sEV分离与表征
从PVA海绵植入模型中提取和纯化sEV,并验证Rab27A缺失对sEV释放的影响。
使用PVA海绵植入小鼠皮下,收集伤口液,通过低速和高速离心、SEC纯化sEV,并进行单囊泡流式细胞术(vFC)计数和粒径分析,免疫印迹检测Rab27A及标志物。
Regulated Release of Small Extracellular Vesicles Directs Neutrophil Recruitment in Cutaneous Wound Healing
体外细胞迁移实验、体内伤口模型及患者样本的多层级验证,包括基因敲除、蛋白质组学和功能回复实验。
PVA海绵植入小鼠模型 db/db糖尿病小鼠 Rab27A敲除小鼠 骨髓来源细胞
Rab27A敲除导致sEV释放减少,数量从WT的5×10^6 EVs/μl降至2×10^6 EVs/μl 单次给予8×10^5个sEVs于4mm伤口,观察14天伤口闭合 中性粒细胞迁移实验使用8×10^8 EVs于Transwell下室,骨髓细胞于上室孵育3小时 Rab27A-KO sEV处理的伤口CCL4表达上调 sEV处理影响CD206表达,但不影响TNFα、CD80、IL-10
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从PVA海绵植入模型中提取和纯化sEV,并验证Rab27A缺失对sEV释放的影响。
使用PVA海绵植入小鼠皮下,收集伤口液,通过低速和高速离心、SEC纯化sEV,并进行单囊泡流式细胞术(vFC)计数和粒径分析,免疫印迹检测Rab27A及标志物。
评估WT和Rab27A-KO sEV对db/db小鼠伤口愈合的影响。
在db/db小鼠背部制造4mm全层伤口,单次局部给予等量的WT或KO sEV(8×10^5个),通过伤口图像分析14天愈合动力学,并进行组织学和免疫组化分析Ki-67和CD31。
鉴定Rab27A依赖的sEV蛋白载荷,重点关注中性粒细胞相关蛋白。
使用免疫亲和磁珠(CD9/CD63/CD81)纯化sEV,进行液相色谱-质谱分析,比较WT和Rab27A-KO sEV的蛋白质组。
验证Rab27A-KO sEV对中性粒细胞迁移的影响。
使用Transwell系统,下室加入WT或KO sEV,上室加入骨髓来源细胞,孵育3小时后收集下室细胞,通过流式细胞术计数CD45+Ly6G+CD11b+中性粒细胞。
评估Rab27A缺失对伤口部位中性粒细胞募集的影响。
使用流式细胞术检测PVA海绵、外周血和骨髓中的中性粒细胞(CD45+Ly6G+CD11b+),并在sEV处理的伤口中进行免疫荧光染色检测Ly6G+细胞和CCL4表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 聚乙烯醇海绵 | PVA Unlimited | SQ5000 |
| db/db小鼠 | The Jackson Laboratory | 000697 | |
| Rab27A敲除小鼠 | The Jackson Laboratory | 000120 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | 12430054 |
| 胎牛血清 | Sigma-Aldrich | F0926 | |
| 抗生素-抗真菌剂 | Gibco | 15240062 | |
| sEV分离 | qEV1尺寸排阻柱 | IZON | IC1-70 |
| sEV表征 | vFRed检测试剂盒 | Cellarcus Biosciences | CBS4HP-1PE |
| vCal纳米彩虹校准微球 | Cellarcus Biosciences | CBS6 | |
| 免疫印迹 | RIPA裂解缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | 89901 |
| Halt蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Thermo Fisher Scientific | 78442 | |
| 十二烷基硫酸锂样品缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | NP0008 | |
| 二硫苏糖醇 | Thermo Fisher Scientific | 15508013 | |
| Bis-Tris迷你凝胶 | Thermo Fisher Scientific | NP0342BOX | |
| PVDF膜 | Thermo Fisher Scientific | LC2005 | |
| MemCode可逆蛋白染色试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 24585 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23225 | |
| 脱脂奶粉 | Cell Signaling Technology | 9999 | |
| 吐温20 | Cell Signaling Technology | 9997 | |
| 抗Rab27A抗体 | Abcam | ab55667 | |
| 抗Alix抗体 | Cell Signaling Technology | 92880 | |
| 抗CD63抗体 | Invitrogen | PA5-92370 | |
| 抗CD81抗体 | Cell Signaling Technology | 10037 | |
| 抗CD9抗体 | Invitrogen | PA-5-85955 | |
| 抗载脂蛋白E抗体 | Cell Signaling Technology | 49285S | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 3700 | |
| 抗兔IgG HRP偶联抗体 | Cell Signaling Technology | 7074 | |
| 抗小鼠IgG HRP偶联抗体 | Cell Signaling Technology | 776 | |
