基于空间转录组测序的三叉神经痛大鼠三叉神经原位组织图谱研究

In situ tissue profile of rat trigeminal nerve in trigeminal neuralgia using spatial transcriptome sequencing

作者信息Wenbin Wei, Yuemin Liu, Yifen Shen, Tao Yang, Yabing Dong, Zixiang Han, Yiwen Wang, Zhiyang Liu, Ying Chai, Mengjie Zhang, Hanshao Wang, Hao Shen, Yihang Shen, Minjie Chen
PMID38270619
发布时间2024-03-01
DOI10.1097/JS9.0000000000001110

摘要

背景:三叉神经痛(TN)是颌面部区域最常见的神经病理性疾病。尽管存在多种假说,但TN的病因和发病机制至今尚未明确。 目的:本研究旨在探讨TN中不同类型细胞间的相互作用,特别是脱髓鞘对三叉神经节的影响及其内在机制,并识别TN中新的重要靶基因和调控通路。 方法:通过三叉神经根压迫制备TN大鼠模型,分离三叉神经组织进行空间转录组测序。采用主成分分析对基因表达矩阵进行降维,并通过UMAP可视化。使用Metascape进行基因功能注释分析。通过Monocle软件包分析特定细胞簇的进展和发育拟时序。基于加权基因共表达网络分析,对不同组间的基因共表达网络模块进行分析,并分配AddModuleScore值。利用CellPhoneDB分析这些网络中基因通过配体-受体相互作用的细胞间通讯。 结果:结果表明,三叉神经节可通过多种配体-受体相互作用影响施万细胞的脱髓鞘和再髓鞘化反应,而施万细胞对三叉神经节的影响则弱得多。此外,铁死亡可能参与了施万细胞的脱髓鞘过程。 结论:本研究提供了TN的空间转录组学测序数据,揭示了新的标志物,重新定义了神经节与髓鞘之间的关系,为未来的机制研究和药物开发提供了理论基础和支持数据。

实验方法

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