA分析。
验证联合治疗对JAK/STAT信号通路蛋白磷酸化及蛋白表达的影响。
通过流式细胞术检测细胞系、原代样本和体内肿瘤细胞中STAT5磷酸化水平;通过Western blot检测JAK1蛋白水平。
测试JAK抑制剂与罗米地辛联合是否能增强抗肿瘤效果并逆转罗米地辛耐药。
在CTCL细胞系和罗米地辛耐药的原代样本中,评估莫洛替尼、鲁索替尼等JAK抑制剂单独及与罗米地辛联合的凋亡诱导和STAT5磷酸化抑制;并在体内模型中评估联合效果。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Hyclone | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 人血清 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 白细胞介素-2 | PeproTech | -- | |
| 白细胞介素-7 | PeproTech | -- | |
| 抗CD3抗体(克隆HIT3a) | Thermo Fisher | -- | |
| 抗CD28抗体(克隆CD28.2) | Thermo Fisher | -- | |
| 药物处理 | 罗米地辛 | Sigma-Aldrich | SML1175 |
| 巴瑞替尼 | SelleckChem | S2851 | |
| 莫洛替尼 | SelleckChem | S2219 | |
| 鲁索替尼 | SelleckChem | S1378 | |
| 托法替尼 | SelleckChem | S5001 | |
| FM-381 | SelleckChem | S8541 | |
| PF-06651600 | SelleckChem | S8538 | |
| 流式细胞术 | FACS Canto II流式细胞仪 | BD | -- |
| 抗pSTAT5抗体(Cat #9314) | Cell Signaling Technology | 9314 | |
| 抗兔Alexa-647二抗(Cat #4414) | Cell Signaling Technology | 4414 | |
| 细胞活力检测 | 细胞增殖检测试剂盒I(MTT) | Roche | -- |
| 凋亡检测 | eBioscience Annexin V凋亡检测试剂盒(APC) | Thermo Fisher | -- |
| 细胞活力检测 | BD细胞活力检测试剂盒 | BD Biosciences | -- |
| RNA提取 | TriZol试剂 | Sigma-Aldrich | -- |
| RNeasy小型试剂盒 | QIAGEN | -- | |
| RNA质控 | 安捷伦生物分析仪2100 | Agilent | -- |
| RNA-seq | TruSeq链特异性RNA文库制备试剂盒(含RiboZero gold) | Illumina | -- |
| HiSeq2500测序仪 | Illumina | -- | |
| Western blot | JAK1抗体(Cat #3332) | Cell Signaling Technology | 3332 |
| JAK2抗体(Cat #sc390539) | Santa Cruz Biotechnology | sc390539 | |
| GAPDH抗体(D16H11)(Cat #5174) | Cell Signaling Technology | 5174 | |
| SuperSignal West Pico化学发光底物(Cat #34080) | Thermo Fisher Scientific | 34080 | |
| SuperSignal West Femto最大灵敏度底物(Cat #34094) | Thermo Fisher Scientific | 34094 | |
| 慢病毒转染 | JetPEI转染试剂 | Polyplus Transfection | -- |
| 动物实验 | NOD.Cg-Rag1tm1Mom Il2rgtm1Wjl/SzJ小鼠(品系号:007799) | Jackson Laboratory | 007799 |
| 动物实验成像 | 小动物活体成像系统(IVIS) | Xenogen | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞系和原代样本处理 | 细胞系种类、培养基成分、细胞密度(3-4×10^5 cells/mL)、原代样本培养条件(含IL-2/IL-7、anti-CD3/CD28刺激)、药物浓度和溶剂(DMSO)。 阅读提示:MATERIALS AND METHODS: Cell Lines, Primary CTCL samples, Cell culture, Drugs |
| 体外药物协同实验 | 固定摩尔比、处理时间(24-96小时)、细胞活力检测方法(MTT)、联合指数计算(CompuSyn软件)。 阅读提示:RESULTS: Mechlorethamine and romidepsin induce synergistic antitumor effect; MATERIALS AND METHODS: Cell proliferation and drug response analyses |
| 体内异种移植实验 | 动物品系(NRG小鼠)、细胞数(2×10^6)、注射方式(皮下)、分组(vehicle、罗米地辛、氮芥、联合,n=10或3)、治疗时长(20天或7天)、监测方法(生物发光)。 阅读提示:RESULTS: 第一段;MATERIALS AND METHODS: Mouse husbandry and procedures |
| RNA-seq和转录组分析 | 处理时间(24小时)、样本类型(细胞系和原代样本)、测序平台(HiSeq2500, 100bp PE)、测序深度(30M reads)、比对参考基因组(GRCh38)、差异表达阈值(padj<0.01, log2FC>1.2)。 阅读提示:RESULTS: 第二段;MATERIALS AND METHODS: RNAseq and gene expression profiling |
| 信号通路验证 | STAT5磷酸化检测:处理时间(48小时)、IL-2刺激条件(10 μg/mL)、流式抗体(pSTAT5 #9314);JAK1蛋白检测:Western blot抗体稀释度、内参(GAPDH)。 阅读提示:RESULTS: 第三段;MATERIALS AND METHODS: Flow cytometry analyses; Protein isolation and western blot |
| JAK抑制剂联合实验 | JAK抑制剂种类(momelotinib, ruxolitinib等)及浓度、处理时间(48小时)、耐药样本(P-01, P-07)、凋亡检测方法(Annexin V/7-AAD)、STAT5磷酸化检测。 阅读提示:RESULTS: Reversal of romidepsin resistance by JAK inhibitors; METHODS: Drugs |