临床关联分析
评估HS患者中血小板计数与器官损伤及预后的关系
分析189例HS患者和183例健康对照的临床数据,包括血小板计数、多器官损伤标志物、生存期,并进行PCA和相关性分析。
Palmitoylation of Tfr1 enhances platelet ferroptosis and liver injury in heat stroke
包含临床队列相关性分析、小鼠HS模型、Tfr1条件敲除与回补、体外血小板热应激模型、ABE棕榈酰化检测及功能验证。
小鼠中暑模型 CKO-Tfr1血小板特异性敲除小鼠 体外游离血小板热应激模型 MEG-01来源的血小板样颗粒(PLP)模型
小鼠HS模型建立条件:39.5°C、65%相对湿度,直肠温度监测 Tfr1血小板特异性敲除小鼠(PF4-Cre;Tfr1fl/fl) Tfr1过表达:AAV9-DIO-Tfr1(5×10¹¹ vg) 铁死亡抑制剂处理:fer-1(10 mg/kg,i.p.)、DFO(20 mg/kg,i.p.,bid,7天) 体外热应激条件:43°C,2小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估HS患者中血小板计数与器官损伤及预后的关系
分析189例HS患者和183例健康对照的临床数据,包括血小板计数、多器官损伤标志物、生存期,并进行PCA和相关性分析。
建立中暑模型,观察血小板减少和肝损伤
小鼠在39.5°C、65%湿度下热应激,监测直肠温度,评估血小板计数、ALT/AST、肝组织HE染色、IL-1β水平。
验证HS中血小板是否发生铁死亡
通过RNA-seq分析基因表达变化,TEM观察线粒体形态,检测总铁、Fe2+、脂质ROS、4-HNE,并使用铁死亡抑制剂处理验证。
验证Tfr1是否是血小板铁死亡的关键调控因子
敲低或敲除Tfr1(PLP中sh-Tfr1;小鼠CKO-Tfr1),或过表达Tfr1(AAV9-DIO-Tfr1),检测铁代谢和铁死亡指标。
验证Tfr1棕榈酰化是否由ZDHHC2介导并调控Tfr1转运
ABE棕榈酰化检测、免疫电镜定位、co-IP检测ZDHHC2-Tfr1相互作用、TF-Tfr1内化循环实验,并敲低或过表达Zdhhc2。
验证血小板来源的IL-1β是否加重肝损伤
检测HS后血小板Caspase-1、IL-1β表达,体外热应激血小板分泌IL-1β,并通过Tfr1干预影响。
评估抑制血小板铁死亡能否减轻肝损伤并改善生存
使用CKO-Tfr1小鼠及Tfr1回补,结合铁死亡抑制剂,观察血小板计数、肝损伤指标和生存率。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 血小板纯度分选 | autoMACS冲洗液 | Miltenyi Biotec | -- |
| Acrodisc白细胞过滤器 | Pall Corporation | AP-4951 | |
| 抗CD45磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-052-301 | |
| 抗Ter-119磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-049-901 | |
| LD MidiMACS起始试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-090-329 | |
| RNA-seq | TRIzol | -- | -- |
| RNA Nano 6000检测试剂盒 | Agilent Technologies | -- | |
| 生物分析仪2100 | Agilent Technologies | -- | |
| Illumina NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- | |
| TEM | JEOL JEM-1400 plus透射电镜 | JEOL | -- |
| 日立H-7500透射电镜 | Hitachi | -- | |
| IEM | 日立HT-7800透射电镜 | Hitachi | -- |
| 铁含量检测 | 总铁含量比色检测试剂盒 | Applygen | E1042 |
| Fe2+检测 | FerroOrange探针 | Dojindo | F374 |
| ELISA | IL-1β ELISA试剂盒 | CUSABIO | CSB-E08054m/E08053h |
| IL-6 ELISA试剂盒 | CUSABIO | CSB-E04639m | |
| IL-10 ELISA试剂盒 | CUSABIO | CSB-E04594m-IS | |
| TNF-α ELISA试剂盒 | CUSABIO | CSB-E04741m | |
| 4-HNE ELISA试剂盒 | CUSABIO | CSB-E13412m/E16214h | |
| 流式分析 | C11-BODIPY581/591探针 | Invitrogen | D3861 |
| H2DCFDA探针 | MedChemExpress | HY-D0940 | |
| 抗Tfr1抗体 | Biolegend | 113807 | |
| 抗Tfr1抗体 | BD Biosciences | 561939 | |
| Caspase-1抗体 | ImmunoChemistry | 97/9122 | |
| 抗CD61抗体 | Biolegend | 104306 | |
| 抗CD42b抗体 | Biolegend | 303903 | |
| 抗CD62p抗体 | Biolegend | 148304 | |
| CytoFLEX S流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- | |
| qPCR | SweScript一步法qPCR反转录预混液 | Servicebio | G3337 |
| 2×通用Blue SYBR Green qPCR预混液 | Servicebio | G3326 | |
