临床样本中circCCDC719-13的表达分析
检测前列腺癌组织和癌旁组织中TAMs以及原发灶和转移灶中巨噬细胞内circCCDC719-13的表达差异。
收集32例前列腺癌患者的癌组织和癌旁组织,分离TAMs,通过RT-qPCR检测circCCDC719-13表达,并比较原发灶和骨转移灶中巨噬细胞的表达。
Regulation of macrophage plasticity by circCCDC7 19-13 through HSP90 inhibition suppresses prostate cancer progression and metastasis: a translational study
文献包含临床样本表达分析、体外细胞功能实验(极化、迁移、侵袭)、机制验证(Co-IP、质谱、泛素化)以及体内淋巴结转移模型等多个独立证据层级,并明确进行了功能验证和机制验证。
RAW264.7巨噬细胞 THP-1巨噬细胞 原代巨噬细胞(PMs)与PC3M共培养的TAM模型 BALB/c裸鼠腘窝淋巴结转移模型
TAMs与PMs的分离方法(CD14磁珠分选)及样本来源 circCCDC719-13过表达慢病毒转染TAMs的MOI(50)及筛选条件(嘌呤霉素5 μg/mL,7天) M1/M2极化诱导条件(IFN-γ 20 ng/mL + LPS 500 ng/mL;IL-4 20 ng/mL + IL-13 20 ng/mL,处理48小时) 体外共培养实验的细胞比例和时长(PMs与PC3M共培养2天;Transwell侵袭实验共培养36小时) 体内实验中TAMs与PC3M细胞注射比例(4:1)及观察时间(24天)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测前列腺癌组织和癌旁组织中TAMs以及原发灶和转移灶中巨噬细胞内circCCDC719-13的表达差异。
收集32例前列腺癌患者的癌组织和癌旁组织,分离TAMs,通过RT-qPCR检测circCCDC719-13表达,并比较原发灶和骨转移灶中巨噬细胞的表达。
验证circCCDC719-13在M1和M2巨噬细胞中的表达变化。
使用LPS/IFN-γ诱导M0巨噬细胞向M1极化,使用IL-4/IL-13诱导向M2极化,通过RT-qPCR检测circCCDC719-13表达。
评估circCCDC719-13过表达对TAMs表型及细胞因子分泌的影响。
用circCCDC719-13过表达慢病毒转染TAMs,通过流式细胞术和免疫荧光检测CD86/CD163表达,通过RT-qPCR、Western blot和ELISA检测M1/M2细胞因子水平。
验证circCCDC719-13过表达的TAMs对前列腺癌细胞侵袭、迁移和EMT的影响。
将过表达circCCDC719-13的TAMs与PC3M细胞共培养,进行Transwell侵袭实验、划痕实验,并检测EMT标志物表达。
探究circCCDC719-13是否通过诱导铁死亡影响TAM极化。
检测TAMs中ROS、Fe2+、脂质过氧化、GSH水平及线粒体形态,并使用Ferrostatin-1(Fer-1)验证铁死亡参与。
确定circCCDC719-13的相互作用蛋白及下游靶点。
通过Co-IP、银染和质谱鉴定与circCCDC719-13结合的蛋白,并验证HSP90为下游靶点,检测HSP90表达及泛素化水平。
验证HSP90是否介导circCCDC719-13对TAM极化和铁死亡的影响。
在TAMs中过表达HSP90或使用HSP90抑制剂(HSP90-IN-10),检测极化标志物、铁死亡指标及细胞因子分泌。
评估circCCDC719-13过表达的TAMs在体内对前列腺癌生长和淋巴结转移的影响。
将过表达circCCDC719-13的TAMs与PC3M细胞混合注射到裸鼠足垫,建立腘窝淋巴结转移模型,观察肿瘤生长和转移,并进行组织学分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞分离 | Ficoll-Hypaque分离液 | -- | -- |
| D14磁珠 | BioLegend | 480026 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| RPMI-1640培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | ExCellBio | FSP500 | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140122 | |
| 极化诱导 | 佛波醇12-豆蔻酸酯13-乙酸酯 | Solarbio | -- |
| 干扰素-γ | MedChemExpress | -- | |
| 脂多糖 | Beyotime | -- | |
| 白细胞介素-4 | Beyotime | -- | |
| 白细胞介素-13 | PeproTech | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | -- | -- |