| SignalFire Elite ECL试剂 | Cell Signaling Technology | 12757 | |
| 伤口愈合实验 | 硅胶环 | Grace Bio-labs | GBLRD476687 |
| 尼龙缝线 | Thermo Fisher Scientific | 50-118-0628 | |
| 3M Tegaderm敷料 | McKesson | 264435 | |
| 组织学 | 抗Ki-67抗体 | Genetex | 16667 |
| 免疫荧光 | Tissue-Tek O.C.T.包埋剂 | Sakura | 4583 |
| Ly-6G PE偶联抗体 | Miltenyi Biotec | 130-123-780 | |
| CD31抗体 | Cell Signaling Technology | 77699 | |
| 抗兔IgG Alexa Fluor 488偶联抗体 | Thermo Fisher Scientific | A11008 | |
| DAPI | -- | -- | |
| 质谱分析 | 通用(pan)EV分离试剂盒(小鼠) | Miltenyi Biotec | 130-117-039 |
| C18-StageTips | Thermo Fisher Scientific | 87782 | |
| Pierce高pH反相肽段分级试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 84868 | |
| Thermo Dionex UltiMate 3000 RSLC纳升系统 | Thermo Fisher Scientific | ULTIM3000RSLCNANO | |
| Orbitrap Fusion Lumos混合质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | IQLAAEGAAPFADBMBHQ | |
| 迁移实验 | Transwell插入物(6.5mm,3.0μm孔径) | Corning | 3415 |
| EDTA | Corning | 46-034-CI | |
| 流式细胞术 | MACSQuant运行缓冲液 | Miltenyi Biotec | 130-092-747 |
| 红细胞裂解缓冲液 | BioLegend | 420301 | |
| 牛血清白蛋白 | Miltenyi Biotec | 130-091-376 | |
| 抗Ly6G-VioBlue抗体 | Miltenyi Biotec | 130-119-986 | |
| 抗CD45-VioGreen抗体 | Miltenyi Biotec | 130-110-803 | |
| 抗CD11b-APC-Vio770抗体 | Miltenyi Biotec | 130-113-803 | |
| RT-qPCR | Quick-RNA试剂盒 | Zymo Research | R1055 |
| ProScript II第一链cDNA合成试剂盒 | New England Biolabs | E6560 | |
| iTaq Universal SYBR green预混液 | Bio-Rad Laboratories | 1725122 | |
| QuantiTect引物检测 | Qiagen | 249900 | |
| TNFα引物 | Qiagen | QT00104006 | |
| CD80引物 | Qiagen | QT00129787 | |
| IL-10引物 | Qiagen | QT00106169 | |
| CD206引物 | Qiagen | QT00103012 | |
| GAPDH引物 | Qiagen | QT01658692 | |
| 细胞因子检测 | 小鼠细胞因子抗体芯片A | R&D System | ARY006 |
| 巨噬细胞极化 | 巨噬细胞集落刺激因子 | Invitrogen | 14-8983-80 |
| 台盼蓝 | Thermo Fisher Scientific | T10282 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| sEV分离与表征 | PVA海绵植入时间(7天),SEC纯化条件,vFC计数方法,Rab27A-KO与WT sEV浓度(2×10^6/μl vs 5×10^6/μl),sEV粒径分布(无显著差异,P=0.5741) 阅读提示:Materials and Methods: Animals, sEV isolation and single vFC analysis; Figure 1 |
| 伤口愈合实验(sEV治疗) | db/db小鼠品系(B6.BKS(D)-Leprdb/db/J),伤口大小(4mm),sEV剂量(8×10^5个/50μl),硅胶环固定,观察时间(14天) 阅读提示:Materials and Methods: Wound healing assay; Figure 2 |
| 体外中性粒细胞迁移 | Transwell膜孔径(3.0μm),纤维蛋白原包被浓度(0.5μg),骨髓细胞数量(4×10^5),sEV数量(8×10^8),孵育时间(3小时) 阅读提示:Materials and Methods: In vitro migration assay; Figure 4a, b |
| 体内中性粒细胞募集 | 流式细胞术检测CD45+Ly6G+CD11b+细胞,PVA海绵植入后第1、7天检测,外周血和骨髓中性粒细胞计数,免疫荧光检测Ly6G+细胞(第1、3、7天)及CCL4表达 阅读提示:Materials and Methods: Flow cytometry, Immunofluorescence; Figure 4c-e, Figure 5 |
| 蛋白质组学分析 | 免疫亲和磁珠纯化(CD9/CD63/CD81),每组3个生物学重复,质谱参数(Orbitrap Fusion Lumos),数据解析使用Peaks Studio 阅读提示:Materials and Methods: Liquid chromatography-mass spectrometry; Figure 3 |