| Western blot | 抗Tfr1抗体 | Abcam | ab214039 |
| 抗ZDHHC2抗体 | Invitrogen | PA5101994 | |
| β-微管蛋白抗体 | -- | -- | |
| 聚偏二氟乙烯膜 | -- | -- | |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 稳定细胞系建立 | 聚凝胺 | -- | -- |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| PLP制备 | 丙戊酸 | MedChemExpress | HY-10585 |
| 重组人促血小板生成素 | PeproTech | 96-300-18-10 | |
| PLP激活 | 花生四烯酸 | Sigma-Aldrich | 10931 |
| 腺苷二磷酸 | MedChemExpress | HY-W010918 | |
| 细胞毒性检测 | LDH细胞毒性检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | C0017 |
| 免疫荧光 | 抗Clec4f抗体 | R&D Systems | AF2784 |
| 抗谷氨酰胺合成酶抗体 | Abcam | ab73593 | |
| 抗CD42b抗体 | Abcam | ab183345 | |
| CellTracker Green CMFDA探针 | Invitrogen | C7025 | |
| 酪胺信号放大间接检测试剂盒 | HISTOVA | DFT4C100 | |
| 免疫组化 | 抗Ki-67抗体 | Servicebio | GB111141 |
| DAB底物溶液 | Cell Signaling Technology | 8059 | |
| 免疫荧光 | 激光扫描共聚焦显微镜(Zeiss LSM880) | Leica | -- |
| ABE棕榈酰化检测 | N-乙基马来酰亚胺 | Thermo Fisher Scientific | 23030 |
| 羟胺 | Thermo Fisher Scientific | 26103 | |
| 链霉亲和素磁珠 | Millipore | LSKMAGT02 | |
| TF-Tfr1内化检测 | Alexa Fluor 488偶联转铁蛋白 | Invitrogen | T13342 |
| 药物处理 | Ferrostatin-1 | Selleckchem | S7243 |
| 甲磺酸去铁胺 | Sigma-Aldrich | D9533 | |
| Trolox | Selleckchem | S3665 | |
| 2-溴棕榈酸酯 | Sigma-Aldrich | 238422 | |
| 星形孢菌素 | MedChemExpress | HY-15141 | |
| 苄基-α-N-乙酰半乳糖胺 | MedChemExpress | HY-129389 | |
| 衣霉素 | MedChemExpress | HY-A0098 | |
| 动物模型 | 促血小板生成素 | 3SBIOINC | -- |
| 小鼠血小板清除抗体(αCD42b) | emfret Analytics | R300 | |
| AAV9-DIO-Tfr1病毒 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床队列研究 | HS患者与健康对照的样本量、纳入排除标准、检测时间点 阅读提示:Materials and methods: Clinical study design, participants and analysis; Figure 1 legend |
| 小鼠HS模型建立 | 小鼠品系、年龄、性别、环境温度、湿度、热应激持续时间、取样时间点 阅读提示:Materials and methods: Animal models; Figure 2 legend |
| 血小板功能验证 | 血小板纯化方法、药物处理浓度和时间、热应激条件、共培养细胞类型 阅读提示:Materials and methods: Platelet purification and treatment; Simulated HS model in vitro; Figure 2 legend |
| RNA-seq分析 | 血小板收集时间点、RNA提取方法、测序平台、生物信息学分析流程 阅读提示:Materials and methods: RNA-seq and bioinformatic analysis; Figure 3 legend |
| 基因操作 | CKO-Tfr1小鼠构建方法、AAV9病毒注射剂量、基因敲低或过表达验证 阅读提示:Materials and methods: Animal models; Cell culture and stable cell line establishment |
| 铁死亡检测 | 铁代谢指标(总铁、Fe2+)、脂质过氧化指标(4-HNE、脂质ROS)的检测试剂和方法 阅读提示:Materials and methods: Iron assay; Flow cytometry; ELISA;Figure 3 legend |
| 蛋白棕榈酰化检测 | ABE检测步骤,包括NEM烷基化、羟胺处理、生物素标记等 阅读提示:Materials and methods: Acyl-biotin exchange (ABE) palmitoylation assay; Figure 4 legend |
| 体外细胞模型 | MEG-01细胞培养条件、PLP制备步骤、热应激条件、处理药物 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and stable cell line establishment; Preparation of platelet-like particle (PLP) |