阻断CXCR4+ CD4+ T细胞通过调节Rho-GTPase/NF-κB信号轴重编程Treg介导的免疫抑制

Blocking CXCR4+ CD4+ T cells reprograms Treg-mediated immunosuppression via modulating the Rho-GTPase/NF-κB signaling axis

作者信息Canhui Cao, Miaochun Xu, Ting Peng, Xiaojie Liu, Shitong Lin, Yashi Xu, Tian Chu, Shiyi Liu, Ping Wu, Bai Hu, Wencheng Ding, Li Li, Ding Ma, Peng Wu
PMID40760450
发布时间2025-08-04
DOI10.1186/s13073-025-01515-8

实验完整度

结合单细胞转录组、磷酸化蛋白质组、ChIP-seq、动物模型、患者样本和类器官等多层级证据,包含功能验证和机制验证。

主要模型

U14宫颈癌小鼠模型 4T1乳腺癌小鼠模型 ID8卵巢癌小鼠模型 人宫颈癌类器官与PBMC共培养体系

重点核对

CXCR4拮抗剂BL-8040(Motixafortide)的给药剂量(0.133 mg/kg)和频率(每周三次) Cxcr4flox/flox LckCre条件性敲除小鼠的构建 Treg表型关键标志物(FOXP3、CTLA4、TIGIT、TNFRSF9)的检测 体外Treg刺激实验中人IFN-α的浓度(0, 0.25, 0.5, 1 mg/mL)和培养时间(7天) 类器官共培养系统中Caspase-3凋亡检测的时间点(0h, 24h, 48h)

摘要

背景 虽然临床试验表明CXCR4拮抗剂可以增强癌症免疫治疗的效果,但CXCR4调节肿瘤微环境的分子机制仍然知之甚少。我们最近将CXCR4鉴定为癌症中耗竭性CD8+ T细胞表型的调节因子。在这里,我们研究了其在肿瘤内协调调节性T(Treg)细胞介导的免疫抑制中的作用。 方法 我们对泛癌组织的单细胞RNA-seq数据集进行了荟萃分析,以表征CD4+ T细胞中CXCR4的表达模式。使用CXCR4拮抗剂和条件性敲除小鼠(Cxcr4flox/flox,LckCre),我们在体内抑制了Treg表型。通过宫颈癌小鼠模型的单细胞转录组学和单细胞ATAC-seq、磷酸化蛋白质组学和ChIP-seq分析,我们阐明了CD4+ T细胞中CXCR4阻断如何通过调节Rho-GTPase/NF-κB信号轴来抑制活化Treg表型。我们进一步整合了RNA-seq数据、临床试验数据集(NCT02826486和NCT04516616)和人类类器官模型,以验证CXCR4抑制在增强抗肿瘤免疫治疗中的治疗潜力。 结果 多种癌症中CD4+ T细胞的单细胞转录组学显示,CXCR4表达与Treg细胞发育轨迹相关。药理学和遗传学抑制CXCR4可抑制宫颈癌和乳腺癌中的Treg表型。机制上,磷酸化蛋白质组学和ChIP-seq分析揭示,阻断CXCR4+ CD4+ T细胞通过调节Rho-GTPase/NF-κB信号轴减少了活化Treg表型。单细胞转录组学和多组学分析表明,阻断CXCR4+ CD4+ T细胞通过重编程Treg介导的免疫抑制来促进免疫治疗。此外,临床试验数据和人类宫颈癌类器官证实,阻断CXCR4通过减少Treg表型增强抗肿瘤免疫治疗。 结论 我们的研究强调了CXCR4在通过调节Rho-GTPase/NF-κB信号轴驱动Treg介导的免疫抑制中的关键作用,为将CXCR4阻断剂与T细胞靶向免疫疗法联合使用提供了潜在依据。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
CXCR4如何调节肿瘤微环境中调节性T细胞介导的免疫抑制,以及阻断CXCR4是否能增强抗肿瘤免疫治疗。
核心机制
CXCR4信号通过Rho-GTPase/NF-κB信号轴调节Treg细胞活化表型,CXCR4阻断导致Rho GTPase信号通路磷酸化水平降低,进而抑制NF-κB2(p100)和RelB对Treg标志基因的转录调控。
主要证据
单细胞转录组学揭示了CXCR4与Treg发育轨迹相关;磷酸化蛋白质组学鉴定出Rho GTPase信号通路的变化;ChIP-seq/ChIP-qPCR证实NFKB2和RelB在Treg基因上的结合;动物模型和类器官共培养验证了CXCR4抑制对Treg表型和抗肿瘤免疫的影响。
研究意义
研究揭示了CXCR4在驱动Treg介导的免疫抑制中的关键作用,为CXCR4阻断剂与T细胞靶向免疫疗法联合使用提供了理论依据。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

单细胞转录组分析CXCR4表达模式

分析CD4+ T细胞中CXCR4的表达特征及其与Treg细胞发育轨迹的关系。

分析人类结肠癌、肺腺癌、非小细胞肺癌等多癌种单细胞RNA-seq数据,聚类并注释CD4+ T细胞亚群,分析CXCR4表达与Treg比例的相关性。

2

体内药理学和遗传学抑制CXCR4

验证CXCR4阻断对Treg表型和肿瘤生长的影响。

使用CXCR4拮抗剂BL-8040处理荷瘤小鼠(U14、4T1、ID8),并通过Cxcr4条件敲除小鼠(Cxcr4flox/flox LckCre)验证。通过流式细胞术检测肿瘤浸润免疫细胞中Treg标志物和IFN-γ。

