患者入组与基线评估
筛选符合条件BRPC患者并收集基线临床病理信息。
根据纳入排除标准筛选患者,采集活检样本,记录年龄、性别、TNM分期、肿瘤直径等基线数据。
Clinical efficacy and chemoresistance analysis of precision neoadjuvant chemotherapy for borderline resectable pancreatic cancer: a prospective, single-arm pilot study
研究包含PDO药物敏感性检测、NAC疗效评估及scRNA-seq机制分析,但为单臂初步研究,样本量有限,缺乏随机对照。
患者源性类器官(PDOs) 临界可切除胰腺癌患者队列(19例)
PDO培养成功率(87.0%)及药物敏感性检测的抑制率≥50%为敏感标准 NAC方案调整依据(初始GnP方案,1周期后依据PDO药敏调整) R0切除定义及评估方法(RECIST 1.1和改良Ryan评分) scRNA-seq分析中非整倍体细胞鉴定方法(copyKAT)及耐药基因表达变化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
筛选符合条件BRPC患者并收集基线临床病理信息。
根据纳入排除标准筛选患者,采集活检样本,记录年龄、性别、TNM分期、肿瘤直径等基线数据。
建立患者源性类器官模型,并评估其对化疗药物的敏感性以指导治疗。
利用活检组织进行PDO培养,进行药物敏感性测试,将抑制率≥50%判定为敏感。
根据PDO药敏结果调整NAC方案,评估客观缓解率及手术转化情况。
初始GnP方案一个周期,后根据药敏调整方案;通过CT和RECIST 1.1评估疗效,记录不良事件。
评估新辅助化疗后的手术切除率和病理缓解程度。
对达到手术条件的患者进行胰十二指肠切除术或胰体尾切除术,评估R0/R1切除率及肿瘤退缩分级。
探索吉西他滨耐药的转录组学机制。
对10例患者样本进行单细胞测序,分析导管细胞亚群、非整倍体细胞比例及差异表达基因,并进行细胞通讯分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 类器官培养 | 家必利®组织清洗液 | -- | -- |
| Advanced DMEM/F12培养基 | BasalMedia | L330KJ | |
| Y-27632 | MCE | HY-10071 | |
| I型胶原酶 | Sigma | C0130 | |
| HEPES | Gibco | 15630080 | |
| 青霉素-链霉素-两性霉素B | Solarbio | P7630 | |
| GlutaMAX | Gibco | 35050061 | |
| 胎牛血清 | ExCell Bio | FCS500 | |
| Matrigel基质胶 | Corning | 354234 | |
| 24孔板 | Grenier bio-one | 662160 | |
| 家必利®胰腺癌类器官培养基 | -- | -- | |
| 组织病理 | Dispase II | Gibco | 17105041 |
| Accutase | Gibco | A11105-01 | |
| 药物敏感性检测 | DMEM培养基 | Gibco | C11995500BT |
| CellTiter-Glo 2.0试剂盒 | Promega | G9243 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| PDO培养与药物敏感性检测 | PDO培养成功率高,药物敏感性检测阈值(抑制率≥50%)及药物浓度范围(基于血药浓度上下限)需核对。 阅读提示:Methods: Organoid culture 和 Drug sensitivity testing |
| 新辅助化疗方案 | 初始GnP剂量(吉西他滨400-1000mg/m2,白蛋白紫杉醇100-160mg/m2)及后续调整依据(PDO药敏结果) 阅读提示:Methods: Treatment |
| 疗效评估 | RECIST 1.1标准评估缓解率,CT检查时机,肿瘤标志物CA19-9变化 阅读提示:Methods: Treatment 和 Results: NAC outcomes and AEs |
| 手术评估 | R0切除定义及手术时机(NAC后4-6周),TRG评分系统(改良Ryan评分) 阅读提示:Methods: Treatment 和 Endpoints |
| scRNA-seq分析 | 样本选择标准(CA19-9变化及肿瘤退缩情况)、细胞质量控制指标、聚类方法 阅读提示:Methods: scRNA-seq analysis |