体内药效评价
评估GNA对CLP诱导的脓毒症小鼠的保护作用
BALB/c小鼠腹腔注射GNA(0.5、1、2 mg/kg/day)连续3天,第4天行CLP手术,术后4小时追加2 mg/kg,12小时后取血和组织检测。另设生存实验观察48小时存活率。
Gambogenic acid ameliorates inflammation by inhibiting HK1-mediated Warburg effect and NLRP3 inflammasome activation in sepsis
涵盖体外巨噬细胞实验、体内CLP小鼠模型、ABPP靶点鉴定、CETSA/BLI/突变验证及siRNA功能敲低实验,多层次验证靶点和机制。
LPS刺激的RAW264.7巨噬细胞 CLP诱导的脓毒症小鼠模型(BALB/c)
GNA剂量:体外1 μmol/L,体内0.5、1、2 mg/kg/day CLP手术:18号针头穿刺盲肠,术前3天给药,术后4小时追加 靶点结合:Cys684残基突变(C684A)后结合亲和力显著降低 细胞处理:LPS刺激时间(12h或24h)和GNA预处理时间(1h或2h) siRNA敲低:三种siHK1序列验证
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估GNA对CLP诱导的脓毒症小鼠的保护作用
BALB/c小鼠腹腔注射GNA(0.5、1、2 mg/kg/day)连续3天,第4天行CLP手术,术后4小时追加2 mg/kg,12小时后取血和组织检测。另设生存实验观察48小时存活率。
检测GNA对LPS刺激的RAW264.7细胞炎症因子释放的影响
RAW264.7细胞先用GNA预处理1小时,再加入LPS刺激24小时,收集上清检测NO、TNF-α、IL-6、IL-1β,并用RT-qPCR检测mRNA水平。
鉴定GNA在细胞内的直接靶蛋白
使用ABPP策略,LPS刺激的RAW264.7细胞裂解液与GNA(500 μmol/L)孵育后,用DBIA探针标记,链霉亲和素富集,胰酶消化,TMT标记,LC-MS/MS分析差异蛋白。
验证GNA与HK1的直接结合及结合位点
通过CETSA、pull-down、免疫荧光共定位、分子对接、BLI和C684A突变实验验证GNA与HK1的结合。
验证HK1在GNA抗炎作用中的关键角色
用siRNA敲低HK1,检测Warburg效应(ECAR, 乳酸)和NLRP3炎症小体激活(蛋白和mRNA)及炎症因子释放。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 三溴乙醇 | AibeiBio | M2920 |
| 藤黄酸 | ChromaBio | CHB-X-130 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Beyotime | C0038 |
| 细胞实验 | 脂多糖 | Meilunbio | MB5198 |
| 代谢物检测 | 乳酸检测试剂盒 | Solarbio | BC2235 |
| 细胞因子检测 | TNF-α ELISA试剂盒 | Mlbio | ml002095 |
| IL-6 ELISA试剂盒 | Mlbio | ml063159 | |
| IL-1β ELISA试剂盒 | Mlbio | ml098416 | |
| NO检测 | NO检测试剂盒 | Biorigin | BN27106 |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | CWbio | CW0014S |
| PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 | |
| 增强化学发光试剂盒 | Meilunbio | MA0186-2 | |
| RT-qPCR | RNA提取试剂盒 | TransGen Biotech | ET111-01 |
| cDNA合成试剂盒 | TransGen Biotech | AT311-02 | |
| SYBR Green荧光染料 | -- | -- | |
| QuantStudio 5实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| ABPP | IAA-yne探针 | -- | -- |
| DBIA探针 | -- | -- | |
| TMT标记试剂 | -- | -- | |
| EPPS缓冲液 | Biorigin | BN24148 | |
| 链霉亲和素磁珠 | -- | -- | |
| Orbitrap Fusion Lumos质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Easy-nLC1000液相色谱系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| CETSA | PCR热循环仪 | Applied Biosystems | -- |
| 免疫荧光 | 4孔玻璃底培养皿 | Cellvis | D35C4-20-1-N |
| 酶活测定 | 己糖激酶活性检测试剂盒 | -- | -- |
| 2-脱氧葡萄糖 | -- | -- | |
| 多功能酶标仪 | PerkinElmer | -- | |
| Seahorse实验 | Seahorse XFe细胞外通量分析仪 | Seahorse Bioscience | -- |
| 线粒体压力测试试剂盒 | Agilent Technologies | 103673-100 | |
| 糖酵解压力测试试剂盒 | Agilent Technologies | 103020-100 | |
| 重组蛋白表达 | 异丙基-β-D-硫代半乳糖苷 | -- | -- |
| Ni-NTA磁珠 | Smart-Lifesciences | SA004100 | |
| BLI | Ni-NTA生物传感器 | Sartorius | 18-5101 |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher | 11668019 |
| 线粒体分离 | 线粒体分离试剂盒 | Beyotime | C3601 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物实验 | 小鼠品系、周龄、性别、GNA剂量、给药时间、CLP手术细节、组间n数 阅读提示:Methods 2.1 Mice experiment |
| 细胞实验 | 细胞系、培养条件、LPS刺激浓度和时间、GNA处理浓度和时间 阅读提示:Methods 2.4 Cell experiment 和 3.2 Results |
| ABPP靶点鉴定 | GNA浓度、DBIA探针浓度、TMT标记条件、质谱参数、数据分析参数 阅读提示:Methods 2.9 ABPP-based target identification |
| 结合验证 | GNA浓度、温度梯度、突变位点、BLI实验条件 阅读提示:Methods 2.10 CETSA, 2.16 BLI, 3.5 Results |
| 功能验证 | siRNA序列、转染条件、检测时间点 阅读提示:Methods 2.17 RNA interference 和 3.7 Results |