3

评估CXCR4阻断与抗PD-1联合治疗的效果

研究CXCR4阻断对PD-1免疫治疗疗效的影响及其对肿瘤微环境中Treg介导免疫抑制的重编程。

建立U14和4T1肿瘤模型,分为对照组、抗PD-1单药、CXCR4拮抗剂单药和联合治疗组,监测肿瘤体积。进行肿瘤再挑战实验,使用CXCR4激动剂NUCC-390验证CXCR4信号在免疫记忆中的作用。利用scRNA-seq、RNA-seq分析肿瘤微环境变化。

4

磷酸化蛋白质组学分析

揭示CXCR4阻断后CD4+ T细胞中信号通路的变化,特别是Rho GTPase信号。

从健康供者PBMCs分选Treg细胞,在CXCR4拮抗剂处理前后进行TMT标记定量磷酸化蛋白质组学分析,鉴定差异磷酸化位点并富集通路。

5

ChIP-seq和ChIP-qPCR验证NF-κB调控

验证NFKB2和RelB对Treg标志基因的转录调控,并检测CXCR4阻断的影响。

使用公开的NFKB2和RelB ChIP-seq数据,分析Treg标志基因的染色质结合。进行ChIP-qPCR验证CXCR4拮抗剂处理后Treg中标记基因结合变化。

6

单细胞多组学分析表观遗传重塑

分析CXCR4缺失对Treg细胞染色质可及性和转录组的影响。

对荷瘤Cxcr4flox/flox LckCre和对照小鼠脾脏进行scRNA-seq和scATAC-seq,分析CD4+ T细胞亚群和Treg标志基因的染色质可及性,进行motif分析和通路富集。

7

临床样本和类器官共培养验证治疗潜力

利用临床试验数据和人体类器官模型验证CXCR4阻断在增强抗肿瘤免疫治疗中的功效。

分析临床试验NCT02826486和NCT04516616的数据,评估CXCR4阻断对外周血Treg和抗肿瘤免疫的影响。建立人宫颈癌类器官与PBMC共培养体系,检测CXCR4拮抗剂对肿瘤细胞凋亡的影响。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
RPMI-1640培养基Gibco11875093
DMEM培养基Gibco11966025
胎牛血清Thermo Fisher ScientificA4766801
青霉素/链霉素ServicebioG4003
基质胶Corning356234
莫替沙福肽MCEHY-P0171
抗PD-1抗体BioXCellBE0146
NUCC-390MCEHY-111793A
重组人IFN-αAbcamab48750
Advanced DMEM/F-12培养基Gibco12634010
胶原酶ISolarbioC8140
分散酶IISolarbioD6430
DNA酶ISolarbioD8071
Y-27632MCEHY-10583
GlutaMax添加剂Gibco35050061
HEPES缓冲液BosterPYG0019
青霉素/链霉素/两性霉素BSolarbioP7630
支原体清除试剂Yeasen40607ES03
SB202190MCEHY-10295
烟酰胺MCEHY-B0150
N-乙酰半胱氨酸MCEHY-B0215
毛喉素MCEHY-15371
B-27添加剂Gibco17504044
A83-01SelleckS7692
重组人Noggin蛋白PeproTech120-10C
重组人RSPO1蛋白NovoproteinCX83
重组人FGF-7蛋白PeproTech100-19
重组人FGF-10蛋白PeproTech100-26
胶原酶IVSolarbioC8160
TrypLE消化液Gibco--
小鼠肿瘤解离试剂盒Miltenyi Biotec130-096-730
ACK裂解液GibcoA1049201
染色缓冲液BD Biosciences4032357
可固定活性染料700BD Biosciences564997
白细胞活化混合物BD Biosciences550583
Cytoflex LX流式细胞仪Beckman Coulter--
CD3阳性分选试剂盒Stemcell100-0692
白细胞介素-2Thermo Fisher ScientificPMC0025
β-巯基乙醇Gibco21985023
T细胞活化/扩增试剂盒Miltenyi Biotec130-093-627
CD4+ CD25+调节性T细胞分选试剂盒Miltenyi Biotec130091301
多重免疫组织化学试剂盒Absinabs50031
DAPI染色液AbbkineBMD0063
PerkinElmer Vectra自动多光谱成像系统PerkinElmer--
EASY-nLC 1200超高效液相色谱系统Thermo Fisher Scientific--
Orbitrap Exploris 480质谱仪Thermo Fisher Scientific--
SuperView 488 Caspase-3底物Yeasen4027ES60
法舒地尔盐酸盐MCEHY-10341
SN52MCEHY-P3229

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
体内CXCR4阻断实验
BL-8040剂量(0.133 mg/kg)、给药频率(每周三次)、给药方式(腹腔注射)、肿瘤模型(U14、4T1、ID8)
阅读提示:Methods: In vivo treatment assay,图2图注
遗传学敲除小鼠实验
小鼠基因型(Cxcr4flox/flox LckCre)、对照(Cxcr4flox/flox)、年龄(6-8周)
阅读提示:Methods: Animal studies and establishment of mouse models,图2H-J图注
体外Treg刺激实验
人IFN-α浓度(0, 0.25, 0.5, 1 mg/mL)、培养时间(7天)、细胞来源(健康供者PBMCs)
阅读提示:Methods: In vitro stimulation of Treg cells
磷酸化蛋白质组学分析
细胞处理(CXCR4拮抗剂)、定量方法(TMT)、质谱平台(Orbitrap Exploris 480)、数据过滤阈值
阅读提示:Methods: Phosphoproteomics experimental procedures and analysis,图4A-C图注
类器官共培养实验
类器官来源(12例初治宫颈癌患者)、共培养比例(1:5)、治疗分组(CXCR4拮抗剂、抗PD-1、抗CTLA-4)、凋亡检测时间点(0h, 24h, 48h)
阅读提示:Methods: Tumor organoid and PBMC co-culture system,Apoptosis detection in organoid co-culture system,图4E-F,图6G-H