| RT-qPCR | HiScript II一步法qRT试剂盒 | -- | -- |
| SYBR qPCR预混液 | -- | -- | |
| ABI定量PCR仪 | ABI | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| Pierce BCA蛋白检测试剂盒 | Pierce | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 流式细胞术 | CD86抗体(FITC标记) | Elabscience | -- |
| CD163抗体(BV421标记) | Elabscience | -- | |
| 侵袭实验 | Matrigel基质胶 | BD Biosciences | -- |
| 结晶紫 | Solarbio | C8470 | |
| 显微镜 | CX33显微镜 | Olympus | -- |
| ROS检测 | DCFH-DA探针 | -- | -- |
| 流式细胞仪 | CytoFLEX S流式细胞仪 | Beckman | -- |
| 铁死亡检测 | Phen Green SK染料 | GLPBIO | GC40243 |
| C11 BODIPY 581/591染料 | GLPBIO | -- | |
| ELISA | ELISA试剂盒 | MEIMIAN | MM-51283H2/MM-0091H2 |
| GSH检测 | GSH标准曲线 | Abbkine | KTB1600-48T |
| 铁离子检测 | 铁标准曲线 | Leagene | TC1016 |
| 转染 | 携带circCCDC719-13的慢病毒载体 | Beijing Tsingke Biotechnology | -- |
| 携带HSP90的慢病毒载体 | Beijing Tsingke Biotechnology | -- | |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| 体内实验 | BALB/c裸鼠 | -- | -- |
| 免疫组化 | DAKO EnVision检测系统 | Dako | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本处理与巨噬细胞分离 | 患者样本量(32例)、组织来源(癌组织及癌旁组织)、分离方法(Ficoll-Hypaque离心、CD14磁珠分选)、细胞密度调整(1×10^7 cells/mL) 阅读提示:Materials and methods - Clinical samples and isolation of primary macrophages |
| 巨噬细胞极化诱导 | M1极化条件(IFN-γ 20 ng/mL + LPS 500 ng/mL,48小时),M2极化条件(IL-4 20 ng/mL + IL-13 20 ng/mL,48小时),所用细胞系(RAW264.7、THP-1) 阅读提示:Materials and methods - Induction of macrophage polarization |
| TAMs生成与circCCDC719-13过表达 | TAMs生成方法(PMs与PC3M共培养48小时)、慢病毒MOI(50)、嘌呤霉素筛选浓度(5 μg/mL)及时间(7天) 阅读提示:Materials and methods - Cell lines and cell culture, Plasmids and transfection |
| 体外功能实验 | Transwell侵袭实验参数(细胞密度2×10^3、下室TAMs浓度2×10^5/mL、共培养时间36小时)、划痕实验观察时间点(0h和48h) 阅读提示:Materials and methods - Cell invasion assay, Wound healing assays |
| 铁死亡检测 | ROS检测探针浓度(DCFH-DA 5 μM)、Phen Green SK浓度(10 μM)、C11 BODIPY浓度(2 μM)、GSH检测细胞数(5×10^5)、Fe2+检测细胞数(2×10^6) 阅读提示:Materials and methods - ROS assay, Phen Green SK assay, C11 BODIPY assay, Intracellular glutathione (GSH) detection assay, Colorimetric assay for measurement of intracellular ferrous iron levels |
| 体内转移模型 | 动物品系(BALB/c裸鼠)、细胞注射比例(TAMs:PC3M = 4:1)、注射部位(足垫)、观察时间(24天)、样本量(n=5/组) 阅读提示:Materials and methods - In vivo popliteal LN metastasis and tumorigenesis assays |